LI-COR4300系统的SSR位点分型

技术简介：
SSR(Simple Sequence Repeats)标记是一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术，也称为微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),又称为sequence tagged microsatellite site,简写为STMS，是目前最常用的微卫星标记之一。
SSR是由几个核苷酸（一般为1~6个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。由于每个SSR两侧的序列一般是相对保守的单拷贝序列，因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序，然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增，从而将单个微卫星位点扩增出来。
实验内容：
1.引物设计与合成；
2.目的片段PCR扩增；
3.上机电泳；
4.结果统计。
提供材料：基因组DNA（≥20μl，浓度≥50ng/μl）。需提供目的SSR位点的rs号或该位点上下游各200bp的序列以及突变的类型。
交付结果：
1.完整实验流程报告；
2.LI-COR4300电泳胶图；
3.样品对应SSR位点的基因型（重复序列）。