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北京百泰派克生物科技有限公司
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磷酸化蛋白跑western需要注意什么
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磷酸化蛋白Western blot实验的关键技术要点
磷酸化蛋白Western blot是研究dànbáizhì翻译后修饰的重要技术手段,其技术难点主要源于磷酸化修饰的动态性、低丰度以及抗体特异性要求。实验成功的关键在于从样品制备到抗体孵育的全流程优化。在样品处理阶段,必须使用新鲜制备的含有磷酸酶抑制剂的裂解液(如RIPA buffer补充NaF和β-甘油磷酸钠),并保持全程低温操作以维持磷酸化状态。蛋白酶抑制剂混合物需与磷酸酶抑制剂联合使用,具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。电泳环节建议采用10%-12%的Tris-Glycine胶或Bis-Tris预制胶,后者更适合磷酸化蛋白的分离,能减少酸性条件下磷酸基团的水解。
转膜参数需要针对性调整,对于分子量小于20 kDa的磷酸化蛋白推荐使用0.2 μm PVDF膜并结合半干转系统(电流2.5 mA/cm²,时间30分钟),而大于50 kDa的蛋白可采用湿转法(100 V,90分钟)。封闭液的选择直接影响信噪比,5% BSA在室温封闭1小时比脱脂奶粉更能减少非特异性结合,尤其对làoānsuān磷酸化检测至关重要。一抗孵育应使用经过验证的磷酸化特异性抗体,稀释比例需通过预实验确定,典型条件下4℃过夜孵育比室温2小时能提高信号强度3-5倍。值得注意的是,磷酸化蛋白Western blot需要设置严格的对照,包括:①总蛋白抗体对照验证上样量;②非磷酸化抗体对照确认修饰特异性;③磷酸酶处理样品作为阴性对照。
化学发光检测阶段,建议采用超敏ECL底物(如Pierce ECL Plus)并优化曝光时间,因磷酸化信号通常较弱。定量分析时需注意磷酸化水平应标准化至对应总蛋白而非管家蛋白,β-actin不适合作为磷酸化蛋白的内参。数据重复至少3次生物学重复,统计分析推荐使用非参数检验方法。
常见问题:
Q1. 为什么磷酸化信号在重复实验中波动较大?
A:这主要与磷酸化修饰的动态特性相关。需确保:①样品处理时间一致(尤其刺激实验);②立即加入裂解液终止反应;③使用新鲜制备的蛋白酶/磷酸酶抑制剂。建议在实验全程监测磷酸酶活性,可通过添加外源性磷酸酶底物(如pNPP)进行质量控制。
Q2. 如何区分非特异性条带与真实磷酸化信号?
A:可采用三重验证法:①使用两种不同表位的磷酸化抗体交叉验证;②通过siRNA敲低目标蛋白后观察条带消失;③质谱鉴定条带中的磷酸化位点。特别要注意某些磷酸化抗体会识别相同磷酸化基序的不同蛋白,这时需结合分子量预测和IP-WB联用技术确认。
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文献和实验相关专题 在western blot ting 方面,本文绝对是一个新手,目前正准备磷酸化蛋白的Western,急需这方面的实验技术操作步骤和一些注意事项的指导。在网络上搜集整理了一个western blot实验达人的建议,供大家参考。 我做了很久的western blot ,尤其是phospho-抗体,可以算是达人了。我根据自己的经验,对磷酸化蛋白之western blot提出以下建议,供刚入门的同仁参考
【求助】多少数量的细胞可以提磷酸化蛋白做western blot?
dongfangzhizi06 我要做信号通路(ERK和p38),请问多少数量的细胞可以提磷酸化蛋白做western blot检测p-ERK1/2和p-p38?六孔板的一个孔够吗? 谢谢! 民间恺撒 上次我接板时的密度是5×105,提了四个孔的总蛋白,大概浓度在8.5左右。建议6孔板可以使用两个孔叠加在一起,这样蛋白浓度会有所保证。 bianbenjamin 我都是六孔板一个孔做
的well中上样两次(可在相同的gel上,也可在不同的gel),其一压磷酸化蛋白,另一压该蛋白总的表达量(包括磷酸化和未磷酸化的该蛋白),甚至还可跑另一个gel,压内标。但是不建议如此做,因为这样比较时误差还是较大的。12. Strip时一定要注意:membrane一定要完全泡在strip solution中(可用较硬的塑料膜封好),然后要完全浸入水中,使受热均匀。这一点很重要,要不然,随后压出来的总蛋白也好,内标也好就会不均一,无法进行比较。
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