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HMY-1细胞

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  • CCC-Y1807
  • 2025年07月12日
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      T25

    HMY-1细胞HMY-1细胞HMY-1;人黑色素瘤细胞Cell line name HMY-1

    Synonyms HMY1

    Accession CVCL_2950

    Resource Identification Initiative To cite this cell line use: HMY-1 (RRID:CVCL_2950)

    Comments Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE).

    Population: Japanese.

    Doubling time: 37 hours (PubMed=6239887).

    Omics: Deep exome analysis.

    Omics: SNP array analysis.

    Omics: Transcriptome analysis by RNAseq.

    Derived from site: Metastatic; Left inguinal lymph node; UBERON=UBERON_0001542.

    Sequence variations

    Mutation; HGNC; 1097; BRAF; Simple; p.Val600Glu (c.1799T>A); ClinVar=VCV000013961; Zygosity=Unspecified (DepMap=ACH-001522).

    HLA typing Source: PubMed=26589293

    Class I

    HLA-A A*02:06,24:02

    HLA-B B*39:01,52:01

    HLA-C C*07:02,12:02

    Disease Melanoma (NCIt: C3224)

    Species of origin Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606)

    Sex of cell Male

    Age at sampling 62Y

    Category Cancer cell line

    STR profile Source(s): DepMap=ACH-001522; JCRB=JCRB1018; PubMed=25877200

     

    Markers:

    Amelogenin X,Y

    CSF1PO 12

    D3S1358 15

    D5S818 12

    D7S820 11,14

    D8S1179 14

    D13S317 11,13

    D16S539 10

    D18S51 14,17

    D21S11 30,32.2

    FGA 22

    Penta D 14

    Penta E 17,20

    TH01 6

    TPOX 11

    vWA 17,19

     

    Run an STR similarity search on this cell line

    Publications

    PubMed=6239887; DOI=10.1111/j.1346-8138.1984.tb01486.x

    Kondo S., Sato N., Sato K., Hozumi Y., Aso K.

    Establishment of cell lines from human malignant melanomas and their application to the assessment of natural killer-like cytotoxicity.

    J. Dermatol. 11:328-334(1984)

     

    PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080

    Klijn C., Durinck S., Stawiski E.W., Haverty P.M., Jiang Z.-S., Liu H.-B., Degenhardt J., Mayba O., Gnad F., Liu J.-F., Pau G., Reeder J., Cao Y., Mukhyala K., Selvaraj S.K., Yu M.-M., Zynda G.J., Brauer M.J., Wu T.D., Gentleman R.C., Manning G., Yauch R.L., Bourgon R., Stokoe D., Modrusan Z., Neve R.M., de Sauvage F.J., Settleman J., Seshagiri S., Zhang Z.-M.

    A comprehensive transcriptional portrait of human cancer cell lines.

    Nat. Biotechnol. 33:306-312(2015)

     

    PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397

    Yu M., Selvaraj S.K., Liang-Chu M.M.Y., Aghajani S., Busse M., Yuan J., Lee G., Peale F.V., Klijn C., Bourgon R., Kaminker J.S., Neve R.M.

    A resource for cell line authentication, annotation and quality control.

    Nature 520:307-311(2015)

     

    PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878

    Scholtalbers J., Boegel S., Bukur T., Byl M., Goerges S., Sorn P., Loewer M., Sahin U., Castle J.C.

    TCLP: an online cancer cell line catalogue integrating HLA type, predicted neo-epitopes, virus and gene expression.

    Genome Med. 7:118.1-118.7(2015)

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