Activity-Based Protein Profili

蛋白组学方法，如DDA（Data-Dependent Acquisition）或TMT标记定量，关注的是蛋白质的表达水平，但它们往往忽略了蛋白质的真实功能状态。Activity-Based Protein Profiling（ABPP）作为以功能为导向的蛋白质组学技术，通过特异性探针标记活性蛋白，为我们提供了“谁在工作”的全新视角。百泰派克生物科技率先整合ABPP策略与高分辨质谱平台，为客户提供从活性探针筛选到靶点鉴定的一站式技术服务，特别适用于酶类靶点发现、药物机制研究和疾病生物标志物挖掘。

 

一、ABPP的工作原理：用化学探针锁定活性蛋白

ABPP的核心在于活性位点探针（activity-based probes, ABPs）。这些小分子探针由三部分组成：

1、反应基团（Warhead）

具有化学反应活性的结构单元，能与特定酶家族的活性位点共价结合。例如，针对丝氨酸水解酶可采用氟磷酰胺（FP）类Warhead，针对半胱天冬酶可采用AOMK类Warhead。

 

2、连接臂（Linker）

连接反应基团与标签部分，通常为柔性结构，避免空间位阻影响结合效率，同时可调节探针的选择性和稳定性。

 

3、标签（Tag）

用于后续蛋白的富集和检测，常见标签包括生物素（用于链霉亲和素磁珠捕获）、荧光素（用于凝胶检测）或炔/叠氮基团（用于点击化学标记）。

 

二、关键优势

1、靶向活性蛋白：仅与具有催化活性的酶结合，避免“死酶”干扰；

2、适用于复杂样本：如细胞裂解液、组织匀浆甚至活细胞；

3、可扩展性强：支持高通量筛选、多样化标签应用。

 

三、技术流程：从样本处理到靶点鉴定

Step 1：活性探针孵育

将ABP加入待分析的样本（如细胞裂解液、组织匀浆或活细胞中），在适宜条件下反应，使探针选择性标记活性蛋白。

 

Step 2：标签富集与洗脱

利用标签（如生物素）结合streptavidin磁珠对结合蛋白进行富集，并洗去未结合杂质。此步骤确保只保留具有催化活性的酶类目标。

 

Step 3：酶解与质谱分析

富集的蛋白经胰蛋白酶或LysC等酶解后，经LC-MS/MS（液相色谱串联质谱）分析，识别其肽段序列和相对丰度。

 

Step 4：数据分析与功能注释

结合UniProt数据库、GO/KEGG功能注释、聚类分析等，识别差异活性蛋白并构建调控网络。百泰派克在此环节应用自主开发的数据分析管线，大幅提升靶点发现效率和准确性。

 

百泰派克生物科技采用高分辨Orbitrap Exploris 480平台，结合自主优化的数据分析流程，实现亚微克级样本下的高灵敏度探针蛋白检测。

 

四、典型应用场景

1、酶靶点筛选与药物机制研究

ABPP可用于小分子抑制剂的靶标验证。通过比较药物处理前后的活性蛋白图谱，可判断抑制剂是否有效结合目标酶。例如，某些抗癌药靶向丝氨酸水解酶家族，通过ABPP可直观验证其特异性抑制作用。

 

2、疾病相关酶类标志物挖掘

在肿瘤、神经退行性疾病、代谢紊乱等研究中，ABPP能帮助发现病理状态下上调或下调的关键活性酶，提示潜在生物标志物或治疗靶点。

 

3、代谢组学互补分析

将ABPP与代谢组学结合，可揭示酶活性变化与代谢通路紊乱之间的关系，特别适用于代谢酶调控机制解析。

 

4、新型探针开发与验证

ABPP平台不仅是应用工具，也可作为化学探针研发的验证平台，评估新探针的靶向性和选择性。

 

五、ABPP技术优势与局限

 

 

 

 

百泰派克生物科技通过构建高通量探针筛选库、优化富集与清洗流程、搭载Orbitrap Exploris 480等先进质谱平台，显著提升了ABPP项目的通量与数据深度，并为客户提供全流程一对一技术支持。

 

百泰派克ABPP服务优势

 

• 一站式服务：从探针筛选、蛋白富集到MS鉴定和数据分析；
• 高通量平台：支持多样本并行分析；
• 多领域覆盖：肿瘤、代谢、免疫、神经、感染等；
• 专业团队支持：包括有机合成、蛋白化学和质谱分析专家组成的交叉团队。

 

Activity-Based Protein Profiling打破了传统蛋白质组学“看得见但摸不着”的困境，从功能层面精确捕捉活性蛋白，已成为功能蛋白组学研究的核心技术之一。随着更多高选择性探针和数据分析工具的出现，ABPP将在精准医学、靶点发现与新药研发等方向展现更广阔前景。百泰派克生物科技将持续深化ABPP技术平台，助力广大科研人员更快、更准、更深入地揭示蛋白质功能网络。

 

百泰派克生物科技特色项目

 

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

 

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

 

 

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

 

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

 

 

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

 

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

 

 

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

 

 

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

 

 

百泰派克生物科技七大检测平台

 

 

 

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!