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ecadherin蛋白分子量
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E-cadherin蛋白分子量的生物学特性与研究意义
E-cadherin蛋白分子量约为120 kDa,是一种典型的I型跨膜钙黏附蛋白,在维持上皮细胞间黏附和组织结构完整性中发挥核心作用。该蛋白由CDH1基因编码,其分子量特性直接反映了其复杂的结构域组成:包含一个约100 kDa的胞外域(由五个串联的EC重复结构域构成)、一个约24 kDa的跨膜区以及一个相对较小的约15 kDa的胞内域。值得注意的是,在SDS-PAGE电泳分析中,E-cadherin蛋白分子量常表现为约135 kDa的表观分子量,这种差异主要源于翻译后修饰(如糖基化)导致的迁移率改变。通过质谱jīngquè测定,非糖基化的E-cadherin核心多肽分子量约为88 kDa,而成熟的全长糖蛋白分子量则达到120 kDa左右。
E-cadherin蛋白分子量的jīngquè测定对研究其功能调控至关重要。在肿瘤转移研究中,E-cadherin蛋白分子量的异常变化(如蛋白水解产生的片段)常与上皮-间质转化(EMT)过程相关。蛋白水解酶如ADAM10或基质金属蛋白酶切割E-cadherin胞外域产生的80 kDa可溶性片段(sE-cad),以及膜锚定的38 kDa C端片段(CTF),都是重要的生物学标志物。Western blot分析时,使用针对E-cadherin胞内域的抗体会检测到全长120 kDa蛋白及其CTF片段,而胞外域抗体则可识别全长蛋白和sE-cad片段。
在实验技术层面,准确测定E-cadherin蛋白分子量需要考虑多种因素。样品制备时需使用含钙离子的缓冲液以维持蛋白构象,避免钙缺失导致的蛋白降解。二维电泳结合质谱(2DE-MS)是分析E-cadherin蛋白分子量异质性的金标准,可区分不同磷酸化和糖基化修饰的亚型。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。近年发展的表面等离子共振(SPR)技术不仅能测定分子量,还可实时监测E-cadherin同源二聚体(分子量约240 kDa)的形成动力学。
E-cadherin蛋白分子量的研究对理解多种病理过程具有重要意义。在遗传性弥漫型胃癌(HDGC)中,CDH1基因截短突变常导致分子量显著减小的异常蛋白产物。而在炎症性肠病中,E-cadherin蛋白分子量的改变与屏障功能损伤密切相关。冷冻电镜单颗粒分析揭示,E-cadherin胞外域在钙离子存在下形成严格间距为25 nm的"分子拉链"结构,这种超分子组装体的稳定性直接依赖于单个E-cadherin蛋白分子量的结构完整性。
常见问题:
Q1. 为什么在非还原性SDS-PAGE中E-cadherin蛋白分子量检测结果与理论值存在显著差异?
A:这主要源于E-cadherin含有12个保守的二硫键(主要在EC1-EC2结构域),在非还原条件下维持部分折叠构象,导致电泳迁移率降低。此外,其高度糖基化(约含30%糖链质量)也会增加表观分子量。jīngquè测定需采用还原剂处理并结合糖苷酶消化。
Q2. E-cadherin蛋白分子量在不同物种间是否存在显著变异?
A:哺乳动物E-cadherin蛋白分子量高度保守,人(UniProt P12830)、小鼠(P09803)和大鼠(P10287)均为120 kDa。但低等脊椎动物如斑马鱼存在两种E-cadherin亚型(约115 kDa和125 kDa),而无脊椎动物果蝇的DE-cadherin分子量较大(约175 kDa),因其含有额外的结构域重复。
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个人工作多年以后再回来读博的,所以实验技术什么的从头学起,这其中WB走的弯路最多,现在就和大家聊聊我个人的历程,并交流一下自己的经验。这个经验是我跑一个11KD分子量分泌性蛋白得出的,肯定不会适用于所有情况,但是论坛里面受困于小分子量蛋白WB的朋友还是很多,所以聊胜于无,在此分享一下。我搞得蛋白质是一个11KD的分泌性蛋白,并且是我实验设计中一个重要的指标,最初学习WB技术,受困于二抗不合格一直连内参都做不出来。。。后面改换抗体之后,才相对顺利一点,其他指标也相继出来了。所以抗体真的很重
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