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olink蛋白质组学是什么
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Olinkdànbáizhì组学在现代生物医学研究中的应用与原理
Olinkdànbáizhì组学是基于邻位延伸分析技术(Proximity Extension Assay, PEA)的高通量dànbáizhì检测平台,由瑞典Olink Proteomics公司开发。这一技术通过dútè的DNA编码抗体对实现超灵敏dànbáizhì定量,可在1-6μL微量样本中同时检测上千种dànbáizhì标志物,检测下限达fg/mL级别。与传统ELISA或质谱技术相比,Olinkdànbáizhì组学具有显著的技术优势:其PEA技术通过配对抗体识别目标蛋白后产生特异性DNA条形码,经PCR扩增后通过高通量测序或微流控芯片定量,避免了交叉反应并实现多重检测。目前提供三大检测面板:Inflammation(92种炎症相关蛋白)、Oncology(92种肿瘤标志物)和Cardiometabolic(92种心血管代谢蛋白),以及可定制化的Explore 1536面板。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
Olinkdànbáizhì组学的核心技术在于其双抗体识别系统。每对匹配抗体分别标记有dútè的单链DNA序列,只有当两个抗体同时结合目标蛋白表位时,DNA序列才会通过连接酶作用形成可扩增的模板。这种设计使检测特异性比传统免疫检测提高10-100倍,同时动态范围可达10个数量级。实验流程包括样品制备(血清/血浆/细胞上清)、抗体孵育(1小时)、DNA模板形成(1小时)、qPCR或微流控定量(2小时),全程可在96或384孔板中完成。数据分析采用zhuānlì化的归一化算法,通过内部质控和外部参照校正技术变异。
在生物标志物发现领域,Olinkdànbáizhì组学已展现出dútè价值。2019年Nature Communications发表的研究利用Olink平台在35,000人队列中鉴定出85个与心血管疾病相关的蛋白标志物。技术的高灵敏度特别适合检测低丰度细胞因子和生长因子,如IL-6的检测限为0.15pg/mL,远低于常规ELISA的3-5pg/mL。2021年Science Translational Medicine报道的COVID-19研究通过Olinkdànbáizhì组学发现重症患者tèyǒu的蛋白特征谱,为疾病分型提供了分子依据。样本消耗量极小(1μL血浆可检测92种蛋白)的特点,使其在珍贵临床样本研究中具有bùkětìdài性。
质量控制系统是Olinkdànbáizhì组学可靠性的重要保障。每个检测批次包含三种质控:孵育控制(监测抗体结合效率)、延伸控制(评估DNA连接效果)和检测控制(验证PCR扩增效能)。数据输出采用归一化蛋白表达值(NPX),经过对数转换后便于统计分析。平台间变异系数(CV)控制在15%以内,批次效应通过ComBat算法校正。zuìxīn发布的Olink Explore 1536平台将通量提升至每次运行检测1,536种蛋白,覆盖分泌蛋白、膜蛋白和胞内蛋白等多个功能类别。
常见问题:
Q1. Olinkdànbáizhì组学与传统多重免疫检测(如Luminex)在技术原理上有何本质区别?
A:核心区别在于信号生成机制。Luminex依赖荧光编码微球和荧光标记抗体,而Olink通过DNA编码抗体产生可扩增的核酸信号。PEA技术的邻位延伸步骤要求两个抗体在空间上足够接近才能产生信号,这大幅降低了非特异结合。此外,DNA信号的指数扩增特性使Olink灵敏度提高100-1,000倍,且动态范围更宽。
Q2. Olinkdànbáizhì组学数据与转录组数据整合分析时需要注意哪些关键问题?
A:需考虑三个维度的差异:首先,mRNA与蛋白水平的调控存在翻译后修饰和蛋白降解等差异;其次,Olink检测的是分泌蛋白和胞外蛋白,而转录组反映细胞内信号;zuì后,技术灵敏度差异要求采用适当的归一化方法(如ComBat校正批次效应)。建议采用多组学整合工具(如MOFA+)分析协同变化模式。
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文献和实验蛋白质组作为重要的科研技术,广泛应用于科研中,在每年数万篇论文中发挥重要作用。如何利用组学工具快速切入临床科学问题形成科研思路,为我们的研究提速?可参考以下三种研究思路: 6.1、IF 1-3 分文章:蛋白质组学+差异蛋白 蛋白质组学检测 筛选差异蛋白进行表达量验证 分析差异蛋白,对差异蛋白进行 GO 和 KEGG 分析 6.1.1、案例一,影响因子 IF=2.2 iTRAQ-based quantitative proteomics analysis of immune
University, Research Dr., C118 LSRC, Durham, NC 27710. Phone: (919) 613-8606. Fax: (919) 668-0977. E-mail: hayst001@mc.duke.edu . REFERENCES 蛋白质组相关设备及试剂: 液相HPLC系统 | 毛细管LC系统 | 气相色谱系统 | 自动固相萃取系统 | 联用色谱系统 | 更多... (a) Triple quadrupole. Triple
备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
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