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外泌体浓度怎么算出来的
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外泌体浓度计算方法解析
外泌体浓度的计算是外泌体研究中的关键步骤,其准确性直接影响后续实验结果的可靠性。目前,外泌体浓度的计算主要依赖于定量分析技术,包括纳米颗粒追踪分析(NTA)、动态光散射(DLS)、外泌体dànbáizhì定量(如BCA法)以及高通量测序数据的生物信息学分析。这些方法的核心目标是通过直接或间接手段测定单位体积样品中外泌体的数量或总质量。
纳米颗粒追踪分析(NTA)是目前zuì常用的外泌体浓度计算方法之一。该方法通过激光照射样品中的颗粒,利用布朗运动轨迹计算颗粒的粒径分布和数量浓度。NTA的优势在于能够提供单颗粒水平的分辨率,适用于粒径在30-1000 nm范围内的外泌体。动态光散射(DLS)则通过测量颗粒的散射光波动来估算粒径分布和相对浓度,但其分辨率较低,更适合均一样品的快速筛查。dànbáizhì定量法(如BCA或Bradford法)通过测定外泌体总蛋白含量间接反映浓度,但需注意非外泌体蛋白的干扰。此外,基于测序数据的计算方法(如外泌体RNA定量)可通过生物信息学工具(如DESeq2或edgeR)估算外泌体丰度,但通常需要结合其他实验验证。
外泌体浓度的计算还需考虑样本前处理的影响。例如,超速离心法可能因聚集效应导致浓度被高估,而尺寸排阻色谱(SEC)或聚合物沉淀法则可能引入杂质干扰定量结果。因此,选择合适的方法需综合考虑样本类型、实验目的和技术限制。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定,但核心在于确保数据的准确性和可重复性。
常见问题:
Q1. 如何避免外泌体浓度计算中的聚集效应干扰?
A:可通过优化样本处理流程减少聚集,例如在NTA分析前采用超声处理或过滤(如0.22 μm滤膜),或使用表面活性剂(如Tween-20)分散颗粒。同时,结合动态光散射(DLS)检测多分散指数(PDI)可评估聚集程度。
Q2. 低浓度外泌体样本如何提高定量准确性?
A:对于低浓度样本,可采用超速离心富集外泌体,或使用高灵敏度检测技术(如数字PCR或单分子阵列技术)。此外,选择荧光标记的NTA(如CD63抗体偶联荧光探针)可增强信号特异性,减少背景噪声干扰。
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文献和实验分析报告。 从上图结果可以看出,超离法和试剂盒法得到的外泌体大小差不多,基本在 110-120 nm,颗粒数浓度也相似,在 3*10 的 10 次方 particles/ml 左右。 BCA 蛋白浓度测定结果:将外泌体样本进行 BCA 蛋白浓度测定,结果如下表。 样本名 BCA 浓度(ug/ul) UC-1 0.18 UC-2 0.14 SXX-1 1.60 SXX-2 1.87 UXX-1 2.10 UXX-2 3.10 WB 检测标志物:根据上述的 BCA 定量结果,制备
% 以上时收集细胞上清液。 解决方案 2:采用的是培养基逐步替换的方法。逐步减少原干细胞培养基的用量和逐步增加外泌体专用间充质干细胞培养基的用量,在干细胞融合度 20% 时,吸取一半的原始培养基,加入一半的外泌体专用间充质干细胞培养基,细胞培养 24 小时后,再替换为完全的外泌体专用间充质干细胞培养基的进行培养。 20、关于外泌体红色荧光标记染料(PKH26/PKH67)相关实验注意事项 a、建议用于染料标记的外泌体原始浓度达到 0.5~1μg/μL。外泌体浓度过低实验失败风险较高。 b、外泌体
鉴定。 二、TEM 鉴定外泌体外观: 将提取的外泌体样本置于冰盒中,使用移液枪吸取外泌体样本于铜网上静置 1 min。(用镊子夹铜网要轻,防止铜网夹破)。再将铜网上的外泌体样本吸干,使用移液枪吸取醋酸双氧铀染色液室温染色。随后将染色完成的样本放于灯下烤。样本制好后,观察拍照,保存图片。结果如下: 图一 TEM 鉴定脑组织外泌体形态 从 TEM 结果中可以看出,样本中有典型的外泌体结构,且数量比较多,大小不一。 三、NTA 鉴定外泌体的大小和颗粒浓度
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