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北京百泰派克生物科技有限公司
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质谱检测糖基化位点
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质谱检测糖基化位点的技术原理与应用进展
dànbáizhì糖基化作为zuì重要的翻译后修饰之一,在细胞识别、信号转导和免疫应答等生物学过程中发挥关键作用。准确鉴定糖基化位点对理解dànbáizhì功能机制和疾病标志物开发具有重要意义。质谱检测糖基化位点凭借其高灵敏度、高分辨率和可规模化分析的特点,已成为糖蛋白zhìzǔxué研究的核心技术。该技术通过测量糖肽的质荷比(m/z)和碎片离子谱图,能够同时解析糖链组成和附着位点信息。现代质谱平台如Orbitrap和Q-TOF的快速发展,使得低丰度糖肽的检测限达到fmol级别,而电子转移解离(ETD)等新型碎裂技术的应用进一步提高了糖基化位点鉴定的准确性。
在实验设计层面,质谱检测糖基化位点通常需要结合前处理步骤优化。糖肽的富集策略包括亲水相互作用色谱(HILIC)、凝集素亲和层析和硼酸化学修饰等方法,可显著提高糖肽的捕获效率。酶解方案多选用Trypsin/Lys-C组合酶切,既能保证肽段长度适合质谱分析,又可保留完整的糖基化修饰信息。值得注意的是,糖链的异质性会显著增加质谱数据的复杂性,因此需要采用PNGase F酶切结合18O标记等策略,通过质量偏移(+2.99 Da)特异性识别天冬酰胺(N-连接糖基化)修饰位点。
数据分析是质谱检测糖基化位点的另一关键环节。基于数据库搜索的软件如Byonic和pGlyco能够解析糖链组成和肽段序列,而深度学习算法(如SweetNet)的引入提升了糖肽鉴定的通量。对于O-连接糖基化位点,电子激活解离(EAD)产生的特征性糖苷键断裂离子(如m/z 204.08对应的HexNAc+)可作为诊断性标志。目前该技术已成功应用于癌症糖基化标志物筛查,例如通过血清IgG的N-糖基化位点变化预测肝细胞癌进展。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
常见问题:
Q1. 如何区分质谱检测糖基化位点中的微异质性(Microheterogeneity)和宏异质性(Macroheterogeneity)?
A:微异质性指同一糖基化位点携带不同糖链结构,需通过高分辨率质谱(如Orbitrap Fusion)解析糖链组成差异;宏异质性反映不同dànbáizhì分子间糖基化位点占据率的差异,需结合非biāojìdìng量(LFQ)或同位素标记(TMT/iTRAQ)进行相对定量分析。
Q2. 质谱检测糖基化位点时如何解决唾液酸易丢失的问题?
A:可采用甲酯化衍生化稳定唾液酸,或在负离子模式下检测带负电的唾液酸残基;另一种方案是使用低碰撞能量(CE<20 eV)的HCD碎裂模式,配合三级质谱(MS3)采集特征性碎片离子。
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文献和实验N-连接的糖基化是一种具有重要生物学意义的翻译后修饰过程,但是现在已经发现的糖基化蛋白并不多。作者在这里采取了一种“滤纸收集样品(filter aided sample preparation,FASP)”的方法,籍此糖基化多肽可以富集于载有凝集素的滤纸上,然后用高精确度的质谱技术从小鼠的四种组织和血浆的2352种蛋白质上发现6367个糖基化位点。其中,涵盖了Swiss-port服务器中已经试验验证的830个糖基化位点中的74%,而另外5753个糖基化位点则是第一次被发现
简介】 N-连接的糖基化是一种具有重要生物学意义的翻译后修饰过程,但是现在已经发现的糖基化蛋白并不多。作者在这里采取了一种”滤纸收集样品(filter aided sample preparation,FASP)“的方法,籍此糖基化多肽可以富集于载有凝集素的滤纸上,然后用高精确度的质谱技术从小鼠的四种组织和血浆的2352种蛋白质上发现6367个糖基化位点。其中,涵盖了Swiss-port服务器中已经试验验证的830个糖基化位点中的74%,而另外5753个糖基化位点则是第一次被发现。 这些位点都带有” N
【求助】P53的翻译后修饰都有哪些? 怎样验证其修饰后与靶标启动子的结合活性的变化?
蛋白质功能的一个主要机制,p53在多个位点上可被磷酸化、顺-反异构化、乙酰化、泛素化、甲基化、糖基化等修饰,从而显示其生物学重要性。这种显示细胞或组织特异性并依赖细胞周期位置的多重修饰,是一种复杂的调节方式,随着细胞对DNA损伤、增殖、老化等产生的细胞信号的反应而发生波动。 磷酸化修饰 P53的磷酸化在多数情况下与蛋白质的稳定性有关。p53 N-末端的三个位点Ser15、Thr18、Ser20磷酸化后,使p53和其主要的负性调节因子MDM2之间的相互作用消失,而和乙
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