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Patharray™机制研究服务——生物信息分析

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  • 吉凯基因通过10多年的努力,建立了一套完整的疾病基因数据库、基因作用网络数据库,在目的细胞中敲减或过表达目的基因后,助您在研究方向上靶向明星通路并且提供后续的研究建议。吉凯基因还提供专业的个性化疾病关键基因功能研究方案,帮助您在科研之路上走的更快更远!
  • 2026年01月08日
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      Patharray™机制研究服务——生物信息分析

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      上海吉凯基因化学技术有限公司

    Patharray™机制研究服务——生物信息分析

    您是否
    • 明确待研基因生物学功能,但对于下游机制研究一筹莫展?
    • 某项科研工作已告一段落,但还想进行更深入的研究?


    吉凯基因Patharray™服务帮助您更好更快的进行深入的机制研究!
    目前主流的研究思路都是从一个待研基因出发,通过寻找明星的通路或者直接作用的明星基因来解释一个临床问题或者提出一个科学假说,那么找到这个明星通路或者明星基因就显得至关重要,吉凯基因通过10多年的努力,建立了一套完整疾病基因数据库、基因作用网络数据库,在目的细胞中敲减或过表达目的基因后,帮助您在所研究方向上靶向明星通路并且提供后续的研究建议。详细产品介绍请点击

    芯片综合产品分析流程

    产品细节图片1

    数据分析样例
    1. 芯片数据QC
    1.1 Signal Histogram
    产品细节图片2
    芯片的信号值分布图。每条信号分布曲线的重合度越好表示芯片实验的可靠性越高。

    1.2 Relative Signal Box Plot
    产品细节图片3
    芯片Normalization后的箱型图,红线是baseline。此图表示了每张芯片数据在进行permutation后的百分位数分布,它们的分布越接近,数据的重复性就越高。

    1.3 Pearson's Correlation (signal)


    产品细节图片4
    芯片的相关系数图,表示所有芯片两两之间的相关程度,本图使用皮尔森相关系数,当系数等于1.0时未完全正相关,相关系数越接近1.0,其相关性越高。

    1.4 PCA


    产品细节图片5
    PCA (Principal Component Analysis), 主成分分析。用来表示每张芯片在组内组间的相似和差异度。

    2. 芯片数据分析
    2.1 有显著差异表现的基因数目
    根据实验设计要求,将差异基因的比较结果以下表呈现,基因表现有显著差异的筛选标准为必须符合丨FC丨要大于2,并且P value值要小于0.05,详细基因表达分析见“数据分析报告”


    项目 比较组 上调基因数 下调基因数
    1 C16_+ vs C16_- 338 58
    备注:


    2.2 火山图


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    2.3 散点图


    产品细节图片7

    2.4 聚类图
    产品细节图片8

    3. PathwayGO分析
    根据筛选出的差异基因,进行Pathway分析和Gene Ontology分析(即GO分析)。
    根据生物学功能的不同,将差异基因进行Pathway Analysis,计算包含多少差异基因,并列式基因名称。

    Pathway分析
    产品细节图片9

    GO分析
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    4. 深入分析
    根据初步分析结果,挑选感兴趣的pathway/gene进行深入分析。

    产品细节图片13
    产品细节图片14


    5.下游基因验证
    产品细节图片15






    上海吉凯基因医学科技股份有限公司
    地址:上海张江高科技园区爱迪生路332号
    邮编:201203
    全国热线:4006210302
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    产品细节图片16

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    • 空间代谢组原理

      质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源性药物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。 质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物

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