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区分n糖基化与o糖基化的方法
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区分N糖基化与O糖基化的方法
在糖生物学研究中,准确区分N糖基化与O糖基化是解析dànbáizhì翻译后修饰功能的关键步骤。N糖基化是指糖链通过β-N-糖苷键连接在天冬酰胺(Asn)残基的酰胺氮上,通常发生在Asn-X-Ser/Thr(X≠Pro)的保守序列中;而O糖基化则是糖链通过α-O-糖苷键连接在sīānsuān(Ser)或sūānsuān(Thr)残基的羟基上,且无明确序列共识模体。区分两者的方法主要包括化学/酶解分析法、质谱技术、凝集素亲和层析以及特异性抗体检测等。化学/酶解分析法通过糖苷酶(如PNGase F)特异性切割N糖链或O糖链(如O-糖苷酶),结合电泳或色谱技术观察底物迁移变化;质谱技术则通过高分辨率质谱(如LC-MS/MS)解析糖肽的分子量和碎片离子,直接鉴定糖基化位点类型;凝集素亲和层析利用凝集素(如Con A结合高甘露糖型N糖链,Jacalin结合O-GalNAc糖链)对糖链结构的特异性结合能力实现分离;抗体检测则依赖于抗特定糖链表位的单克隆抗体(如抗Tn抗原抗体识别O-GalNAc)。此外,代谢标记技术(如点击化学标记)可通过引入人工糖前体(如Ac4GalNAz)选择性标记O糖基化位点。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
化学/酶解分析法是区分N糖基化与O糖基化的经典手段。PNGase F能高效切除N糖链,而O糖链需通过β-消除反应或O-糖苷酶(如O-Glycosidase)处理。通过比较酶解前后dànbáizhì的分子量变化(SDS-PAGE或MALDI-TOF MS)可明确糖基化类型。质谱技术则提供更高通量和jīngquè度的解决方案。例如,电子转移解离(ETD)或高能碰撞解离(HCD)产生的碎片离子可区分N糖基化(保留Asn上的HexNAc)与O糖基化(保留Ser/Thr上的HexNAc)。凝集素芯片或层析技术适用于糖链组学分析,但需注意交叉反应(如WGA可能同时结合N-乙酰葡糖胺和唾液酸)。
代谢标记技术是近年发展的新方法,通过细胞培养时加入修饰糖前体(如Ac4GalNAz),利用点击化学将shēngwùsù或荧光基团引入O糖链,实现特异性富集和检测。此技术对动态O糖基化研究尤为重要,但需优化标记效率以避免毒性。抗体检测法虽简便,但受限于抗体的覆盖范围和特异性(如抗T抗原抗体无法识别所有O糖型)。
常见问题:
Q1. 如何解决质谱鉴定中N糖基化与O糖基化位点的信号抑制问题?
A:可通过糖肽富集(如亲水相互作用色谱HILIC)或分级分离降低复杂度,结合ETD/HCD互补碎裂模式提高鉴定率。此外,使用糖苷酶预处理(如PNGase F)可优先去除N糖链,减少竞争离子化。
Q2. 凝集素法区分N糖基化与O糖基化时如何避免假阳性?
A:需设置严格的对照实验,包括凝集素抑制剂(如甲基-α-D-甘露糖苷抑制Con A结合)和竞争性洗脱(如乳糖阻断RCA-I结合)。联合质谱验证可进一步排除非特异性结合。
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文献和实验Cancer Cell:曹雪涛院士团队揭示肿瘤相关巨噬细胞中葡萄糖代谢的增加可促进癌症转移
导读 代谢重编程广泛参与宿主与肿瘤之间的相互作用,并可决定肿瘤的进展和预后。长期以来,肿瘤细胞一直被认为是肿瘤微环境(TME)中葡萄糖的主要消耗者,在有氧糖酵解过程中产生乳酸。其中,髓系细胞,特别是肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),在 TME 中消耗最多的葡萄糖,这表明巨噬细胞代谢需要更多葡萄糖的利用。 己糖胺生物合成途径(HBP)是糖代谢的主要途径,可合成核苷酸糖 UDP-GlcNAc,随后用于调节营养感知和应激反应的细胞内蛋白质的翻译后修饰——O-GlcNAc 糖基化修饰(O
表达的N糖基化是可以预测的,有如下序列:N X S/T就是潜在的糖基化位点,X为任意氨基酸,1个糖基化位点会加上1-3KD左右的糖基。另外可能还有O糖基化话,但是无法预测其位点,不过很少听说表达蛋白有O糖基化的。如果胞内表达,不存在糖基化的问题。 10、表型与表达 重组SalI和BglII酶切产生单交换和双交换,结果就是产生Mut+和Muts表型的菌株;前者在甲醇诱导表达时生长快,消耗的甲醇多,后者生长慢,消耗的甲醇少,所以诱导表达时Muts表型要求更高的菌体
= 合并洗脱馏分,L = 非富集总细胞提取物。2、Glycosylation:蛋白质糖基化是蛋白质翻译后的主要修饰之一,对蛋白质的折叠、构象、分布、稳定性和活性都有重要影响。糖基化包含了从核转录因子的简单单糖修饰到细胞表面受体的高度复杂分支多糖变化的蛋白质的糖部分添加的多种选择。以天冬氨酸连接(N-连接)或丝氨酸/苏氨酸连接(O-连接)寡糖形式存在的碳水化合物是许多细胞表面和分泌蛋白的主要结构成分。图示:糖基化的类型。糖肽键可根据连接的糖肽键和寡糖的性质分为特定的几类,包括 N-、O-和 C-连接糖基化
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