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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
100个
- 英文名:
StarLighter Library Quantification Kit(Illumina)
- 供应商:
北京启衡星生物科技有限公司
- 规格:
1500 rxns
StarLighter Library Quantification Kit (Illumina®)
StarLighter文库定量试剂盒(Illumina®)
1产品描述
文库精确定量对于二代测序的结果是非常重要的。过低估计文库浓度,会导致簇生成过多,数据质量差;过高估计文库浓度,则导致数据产出量少,基因组覆盖率低。所以低估或者高估文库浓度都会影响测序效果。qPCR是DNA文库定量的标准,也是唯一种能够准确检测出分子数目的方法。
StarLighter Library Quantification Kit(Illumina )试剂盒提供基于染料法qPCR的Illummina@文库定量所必须的试剂。试剂盒包括:
Starighter Library Quantification Standards1-6(10倍线性梯度稀释,模板长度452 bp)
10x StarLighter Primmer Mix,具体包含下面两条引物:
引物1:5'-AAT GATACGG
引物2:5CAAGCAGAAGACGGC ATAGA-3'
2x StarLighter SYBR Green qPCR Mix(适用于文库定量)
文库定量是利用qPCR定量试剂、定量引物,通过qPCR方法操作6个10倍稀释的DNA标准品和稀释后的文库样品,根据6个确定浓度的DNA标准品生成标准曲线,然后用绝对定量法通过标准曲线计算得到稀释后的文库样本浓度。
该文库定量试剂盒已经过严格测试,以确保最小的误差。该试剂盒包含了新型耐受SYBR Green 染料的快速DNA合成酶。该工程聚有较高的扩增效率,且能够均衡扩增不同的DNA片段可对平均长度长达1kb的Illumina,文库进行可靠的定量分析,并且对文库类型和GC含量没有限制。
2 产品应用
StarLighter Library Quantification Kit (Illumina)文库定量试剂盒是专为Illumina测序前的文库准备设计的精确和可重复的定量试剂盒。本试剂盒适用于任何浓度>0.0002pM,并且包含和引物互补序列的文库,而文库的类型、文库构建方式,或者何种Illumina测序仪器都无需考虑。该试剂盒支持不同GC含量和平均片段长度高达1 kb的文库量化。除了NGS文库定量,该试剂盒也可用于检测Illumina 文库的制备过程中工作空间的文库污染。该文库定量测定包含重复移液的步骤,可以进行自动操作。
3 产品的兼容性
StarLighter Library Quantification Kit (Illumina )文库定量试剂盒适用于任何包含P5、P7序列的NGS文库的量化(准备进行Illumina测序)。用部分或茎环Adapter制备的文库只能在扩增后使用此试剂盒进行定量。需确保文库准备过程中使用的Adapter序列和产品描述中的文库定量所用引物序列兼容。按照qPCR仪器对参考染料Rox的要求,选择使用合适的Rox。
4产品规格
4.1运输和储存
该文库定量试剂盒可根据目的地国家、地区使用干冰或冰袋运输。接收后,立即将整个试剂盒存放在-15℃℃至-20℃℃恒温冰箱。正确储存条件下,试剂盒所有成分能够在标签显示效期内保持全部性能。
4.2 处理
确保所有成分在使用之前都解冻并漩涡震荡混匀。SYBR Green染料(包含在定量试剂中)Rox染料都对光敏感,长时间暴露在直射光下会导致荧光信号强度下降。
该文库定量试剂盒的所有组分,可以稳定通过30次循环冻融。确保所有试剂在不使用的情况下是-20℃℃避光储存。当避光储存时,试剂可以在2℃-8℃℃稳定存贮至少一周,短期使用可存储在该温度下,但要确保不被微生物或者核酸酶污染。
4.3 质量控制
试剂盒所有组件都经过严格的功能性质量控制,不存在可检测的杂质和核酸内切酶活性并对DNA污染有严格要求。
5 重要参数
该试剂盒为准备Illumina 测序的文库提供准确和可重复的定量结果。
5.1样品浓度和稀释
待定量文库要稀释到检测的动态范围,即20pM-0.0002pM或5.5pg/μl-0.000055 pg/μl或12x10“-12x10'个dSDNA分子/ul。任何浓度大于标准品 1的文库,不应使用该试剂盒做文库浓度计算,必须对其进行适当稀释,如果稀释后浓度属于检测的动态范围,则可以用来文库定量。所以,当待测文库的浓度较高时,为保证最佳定量结果,最好将文库稀释到标准品 1至标准品3之间。
文库稀释倍数应根据同类型库的经验进行估计或换算,或采用其他类似的工作流程,或参考其他方法获得的文库建设过程中的质量控制信息(例如使用Qubit或 Bioanalyzer、Nanodrop)
当测试多个文库时,若某些文库浓度(如Qubit浓度)差异不大,为减少计算量或为操作简便,可采用相同的稀释倍数。
5.2 样品质量
由于稀释的DNA会在无缓冲环境下降解,待测文库或实验对照品必须用缓冲溶液存储和稀释,如10mM Tris-HC1,pH值8(25°C),可在稀释缓冲液中添加0.05%的Tween~20来提高移液的准确性和减少DNA吸附。不要用水直接稀释待测文库或实验对照品。
每次检测时要准备现稀释的样品,并在进行qPCR操作时保持在冰上。样品在室温下存放或者放置长时间(如超过3小时,即使在4℃)会导致后面计算文库的浓度值不准确,则必须重新测定,并重新准备稀释样品。
5.3准确的液体处理
由于qPCR是非常灵敏的技术,并且该类测定所测模板均含较低的拷贝数,所以结果的可靠性高度依赖于准确的移液操作,在执行该操作时必须注意确保最高的精确度。注意以下步骤:
始终在使用前确保试剂和样品完全解冻和彻底混合。解冻和混合后,短暂离心以去除管壁上的液滴。
高浓度的DNA溶液可能粘性较大,因此很难进行小体积移取。要避免在样品制备过程中一次性做出倍数非常大的稀释操作(如大于100倍)。如样品确需稀释倍数较大,才能达到检测的范围,要进行多次梯度稀释。(例如若需进行10000倍稀释,要连续进行两次100倍稀释,而不是一次性10000倍稀释)。
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文献和实验CDNA合成第一链试剂盒 #E6500L 150 个反应 7600 生工 SK2027 10次 MMLV第一链合成试剂盒 SK2028 20次 TAKARA D6135 5次 6800 Active Motif 50096 96rxns ReflectionTM 96
Illumina测序仪通常也被称作Solexa测序仪(Illumina测序仪的特点见表5)。它适用于采用各种方 法制备的DNA文库,文库中DNA片段可以长达数百bp,并可通过桥式PCR来扩增模板片段。在 桥式PCR反应中,正向引物和反向引物都被通过一个柔性接头(flexible linker)固定在固相载体(solid substrate)上。经过PCR反应,所有的模板扩增产物就都被固定到了芯片上固定的位置。 值得
,接头部分序列已经在第一步引入,例如在反转录过程中。因此,通过删除各种处理步骤,使工作流程得以简化和有效地缩短时间。允许在几个小时内完成文库的准备工作流程。图1展示了两种不同RNA-Seq文库制备方法的工作流程示意图。 RNA-Seq 可用于多种应用场景,可通过不同方法的组合高度定制,并提供无限的修改可能性,以满足研究项目的个性化需求。在拿起移液器之前计划好你的实验是成功的关键,确保高质量的结果来支撑你的想法和假设。 图1 Illumina短读长测序| RNA-Seq文库准备流程RNA从细胞










