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北京百泰派克生物科技有限公司
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泛素化位点k63
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泛素化位点K63的结构特征与生物学功能
泛素化位点K63作为dànbáizhì翻译后修饰的重要类型,通过泛素分子第63位赖氨酸残基(K63)形成的多聚泛素链参与多种细胞过程调控。与经典的K48连接泛素化介导蛋白酶体降解不同,K63连接的泛素化链具有dútè的拓扑结构:其泛素分子间的等肽键形成延伸型构象,暴露出更多的dànbáizhì相互作用界面。这种结构特征使K63泛素化成为细胞信号转导、DNA损伤修复、内吞运输及炎症反应等非降解途径的核心调控机制。在分子水平上,K63泛素化由E2结合酶UBE2N(Ubc13)与E3连接酶(如TRAF6、RNF8)协同催化完成,其特异性由E2-E3复合物的空间构象决定。
研究表明,K63泛素化在NF-κB信号通路中发挥关键作用:TRAF6通过K63连接的自泛素化激活TAK1复合物,进而触发IKK激酶级联反应。在DNA双链断裂修复中,RNF8/RNF168介导的组蛋白H2A K63泛素化募集BRCA1等修复因子至损伤位点。此外,K63泛素化还调控线粒体自噬(如Parkin介导的PINK1信号通路)和细胞膜受体内化(如EGFR的内吞排序)。检测K63泛素化的技术包括K63链特异性抗体(如Apu2抗体)、质谱鉴定及基于UBE2N突变体的体外重构实验,具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
K63泛素化的检测与功能研究方法
基于K63泛素化链的特异性识别,串联泛素结合实体(TUBE)技术可通过串联泛素结合域(如UBAN结构域)富集细胞内的K63泛素化蛋白。结合质谱分析,该方法可系统性鉴定K63泛素化底物。定点突变实验通过将底物蛋白的赖氨酸突变为jīngānsuān(K-to-R),可验证特定K63泛素化位点的功能。例如,PCNA的K63泛素化(K164位点)被证实是跨损伤DNA合成的关键调控事件。
在活细胞成像领域,基于FRET的K63泛素化生物传感器(如Ubiquitin-K63 sensor)可实时监测特定信号通路中K63链的动态变化。此外,利用K63特异性去泛素化酶(如OTUD3)的催化失活突变体(Cys-to-Ala),可通过竞争性抑制研究K63泛素化的生理功能。
K63泛素化与疾病治疗的潜在关联
肿瘤中K63泛素化网络的异常与治疗耐药性密切相关。例如,乳腺癌细胞中RNF8介导的K63泛素化促进BRCA1缺陷细胞的PARP抑制剂耐药。针对K63泛素化的小分子抑制剂(如NSC697923靶向UBE2N)已进入临床前研究阶段。在神经退行性疾病中,α-突触核蛋白的K63泛素化异常聚集与帕金森病的路易小体形成相关。
常见问题:
Q1. K63泛素化如何区别于其他类型泛素链在质谱分析中的特征?
A:K63连接泛素链在串联质谱(MS/MS)中会产生特定的二gānānsuān(Gly-Gly)修饰肽段,其碎片离子谱显示m/z 684.35的特征峰(源自K63连接的泛素间肽键)。通过高分辨率质谱可区分K63与K11/K48链的差异水解模式。
Q2. 为什么K63泛素化在炎症反应中具有双向调控作用?
A:这种双向性源于E3连接酶的底物选择性——TRAF6介导的K63泛素化激活NF-κB通路促进炎症因子释放,而A20蛋白通过OTULIN去泛素化酶移除K63链终止信号。时空特异性的酶复合物组装决定了zuì终生物学效应。
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文献和实验小扇扑流萤 最近在做泛素化,已经得到了一个蛋白证明它发生了泛素化。下面想分析一下这个蛋白的氨基酸中在哪个位点发生了泛素化。请问有没有专门预测泛素化位点的工具? 我看到ExPasy中有SUMO化的预测工具,这两者有没有共同点呢? 小扇扑流萤 没有人做这个吗? SOS!! wuyuhere I am studying in SUMOylation
研究 lncRNA 的看过来~ 一起来看看曹雪涛院士的这篇 Cell
今天给大家分享一篇 lncRNA 的文章(Self-Recognitionof an Inducible Host lncRNA by RIG-I Feedback Restricts Innate Immune Response),文章发表在 Cell 上,通讯作者为曹雪涛院士。RIG-I 是一种模式识别受体,它能够识别外源性病毒 RNA(dsRNA),之后 RIG-1 的半胱天冬酶募集结构域(CARD)通过 TRIM25 进行 K63 连接的泛素化。TRIM25 的 RING 和 SPRY
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