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蛋白互作网络-百泰派克生物科技

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  • 2025年07月16日
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      北京百泰派克生物科技有限公司

    • 服务名称

      蛋白互作网络-百泰派克生物科技

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    蛋白互作网络(Protein-Protein Interaction Network, PPI网络)是指由蛋白质之间的相互作用所构成的复杂网络系统,它在生命活动的调控中发挥作用。每个细胞内都有成千上万种蛋白质,这些蛋白质并不是孤立存在的而是通过特定的相互作用组建起分子机器或调控网络,从而共同参与生命过程的运行。蛋白互作网络以节点(蛋白质)和边(蛋白质之间的相互作用)为核心元素,呈现出高度动态且具有拓扑特性的结构。通过构建和分析PPI网络,科学家能够深入解析生物体内的功能机制,包括信号传导、代谢调控和基因表达等过程。PPI网络的研究应用广泛。在基础科学中,它能够揭示蛋白质的功能及其在生物学过程中的角色。例如,通过分析蛋白互作网络的拓扑结构,可以确定网络中的关键节点,即所谓的“枢纽蛋白”(hub proteins),这些蛋白能够维持细胞功能。在疾病研究中,PPI网络为药物靶点的发现提供线索。通过比较健康个体与患病个体的蛋白互作网络差异,研究者可以识别出与疾病相关的关键蛋白及其相互作用模式从而指导精准医学的实施。此外,在药物开发领域,PPI网络为理解药物的作用机制提供了新视角。例如靶向破坏致病蛋白的关键互作,可能比直接抑制该蛋白更有效且副作用更小。

     

    蛋白互作网络不仅应用于个体蛋白质功能的研究还能用于更高层次的系统生物学分析。通过构建全局PPI网络可以实现对整个细胞或生物体内分子活动的全景式观察。例如,在肿瘤研究中,PPI网络可以帮助科学家解析癌症发生、发展和转移的分子机制。在免疫学领域,通过PPI网络分析免疫信号通路的相互关系可以促进疫苗研发和免疫疗法设计。同时,随着单细胞测序技术和高通量质谱技术的发展,动态蛋白互作网络的构建成为可能,使得研究者能够更加准确地了解特定时间和空间下的蛋白质功能及调控。

     

    蛋白互作网络的研究方法主要依赖高通量实验技术和计算生物学方法。常用的实验技术包括酵母双杂交(Yeast Two-Hybrid, Y2H)和亲和纯化联合质谱分析(Affinity Purification Mass Spectrometry, AP-MS),这些技术能够高效捕捉蛋白质间的直接或间接相互作用。此外,近年来,计算预测方法也在PPI网络研究中,通过整合基因表达数据、结构信息和进化分析,研究者可以预测潜在的蛋白互作并补充实验数据的不足。这些技术的结合使PPI网络的研究深度和广度不断拓展,为生物学和医学研究开辟了新领域。

     

    在实际应用中,蛋白互作网络已经逐渐被整合到精准医学和新药研发的流程中。例如,药物再利用研究中,科学家通过分析PPI网络寻找现有药物可能靶向的新蛋白及其互作关系以加速新适应症的发现。在环境微生物研究中,PPI网络也被用来揭示微生物之间或微生物与宿主之间的相互作用,为生态修复和农业改良提供分子依据。

     

    百泰派克生物科技专注于蛋白质组学领域的高精尖服务,提供蛋白互作网络分析服务。我们利用先进的实验技术和生物信息学分析工具,为客户提供高质量的蛋白互作网络构建、关键节点分析和功能注释服务,帮助您快速解答复杂的生物学问题。

     

    百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商

     

    相关服务:

    蛋白质相互作用网络分析

     

    其他相关服务

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    特色项目

     

    一、蛋白测序

    百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。

     

    ※服务优势:

    1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

    2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

    3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

    4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

    5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;

    6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

     

     

    二、蛋白质组学

    百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

     

    ※服务优势:

    1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;

    2.体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

    3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;

    4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;

    5.专业生物信息学分析,分析更系统准确。

     

     

    三、单细胞质谱流式技术分析

    百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,然后用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

     

    ※服务优势:

    1.技术先进,填补技术空白

    采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征,百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

    2.分析数量大,成本较低

    单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。

    3.应用前景大

    ①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;

    ②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;

    ③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

     

     

    四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

    百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。

     

     

    五、生物药物表征

    百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

     

     

    六、基因敲除

    百泰派克生物科技(BTP)采用优化的CRISPR/Cas9系统为您提供高通量基因敲除服务,包括病毒包装、质粒制备、Cas9浓度测试等,为您解决选择哪个细胞进行敲除、可不可以敲除、如何敲除以及敲除效率如何等关键问题。可进行单/多基因敲除、移码突变和大序列敲除。我们的人全基因组基因敲除阵列Array文库覆盖了完整的人类全基因组,全基因组阵列敲除库已在人原代细胞全部完成高内涵筛选的验证,超过80%以上的靶点达到70%以上的敲除效率。

     

    ※服务优势:

    1.样本适用性强

    适用于人、小鼠的细胞系,原代细胞,免疫细胞及iPS细胞等。

    2.基因必要性及表达量分析

    在进行基因敲除实验前,我们会基于生物信息学和蛋白质组学数据对不同细胞中基因必要性及表达量进行分析,确保实验的可行性,降低实验风险。

    3.gRNA无需从头设计和验证

    我们完成了人类全基因组gRNA的全部验证,与药物相关的靶点也完成了PCR测序验证,无需针对客户的靶点设计预实验进行gRNA验证,大大缩短了项目周期。

    4.高通量高效率

    我们采用优化的CRISPR/Cas9系统进行高通量基因敲除,多个sgRNA/靶基因设计保证高敲除效率,超过80%靶点敲除效率在70%以上,短期内(10天内)即可提供高敲除效率的KO pool,满足绝大多数的应用场景。

    5.敲除效率双验证

    基因敲除后,我们采用WB实验中抗体KO验证的shǒuxuǎn方法——Sanger测序和深度蛋白质组学技术对敲除效率进行双验证,数据真实性的双重保障。

     

     

    百泰派克生物科技七大检测平台

    产品细节图片2

     

     

     

    百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商

    北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

    1.公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;

    2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;

    3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;

    4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;

    5.服务3000+企业,10000+客户的选择;

    6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

     

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    相关实验
    • 蛋白互作研究方法数据采集的未来发展趋势

      蛋白相互作用数量的增加,分析所需的蛋白质数量也随之增加。这一增长需要以一致的方式对蛋白质进行定量分析,而DIA方法提供了最佳的样本覆盖范围。DIA还允许在没有样本回注的情况下对数据集中的不同蛋白质进行分析,因此提供了在实验中促进对多种假设进行测试的潜力,并将有助于促进对蛋白质网络中蛋白质如何进行相互作用的理解。最后,虽然任何蛋白质定量方法都不是错误的,但所选择的方法必须平衡性能、开发时间和所提问题与所研究的生物样品所需的分析严谨性。 本文由百泰派克生物科技整理编辑,未经许可,不得转载。 百泰派克生物科技

    • 蛋白互作常用的研究方法

      蛋白抗体-proteinA/G小珠”复合物,纯化该复合物凝胶电泳分离蛋白,应用质谱分析鉴定靶蛋白的结合蛋白。 免疫共沉淀与质谱结合,不仅能验证已知蛋白的相互作用,而且还可以鉴定与目标蛋白互作的未知蛋白,为科学研究提供全新的实验思路。北京百泰派克生物科技有限公司提供蛋白互作,GST pull down,免疫共沉淀及IP-MS相关服务,欢迎垂询! 资料来源:网络资料 图片来源:百泰派克生物【biotech-pack】

    • Label-free/iTRAQ定量蛋白质组学技术

      稍差,会受到质谱稳定性等因素的影响; 适合于大样本量的定量比较(大于24个样本); 资料来源:百泰派克生物、网络资料 图片来源:百泰派克生物  

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