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北京百泰派克生物科技有限公司
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蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学
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蛋白zhìzǔxué与磷酸化蛋白zhìzǔxué的技术发展与研究价值
在生命科学研究中,蛋白zhìzǔxué作为系统生物学的重要组成部分,致力于全面分析生物体内dànbáizhì的表达、修饰、相互作用及其动态变化。蛋白zhìzǔxué的研究不仅揭示了细胞在生理或病理状态下的功能调控网络,还为疾病机制探索、生物标志物发现和药物靶点筛选提供了重要依据。而磷酸化蛋白zhìzǔxué作为蛋白zhìzǔxué的重要分支,专注于研究dànbáizhì磷酸化修饰的动态变化及其生物学意义。磷酸化修饰是真核生物中zuì普遍的翻译后修饰之一,参与调控细胞信号转导、代谢、增殖和凋亡等关键生命活动。通过高分辨率质谱技术和生物信息学分析,磷酸化蛋白zhìzǔxué能够系统鉴定磷酸化位点,定量分析修饰水平的变化,从而深入理解dànbáizhì功能调控的分子机制。
蛋白zhìzǔxué研究通常基于质谱技术,包括液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)和基于标记(如TMT、iTRAQ)或非标记(如Label-free)的定量策略。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。近年来,高灵敏度质谱仪(如Orbitrap系列)和深度覆盖的dànbáizhì数据库大幅提升了蛋白zhìzǔxué的鉴定深度和定量准确性。磷酸化蛋白zhìzǔxué则在此基础上结合了磷酸化肽段富集技术(如TiO2、IMAC),以提高低丰度磷酸化修饰的检测效率。此外,磷酸化位点的功能解析通常需要结合激酶抑制剂处理或基因编辑技术(如CRISPR-Cas9),以验证特定磷酸化事件在信号通路中的作用。
在疾病研究中,蛋白zhìzǔxué和磷酸化蛋白zhìzǔxué已广泛应用于癌症、神经退行性疾病和免疫紊乱等领域。例如,通过比较肿瘤组织与正常组织的dànbáizhì组差异,可发现潜在的驱动突变或异常激活的信号通路。磷酸化蛋白zhìzǔxué则进一步揭示了激酶-底物网络的失调机制,为靶向治疗提供理论支持。在基础研究中,这两种技术也被用于解析细胞周期、应激响应和发育分化等过程的动态调控。
常见问题:
Q1. 磷酸化蛋白zhìzǔxué中如何区分功能性磷酸化位点与随机背景修饰?
A:功能性磷酸化位点通常具有进化保守性,且在特定生理条件下表现出动态变化。可通过激酶-底物预测工具(如NetPhos、PhosphoSitePlus)结合突变实验(如bǐngānsuān替代)验证其生物学意义。
Q2. 蛋白zhìzǔxué数据分析中如何解决高丰度蛋白对低丰度蛋白信号的掩盖问题?
A:可采用预分级策略(如SDS-PAGE分离或高pH反相色谱分段)降低样本复杂度,或使用抗体耗竭(如去除血清白蛋白、IgG)提高低丰度蛋白的检测灵敏度。
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文献和实验,而已发表的文献中这两类样本都有使用。具体选什么,可以根据客户实际情况,或者参考这个疾病研究领域更多人选择哪个类型的样本进行选择。需要提醒的是,客户的一个研究,从蛋白组学检测到验证,尽量保持样本类型的一致性。 6、外泌体可以做蛋白质组学的哪些项目? 外泌体样本可以做 4D label free、DIA(DIA 2.0 和大样本 4D-DIA)和 4D 磷酸化蛋白质组学。由于外泌体抽提得到的蛋白量相对较少,除非客户特别要求且蛋白量充足,否则小样本量的时候,都建议优先推荐 4D label free
University, Research Dr., C118 LSRC, Durham, NC 27710. Phone: (919) 613-8606. Fax: (919) 668-0977. E-mail: hayst001@mc.duke.edu . REFERENCES 蛋白质组相关设备及试剂: 液相HPLC系统 | 毛细管LC系统 | 气相色谱系统 | 自动固相萃取系统 | 联用色谱系统 | 更多... (a) Triple quadrupole. Triple
备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
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