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北京百泰派克生物科技有限公司
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组蛋白泛素化修饰需要的酶
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组蛋白泛素化修饰需要的酶
组蛋白泛素化修饰是一种关键的翻译后修饰过程,通过将泛素分子共价连接到组蛋白的特定氨基酸残基上,调控染色质结构和基因表达。这一过程依赖于一系列高度特异的酶系统,主要包括泛素激活酶(E1)、泛素结合酶(E2)和泛素连接酶(E3)。E1酶负责激活泛素分子,形成高能硫酯键;E2酶作为泛素载体,将泛素从E1转移到E3酶或直接传递给底物;E3酶则决定底物特异性,确保泛素分子jīngquè地连接到目标组蛋白上。在组蛋白泛素化修饰中,E3连接酶尤为重要,例如RING1B/BMI1复合物(PRC1核心组分)介导H2AK119ub1修饰,而RNF20/RNF40复合物则催化H2BK120ub1修饰。此外,去泛素化酶(DUBs)如USP22和BAP1可逆转这一修饰,形成动态调控网络。组蛋白泛素化修饰需要的酶的活性受多种因素影响,包括细胞周期、DNA损伤信号及代谢状态,其异常与癌症、神经退行性疾病等密切相关。研究这些酶的分子机制通常涉及体外泛素化实验、质谱分析和ChIP-seq等技术,具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
组蛋白泛素化修饰需要的酶的功能研究常采用基因敲除或RNA干扰技术。例如,敲除E3连接酶RNF20会导致H2BK120ub1水平下降,进而影响转录延伸和mRNA加工。此外,基于CRISPR-Cas9的基因编辑技术可构建特定酶突变的细胞系,用于分析组蛋白泛素化修饰需要的酶在表观遗传调控中的作用。近年来,化学探针如Ub-AMC被开发用于实时监测去泛素化酶活性,为药物靶点筛选提供工具。
在结构生物学领域,冷冻电镜和X射线晶体学揭示了组蛋白泛素化修饰需要的酶的三维构象。例如,RING结构域介导E2-E3相互作用,而HECT型E3酶则通过保守的半guāngānsuān残基形成泛素-硫酯中间体。这些结构信息为设计小分子抑制剂(如MLN4924靶向NEDD8激活酶)奠定基础。值得注意的是,某些病毒蛋白可劫持宿主泛素化系统,如HPV E6通过招募E6AP(E3酶)促进p53降解,凸显了组蛋白泛素化修饰需要的酶的病理意义。
常见问题:
Q1. 如何区分组蛋白泛素化修饰需要的酶中RING型和HECT型E3连接酶的催化机制?
A:RING型E3酶(如RNF20)作为支架直接促进泛素从E2转移到底物,不形成共价中间体;而HECT型E3酶(如E6AP)需通过C端保守半guāngānsuān接收泛素,形成E3~Ub硫酯键后再传递至底物。
Q2. 组蛋白泛素化修饰需要的酶在DNA损伤修复中如何被调控?
A:DNA双链断裂可激活ATM/ATR激酶,磷酸化E3酶如RNF8,促进其招募至损伤位点,进而泛素化H2AX(γH2AX-Ub),形成修复因子(如53BP1)的招募平台。
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文献和实验复制相关,组蛋白的去乙酰化和基因的失活相关。组蛋白乙酰化是一个动态过程,乙酰化和去乙酰化处于动态平衡状态。 乙酰化转移酶(histoneacetyltransferases,HAT)主要是在组蛋白 H3、H4 的 N 端尾上的赖氨酸加上乙酰基,去乙酰化酶(histonedeacetylase,HDAC)则相反,不同位置的修饰均需要特定的酶来完成。乙酰化酶家族可作为辅激活因子调控转录,调节细胞周期,参与 DNA 损伤修复,还可作为 DNA 结合蛋白。去乙酰化酶家族则和染色体易位、转录调控、基因
去乙酰化酶 (HDAC) 酶是共抑制因子,通过降低赖氨酸乙酰化水平和增加染色体凝聚而逆转乙酰化的作用。Sirtuins(沉默信息调节因子)是一组 NAD 依赖性去乙酰化酶,靶向组蛋白。顾名思义,它们通过低乙酰化组蛋白维持基因沉默,据报道有助于维持基因组稳定性。而乙酰化最早是在组蛋白中检测到的,胞浆蛋白也被报道是乙酰化的,因此乙酰化似乎在细胞生物学中发挥着比单纯的转录调控更大的作用。此外,乙酰化修饰和其他翻译后修饰,包括磷酸化、泛素化和甲基化之间的串扰,可以改变乙酰化蛋白的生物学功能。可通过使用乙酰赖氨酸特异性抗体
。最常见的形式是 H2A 上 K119 和 H2B 上 K123(酵母)/K120(脊椎动物)的单泛素化。H2A 单泛素化与基因沉默有关,而 H2B 与转录激活有关。 多聚泛素化较少见,但在 DNA 修复中也很重要。H2A 和 H2AX 在 K63 上的多聚泛素化为 DNA 修 复蛋白(如 RAP80)提供了一个识别位点。 酶调节 与其他组蛋白修饰一样,H2A 和 H2B 的单泛素化具有可逆性,并受到组蛋白泛素连接酶和去泛素化 酶的严密调控。 单泛素化 H2A:多梳蛋白家族 H2
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