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北京百泰派克生物科技有限公司
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蛋白质组学DIA价格
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蛋白zhìzǔxuéDIA价格与技术应用分析
蛋白zhìzǔxuéDIA(Data-Independent Acquisition)技术因其高通量、高覆盖率和可重复性优势,已成为蛋白zhìzǔxué研究的重要工具。蛋白zhìzǔxuéDIA价格受多重因素影响,包括仪器平台(如Orbitrap、TripleTOF)、样本复杂度(如组织、体液)、数据深度(如扫描范围、分段数量)以及后续生信分析需求(如数据库构建、定量算法)。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。从技术层面看,DIA的核心价值在于其摆脱了传统DDA(Data-Dependent Acquisition)的随机采样局限,通过系统性的全扫描模式捕获所有肽段信号,尤其适合大队列样本的纵向比较或临床蛋白zhìzǔxué研究。
蛋白zhìzǔxuéDIA价格差异的另一个关键点在于实验设计。例如,高分辨率质谱(如Orbitrap Exploris 480)的硬件成本较高,但能提供更jīngzhǔn的定量结果;而简化流程(如固定窗口DIA)可能降低费用,但会牺牲部分动态范围。此外,标记(如TMT、iTRAQ)与非标记策略的选择也会显著影响蛋白zhìzǔxuéDIA价格。非标记DIA通常更经济,适用于探索性研究;而标记策略能提高多重样本的并行分析效率,但需额外试剂成本。
在数据解析环节,蛋白zhìzǔxuéDIA价格还关联到软件工具的选择。开源工具(如DIA-NN、Skyline)可降低分析成本,但需要较强的生信支持;商业软件(如Spectronaut、PeakView)则提供标准化流程,适合资源充足的团队。值得注意的是,DIA对谱图库的依赖性较高,构建样本特异性库(如通过DDA预实验)或使用公共库(如Pan-human库)会直接影响数据质量和蛋白zhìzǔxuéDIA价格的合理性。
常见问题:
Q1. 蛋白zhìzǔxuéDIA价格中,如何平衡扫描窗口数量与检测灵敏度?
A:窗口数量增加会提升肽段覆盖度,但可能降低每个窗口的信噪比。建议根据样本复杂度优化窗口设计,如高丰度样本可采用较宽窗口(如25-30 m/z),低丰度样本则需窄窗口(如10-15 m/z)以提高灵敏度。
Q2. 长期存储DIA原始数据是否会产生额外成本?如何优化?
A:DIA原始数据体积庞大(单样本可达10-20 GB),长期存储需考虑云服务或本地服务器的费用。建议采用RAW数据压缩工具(如MS-Numpress)或仅保留处理后文件(如.mzML格式),可节省50%以上存储空间。
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文献和实验,仍依赖于直接对蛋白质的研究来解决。因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究(钱小红,贺福初,2003)。 蛋白质组学研究中常用的技术体系 方法学上,二维凝胶电泳-质谱仍然是目前最流行和可靠的技术平台(Rabilloud et al.,2000)。其一般过程是:细胞或组织样品――样品制备――二维凝胶电泳(2D-PAGE)分离蛋白质――计算机辅助分析 2D-PAGE 图象――对感兴趣的蛋白质进行酶解――质谱分析――数据库检索――蛋白质鉴定――分析
。因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究(钱小红,贺福初,2003)。蛋白质组学研究中常用的技术体系方法学上,二维凝胶电泳-质谱仍然是目前最流行和可靠的技术平台(Rabilloud et al.,2000)。其一般过程是:细胞或组织样品――样品制备――二维凝胶电泳(2D-PAGE)分离蛋白质――计算机辅助分析2D-PAGE图象――对感兴趣的蛋白质进行酶解――质谱分析――数据库检索――蛋白质鉴定――分析蛋白质在细胞与组织中的表达情况。2-D PAGE样品
1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都需要对蛋白质进行鉴定和定量。生物质谱技术的出现和不断成熟为蛋白质差异表达分析提供了更可靠、动态范围更广的研究手段。基于质谱技术,科学家们不断开发出新的定量蛋白质组学方法,来了解细胞、组织或生物
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