KAPA人类基因组DNA定量及质检试剂盒

1）准确定量低浓度DNA： qPCR法定量低浓度DNA，结果更准确

上图所示，6个2倍浓度梯度稀释的DNA样品，从2.5ng/µl到0.09ng/µl，分别用NanoDrop、PicoGreen、qPCR法进行定量。结果显示qPCR法的结果更准，均匀性更好。

2）利用Q-比值来评价模板DNA的质量

如上图所示：相同的标准品设置，产生三种标准曲线，扩增高度保守的人类单拷贝数基因，片段长度分别为41bp、129bp、305bp。其中41bp的片段被用来对样本进行绝对定量，而129bp、305bp片段来判断DNA的质量。DNA质量不高会严重影响较长片段的扩增效率，因此可通过Q-129、Q-305与Q-41的比值，来推断样本DNA的质量。通过 “Q-比值”，可以推测模板DNA的质量并预测文库构建和测序的成功概率。

3）通过Q-比值来预测FFPE来源样本文库构建的成功概率

上图：FFPE样本来源DNA的Q-比值与文库构建后产量的关系。样本DNA质量差，直接降低文库扩增的效率，尤其是片段长度稍长的情况下。一般情况下，用较短片段的Q-比值（Q-41）来进行定量，用较长片段的Q-比值（Q-129、Q-305）来判断文库DNA的质量。左图通过Q-比值来推断5个人类FFPE来源DNA样本的质量。这些样本的Q-比值与文库构建（Library Construcion,LC）的质量有非常大的直接关系。(数据来源：Mirna Jarosz和Frank Juhn, Fundation Medicine, Cambridge, MA, USA)。

4）通过Q-比值来推测片段大小和测序的质量

从人类全基因组测序结果中挑选10个人类基因组样本，其尺寸的实际片段大小（~bp）与预测值相比偏小。所有的样本都是通过标准的文库构建流程进行全基因组测序，模板DNA的起始量为100ng。采用Sage Science Pippin Prep选择片段，割胶选择500bp左右。

上图：Q305/Q41的比值由上至下逐渐降低，主要说明：

1.样本DNA打断后，尺寸大小由上至下逐渐降低；

2.测序的文库片段中，小片段的量增多。

既使严格地选择片段尺寸，仍然会有会有很多小片段，这一点通过Q-比值也可以看出，小片段的存在会影响文库质量。

产品优势

1.定量低浓度的样本DNA；

2.质检来源复杂的样本DNA，如FFPE；

3.预测文库构建的成功概率、扩增产量和片段大小。

产品应用

1.福尔马林固定组织样本（FFPE），其DNA损坏程度较重；

2.激光显微切割捕获的样本；

3.提取自流式细胞的DNA；

4.血浆或血清中的游离DNA；

5.其他微量或非常珍贵的临床样本。