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文献和实验为了研究 RNA 的功能,通常需要通过反转录过程将 RNA 转化为更稳定的互补 DNA(cDNA)。之后 cDNA 可通过分子克隆、PCR 和测序等技术做进一步的研究。因此,反转录过程是许多 RNA 实验研究流程的关键步骤。 为了获得更为准确的研究结果,本期总结了反转录过程中需要考虑的一些因素,以期能够抛砖引玉,给你的实验研究带来些许帮助。 本期内容 RNA 模板制备 基因组 DNA 的去除 反转录酶选择 引物选择 主要反应组分 反应温度和反应时间 第一链和第二链 cDNA 合成 注
: 1. 感受态种类与效率,尤其转化效率,一定要很高。效率越高转化成攻率越高。有的时候片段与载体已经连接成功了,只不过在转化时,自身空间结构较大,没有转进去。 2. 酶切反应:如果可以,请用thermo fisher的内切酶,无论单酶切还是双酶切,6 h足够了。takara的酶批次间稳定性经常有问题,而且长时间酶切,片段很容易切碎。 3. 4000+的片段先加A连接到T载体上,利用片段两端的酶切位点双切,回收后再连接载体。 4. 如果第3步还是不行,请尝试一下这个偏方
效率,比如电转化比化学转化的效率更高。 3. 如何设计目的片段引物? PCR 引物设计,是决定实验是否成功的重要一环,现有的 PCR 设计工具,比如Primer-BLAST (NCBI)、Primer Designer Tool (Thermo Fisher)、 Primer3 等都可以针对目标序列设计出相应的引物,可以根据目标序列特征、实验室资源来选择合适的引物设计工具。如果后续通过无缝克隆的方法构建载体,在设计 PCR 引物时,还需要将同源臂序列添加到上下游引物的两端。具体添加方法可参考所用的同源
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