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北京百泰派克生物科技有限公司
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什么是二级质谱图
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二级质谱图解析:分子结构鉴定的核心技术
在质谱分析中,二级质谱图是通过对特定母离子进行选择性碎裂后生成的谱图,能够提供化合物结构的关键信息。其核心原理基于串联质谱技术(MS/MS),首先通过一级质谱筛选目标离子(母离子),随后在碰撞池中通过碰撞诱导解离(CID)、高能碰撞解离(HCD)或电子转移解离(ETD)等方式将母离子碎裂为子离子,zuì终检测并记录这些子离子的质荷比(m/z)及相对丰度。二级质谱图的解析是蛋白zhìzǔxué、代谢组学和药物开发等领域中分子鉴定的基石,尤其在区分同分异构体和解析复杂混合物时具有bùkětìdài的优势。
二级质谱图的生成依赖于仪器的配置和实验设计。常见的平台包括三重四极杆(QqQ)、飞行时间(TOF/TOF)和轨道阱(Orbitrap)质谱仪,不同仪器在分辨率、灵敏度和碎裂效率上存在差异。例如,Orbitrap凭借高分辨率可jīngquè测定子离子质量,而QqQ通过多反应监测(MRM)模式适合定量分析。实验成本因仪器类型和样品复杂度而异,具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
在数据处理层面,二级质谱图需通过zhuānyè软件(如Mascot、MaxQuant)进行匹配和注释。数据库搜索算法将实验谱图与理论谱库比对,通过打分系统评估匹配度。此外,de novo测序技术可直接从二级质谱图推导肽段序列,适用于非模式生物或未知化合物研究。值得注意的是,二级质谱图的质量受前体离子选择窗口、碰撞能量和离子传输效率等因素影响,优化这些参数可显著提升数据可靠性。
常见问题:
Q1. 二级质谱图中出现低丰度子离子是否具有分析价值?
A:低丰度子离子可能反映稀有碎裂途径或特定结构特征。例如,在糖基化修饰分析中,低丰度的糖苷键断裂离子可帮助定位修饰位点。需结合高灵敏度仪器和统计学验证排除噪声干扰。
Q2. 如何通过二级质谱图区分 Leu 和 Ile 等同量异位氨基酸?
A:传统CID谱图难以区分,但采用电子激活解离(EAD)或紫外光解离(UVPD)等新兴技术可生成特征性碎片(如d/w离子),通过侧链特异性断裂实现鉴别。
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文献和实验和理论上的质量数进行质量精度的计算。所以一般来说,控制一级质谱的质量精度就能控制代谢物鉴定的准确度,质量精度越小,误差越小。 同样,我们使用上述内标来计算该内标在质谱检测过程中的一级质谱的质量精度,计算过程如下图所示: 从计算来看,质量精度均在 10ppm 以内。 其一:说明质谱的分辨率达到较为理想的结果; 其二:说明代谢物鉴定的结果可信度较高; MS2:二级质谱: MS2:二级质谱:按照一定的规则进行母离子的选择,再把选择后的母离子进行碰撞打碎后得到的质谱碎片即为该母离子的二级质谱;目前
如何用 Xcalibur 和 Metlin 指认并鉴定代谢物
/z175.11913 (M+H+) 为例,右击选中 Ranges-Filter,选择正离子下 175.12,点击确定,会出现该分子离子峰下的二级质谱,将二级质谱中的碎片离子与数据库 HMDB/Metlin 中的二级碎片进行比对,确定代谢物。6. 下面使用 Metlin 数据库对 m/z175.11913 (M+H+) 的二级碎片进行指认:(1) 点击上面的链接,进入 Metlin 首页,点击 Sign Up,进行注册,注册完成后,在下图方框处登录;(2) 登陆后会出现如下界面,点击
如何用 Xcalibur 和 Metlin 指认并鉴定代谢物 | 实验时间
.11913 (M+H+) 为例,右击选中 Ranges-Filter,选择正离子下 175.12,点击确定,会出现该分子离子峰下的二级质谱,将二级质谱中的碎片离子与数据库 HMDB/Metlin 中的二级碎片进行比对,确定代谢物。6.下面使用 Metlin数据库对 m/z175.11913 (M+H+) 的二级碎片进行指认:(1) 点击上面的链接,进入 Metlin 首页,点击 Sign Up,进行注册,注册完成后,在下图方框处登录;(2) 登陆后会出现如下界面,点击 Simple Search
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