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北京百泰派克生物科技有限公司
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磷酸化蛋白比总蛋白大于一
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磷酸化蛋白比总蛋白大于一的生物学意义与研究策略
在蛋白zhìzǔxué研究中,磷酸化蛋白与总蛋白的相对丰度比值(磷酸化蛋白比总蛋白大于一)是一个关键指标,其异常升高往往提示细胞信号通路的显著激活或调控失衡。这一现象常见于肿瘤、神经退行性疾病等病理状态,例如EGFR、HER2等受体làoānsuān激酶的过度磷酸化可导致下游MAPK/ERK通路持续激活。从分子机制来看,磷酸化蛋白比总蛋白大于一可能源于激酶活性上调、磷酸酶抑制或dànbáizhì降解速率改变。技术层面,该比值的准确测定依赖于磷酸化蛋白的特异性富集(如TiO2或IMAC)和高分辨率质谱分析,而总蛋白定量通常采用BCA法或SDS-PAGE考马斯亮蓝染色。值得注意的是,磷酸化蛋白比总蛋白大于一并非juéduì异常,在某些生理过程如细胞周期G2/M期转换时,CDK1的磷酸化水平会短暂超过其总蛋白表达量。
实验设计中,磷酸化蛋白比总蛋白大于一的验证需严格控制样本处理条件。磷酸化修饰极易被蛋白酶或磷酸酶降解,因此需添加磷酸酶抑制剂(如NaF/β-甘油磷酸钠)并采用快速低温裂解。对于低丰度磷酸化蛋白,抗体芯片(如RayBio® Phospho Antibody Array)可提高检测灵敏度,但具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。质谱定量时,同位素标记(如TMT或SILAC)能显著降低技术误差,而数据解析需结合MaxQuant等软件进行磷酸化位点定位(Localization Probability >0.75)。值得注意的是,某些磷酸化蛋白(如tau蛋白在阿尔茨海默病中的Ser396位点)会出现磷酸化水平升高但总蛋白量下降的现象,此时比值计算需校正蛋白降解因素。
在功能验证阶段,磷酸化蛋白比总蛋白大于一的生物学效应可通过突变体构建来确认。例如将磷酸化位点突变为bǐngānsuān(模拟去磷酸化)或gǔānsuān(模拟持续磷酸化),再通过免疫印迹比较野生型与突变体的信号通路活性。单细胞测序技术的应用进一步拓展了这一研究维度,10x Genomics平台可揭示磷酸化蛋白比总蛋白大于一的细胞亚群异质性。对于临床样本,激光显微切割结合LC-MS/MS能实现病灶区域的特异性分析,但需注意福尔马林固定可能引起磷酸化表位遮蔽。
常见问题:
Q1. 磷酸化蛋白比总蛋白大于一是否必然导致功能增益(gain-of-function)?
A:不一定。例如p53蛋白在Ser15位点的过度磷酸化虽增加其稳定性,但若伴随其他位点(如Ser376)去磷酸化,反而会抑制转录活性。磷酸化效应具有位点特异性和上下文依赖性。
Q2. 如何区分磷酸化蛋白比总蛋白大于一是由激酶激活还是磷酸酶失活引起?
A:需结合体外激酶活性检测(使用纯化激酶和底物)与磷酸酶抑制剂处理实验。例如在PP2A抑制剂(如冈田酸)存在下,若比值进一步升高则提示基础磷酸酶活性参与调控。
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文献和实验prince1101 非磷酸化抗体是识别总得蛋白的,比如AKT。 P-AKT和AKT其实只差一些磷酸基,分子量稍大点,以前听别人讲P-AKT和AKT之间有shift,有时候WB是可以做出来的。 用的是梯度胶?分子量在68KD左右。应该怎么样来配胶呢?梯度胶的浓度? 谢谢! prince1101 希望高手能赐教! ourlab 某些 AKT抗体,如cell
大家目前最常用的方法是利用溶液法进行蛋白提取(如 RIPA 裂解液),但是往往会在蛋白质提取中产生两个不同的组分,即 RIPA 可溶性和 RIPA 不可溶性组分。通常 RIPA 不可溶性组分被我们直接丢弃忽略。但是已经有文章证实许多蛋白质存在于被丢弃的 RIPA 不可溶性组分中。也就是说利用溶液法提取的并非是完整的总蛋白,而仅仅是一些可溶性蛋白。溶液法进行提取蛋白时会人工激活 caspase-3 和 caspase-7;还会人工激活某些激酶活性;影响磷酸化研究;影响细胞外基质;影响定量,定性蛋白
shuaibo2008 各位好: 我是新手,马上要提前细胞磷酸化蛋白做western。不知道在干预前细胞还要饥饿吗?饥饿对磷酸化蛋白表达有没有影响?谢谢帮助哦 fangweibin119 shuaibo2008 wrote: 各位好: 我是新手,马上要提前细胞磷酸化蛋白做western。不知道在干预前细胞还要饥饿吗?饥饿对磷酸化蛋白表达有没有影响?谢谢帮助
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