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- 墨卓单细胞转录组不含分析
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- 2025年09月25日
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墨卓生物 MobiNova® 高通量单细胞测序技术体系包含两大核心平台：适用于真核生物的 MobiNova®-100 平台与专注原核生物的 MobiNova®-M1 平台。其中，MobiNova®-100 平台配套使用 MobiCube® 系列高通量单细胞建库试剂盒，可同步开展高通量单细胞转录组、VDJ 免疫组库以及表观基因组等多组学研究。MobiNova®-M1 平台专注于高通量单细胞微生物基因组测序，有效突破宏基因组技术局限，首次实现高通量与高分辨率兼具的菌株水平鉴定，创新性地支持菌株间水平基因转移（HGT）分析及宿主 - 噬菌体关联信息解析，为发现未培养微生物新物种提供技术支撑。
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文献和实验案例分析：单细胞测序探索肿瘤细胞对COF介导的光疗适应机制
文章标题：Single-Cell RNA-Sequencing-Aided Covalent Organic Frameworks-Based Microneedle Design Targeting Phototherapy Resistant Tumor Cell
发表杂志：Advanced Functional Materials
影响因子：IF=18.5
发表时间：2024年3月 应用技术：MobiCube®高通量单细胞3'转录组测序（n=5）+验证实验（小鼠模型验证、免疫组化、Elisa等） 研究背景：共价有机框架（COFs）具有良好的光吸收、光稳定性和生物相容性，在光治疗中具有巨大的应用潜力，但肿瘤细胞在初始反应后会产生抗药性，这对彻底根除肿瘤构成了重大挑战。因此深入了解COF介导的光疗后持续存在的肿瘤细胞的分子特性，可以揭示光疗抗性细胞的脆弱性，提高治疗效果。 实验设计： 1）合成具有高效光动力和光热性能的 TCN-PPDA-COF 材料，体外实验验证其对肿瘤细胞的杀伤效果。 2）构建 4T1 和 B16F10 小鼠肿瘤模型，证实 COF-MN 贴片可有效抑制肿瘤生长。 3）对光疗后残留肿瘤组织和未接受治疗肿瘤组织进行scRNA-seq ，鉴定光疗适应肿瘤细胞的易损性 4）设计针对光疗的CA-MN贴片和体内抗肿瘤联合治疗实验验证抗肿瘤治疗效果
Nat Methods 2020 年度技术方法：空间转录组到底是什么，怎么做，怎么用
派」—— 什么是空间转录组？ 品尝一杯果汁，我们可以通过味道判断有橙子、苹果、草莓或者其他类型水果的存在，但我们却无法得知每种水果的具体比例。正如 Nature Methods 在报道中提到的一样：传统的转录组测序就如同制作这样一杯水果冰沙，我们需要把所研究的样本研磨成匀浆。最终得到的是组织细胞中平均的 mRNA 基因表达情况，这种分析会把细胞间的差异屏蔽掉。研究人员无法分辨出某些基因的上调或下调是来自某个细胞亚群还是来自整个细胞群体。随着技术的进步，单细胞测序技术应运而生。该技术最大的革新在于把单个
上皮细胞恶性转化与肿瘤微环境（TME）重塑的共演化，而这一共演化过程对癌症的发生、进展及转移具有关键调控作用。尽管近年来基因组学及单细胞转录组学研究已揭示了 ESCC 中癌细胞突变及细胞异质性的作用，但受限于技术分辨率，单细胞水平的空间互作分析仍存在不足，对肿瘤微环境时空演化的解析尚未充分。本研究通过高分辨率 XeniumInSitu、TF-seqFISH 等空间转录组学技术，绘制 ESCC 发展的单细胞分辨率多阶段空间演化图谱，旨在解析癌相关成纤维细胞-上皮细胞（CAF-Epi）生态位的形成
血液 CD66b+ 中性粒细胞（PMN）和胰腺癌组织 CD45+ 免疫细胞 单细胞捕获平台：BD RhapsodyTM 单细胞实验分组： HC-PMN（健康组）×2；CP-PMN（慢性胰腺炎组）×2；PDAC-PMN 细胞×5；PDAC免疫细胞×5 主要技术手段： 单细胞测序，空间转录组测序，转录组测序，蛋白组、代谢组质谱分析，免疫荧光，免疫组化，pcr（qpcr）分析 单细胞分析工具应用： 细胞聚类分析，subCluster 分析，差异基因表达分析，GO/Pathway 分析，拟时序分析
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