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多肽测序方需要多少量
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多肽测序方需要多少量
多肽测序方需要多少量是实验设计中的关键参数,直接影响测序结果的准确性和可靠性。对于质谱(MS)等主流多肽测序技术,样品量通常在皮摩尔(pmol)至纳摩尔(nmol)范围内,具体取决于测序方法、仪器灵敏度及样品复杂度。例如,基于液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)的高灵敏度方法可能仅需1-10 pmol的多肽,而传统的Edman降解法则需要更高量级(50-100 pmol)以确保连续测序的可行性。此外,样品纯度、修饰状态(如磷酸化、糖基化)以及缓冲液成分也会显著影响多肽测序方需要多少量的实际需求。若样品中含有高浓度盐类或去垢剂,可能需额外纯化步骤,从而增加初始样品量。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
在多肽测序方需要多少量的优化中,需权衡检测限与数据完整性。对于低丰度多肽,可通过预富集(如免疫沉淀、固相萃取)或标记技术(如TMT、iTRAQ)提高信号强度,从而降低多肽测序方需要多少量的下限。此外,新兴的纳米级电喷雾质谱(nano-ESI-MS)和微流控芯片技术进一步将需求降至飞摩尔(fmol)水平,尤其适用于临床或单细胞样本。值得注意的是,多肽序列长度也会影响多肽测序方需要多少量:长链多肽可能因电离效率低而需要更高浓度,而短肽(<10个氨基酸)则更易检测。
样品制备是多肽测序方需要多少量的另一核心因素。酶解效率(如yídànbáiméi消化)不全会产生不wánquán片段,增加测序难度,此时需提高初始蛋白量以补偿损失。反之,若采用高纯度合成多肽,多肽测序方需要多少量可显著减少。此外,质谱仪的分辨率和扫描速度(如Orbitrap与TOF的差异)也会改变zuì低检测阈值。例如,高分辨率Orbitrap在数据依赖性采集(DDA)模式下可识别更低浓度的多肽,而数据非依赖性采集(DIA)则对多肽测序方需要多少量的要求更为宽松,但需更复杂的生物信息学分析。
常见问题:
Q1. 多肽测序方需要多少量是否受翻译后修饰(PTMs)的影响?
A:是的。修饰(如磷酸化、乙酰化)可能降低多肽的电离效率或产生异质性信号,需增加10-50%的样品量以确保修饰位点的覆盖度。例如,磷酸化多肽在质谱中响应较低,常需富集或更高起始量。
Q2. 如何通过实验设计减少多肽测序方需要多少量?
A:可采用载体蛋白(如BSA)共沉淀减少非特异性吸附,或使用低吸附管材降低样品损失。此外,优化色谱梯度(延长分离时间)可提高低丰度多肽的检出率,从而减少总量需求。
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文献和实验chenguooo 各位大侠,小弟马上要做慢病毒尾静脉注射,想转染肝脏血管内皮细胞,想知道一只BALB/C小鼠要注射多少量?转染效率有多少?查不到类似的文献参考 体内肝脏血管内皮好转吗?我的慢病毒滴度是5*108TU/ML,来自上海英为信公司。 谢谢! zhujoker 慢病毒滴度是5*108TU/ML 打活体滴度太低,效果可能不会好 chenguooo
问:我要合成四段长约10aa的肽来做免疫动物(兔子),获得抗体(多抗),想问一下在多少纯度合适?多少合成量合适?不胜感激! 答:合成越长越好,纯度越高越好,量越大越好。不过太长了不容易合成,纯度更难以掌握。容易操作应该是指肽合成量大后,使用起来更宽裕一些,不至于太紧张。类似帖子以前也有,搜索一下吧。 答:合成长约10aa的肽有点短了,建议合成15aa的肽。纯度90%以上足可以了。合成多少量,取决于你想不想做亲和纯化,不做亲和纯化的话,5mg足够,如果做亲和纯化的话,需要10mg。至于载体
化方法需要使用多个光学元件在未染色样品中产生对比,而渐变对比只需在物镜光瞳中插入一个渐变 ND 滤光片即可实现。 (1)渐变对比方法的原理 插入到物镜光瞳位置的渐变 ND 滤光片在一个方向上的透射率单调递减。与物镜光瞳直径相比,投射在物镜光瞳位置的聚光镜透镜的孔径直径有所减少。如果样品的折射率分布平坦,聚光镜透镜的孔径图像会投射在物镜光瞳的中心位置,并随后受到渐变 ND 滤光片中心附近透射率的影响(图 2a)。当样品的折射率分布发生倾斜时,聚光镜透镜的孔径图像会从渐变 ND 滤光片的中心偏移
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