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北京百泰派克生物科技有限公司
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石蜡包埋样本如何保存的
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石蜡包埋样本如何保存的技术要点与实践规范
石蜡包埋样本如何保存的核心在于通过石蜡的物理特性实现生物组织的长期稳定固化。石蜡包埋是一种将组织样本浸入熔融石蜡中,待其冷却固化后形成保护性包埋块的技术。这一过程首先需要对组织进行固定(通常使用10%中性缓冲福尔马林),随后通过梯度乙醇脱水、二甲苯透明化处理,zuì终浸蜡并包埋。石蜡的熔点在56-58℃之间,其疏水性可有效隔绝水分,防止组织降解。保存时需将包埋块置于干燥、避光且温度稳定的环境中(建议15-25℃),避免石蜡因高温软化或低温开裂。
石蜡包埋样本如何保存的长期稳定性依赖于包埋质量与环境控制。包埋过程中需确保石蜡wánquán浸润组织,避免气泡残留。使用高纯度石蜡(如Paraplast或Histowax)可减少杂质对样本的化学损伤。保存容器宜选择密封性好的塑料盒或金属盒,内衬防潮硅胶。对于珍贵样本,可在石蜡块表面涂覆一层中性树胶(如DPX)以增强密封性。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定,但通常石蜡包埋的成本低于冷冻保存等替代方案。
石蜡包埋样本如何保存的另一个关键点是避免反复冻融或机械损伤。包埋块应平放存储,避免堆叠压力导致变形。若需长期保存(超过10年),建议定期检查石蜡块的完整性,必要时重新包埋。对于免疫组化研究,保存时间超过5年的样本可能面临抗原表位掩蔽问题,此时可通过抗原修复技术(如柠檬酸缓冲液热诱导表位修复)部分恢复信号。石蜡包埋样本如何保存的标准化流程还应包括详细的样本编号系统与数据库记录,确保追溯性。
常见问题:
Q1. 石蜡包埋样本保存多年后出现组织收缩或裂隙,如何补救?
A:这种现象通常源于脱水不chèdǐ或石蜡渗透不足。可尝试将样本重新水化(通过逆向梯度乙醇),用更高熔点的石蜡(如62℃)二次包埋。若裂隙严重,可采用真空渗透技术辅助石蜡填充。
Q2. 石蜡包埋样本能否用于后续的核酸提取?如何优化提取效率?
A:可以,但DNA/RNA降解程度较高。建议使用专门针对FFPE样本的提取试剂盒(如Qiagen GeneRead DNA FFPE Kit),配合蛋白酶K延长消化时间(24-48小时)。对于RNA,需加入RNase抑制剂并在提取后立即进行DNase处理。
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文献和实验,研究人员能够从FFPE样本中获取更多有用的信息,挖掘其潜在的临床价值。然而一些大型临床项目的时间跨度有时会长达5—6年甚至更久,FFPE样本就成为很好的生物信息存储载体,为了能够充分挖掘FFPE样本中的生物学信息,我们不仅需要关注核酸提取的步骤,福尔马林固定及石蜡包埋等标本前处理过程更加不容忽视。标本前期处理的规范化、标准化流程是后期各项检测关键的第一步,也是首要环节,是后期各项技术的保证。下面为您分享标本前处理的注意事项。 标本的前处理过程包括: 标本固定 标本固定是组织处理最重要的一步
文献速递:Nature子刊发文揭示少量癌症 DNA 的突变检测新方法。
者们提出了一种基于对双酶消化产生的基因组区域的可重复随机子集进行测序,并随后对DNA样本进行片段大小选择的测序方案。在检测到的突变类型没有偏差的情况下,实现了体细胞突变检测的充分覆盖。将这种方案称为 mutREAD,用于检测少量 DNA(包括降解样本)的突变特征。研究表明,mutREAD 概括了全基因组测序识别的突变特征,最终将允许在更大的队列中研究突变特征,此外该测序方案对福尔马林固定石蜡包埋样本也具有很好的兼容性,能够在临床中发挥重要作用。 mutREAD中各步骤的示意图。( SB,样本
FFPE 样本 FFPE 样本中的核酸在进⼊福尔马林浸泡之前就开始发⽣降解;样品基质内核酸易发⽣⽚段化、核苷酸碱基修饰以及核酸与蛋⽩的交联。 解决方案 1. 使用厚度不超过 5 mm 的组织样本,组织固定前的操作时间应当越短越好,避免 RNA 降解。 2. 不要过度固定(最多 24 h),固定时间越长,交联程度越⼤,样本中的 RNA 降解越厉害。 3. 推荐使⽤中性的福尔马林缓冲溶液及优质试剂进行石蜡包埋,不含添加剂。 4. 尽可能避免样品染色。 5. 可考虑使用专门的环保型脱蜡液,降低对实验环境
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