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基因组学之单细胞测序

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    基因组研究包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics),又被称为后基因组(postgenome)研究,是系统生物学的重要方法。

    在医学领域,基因组学能为一些疾病提供新的诊断、治疗方法,有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。在食品、农业、环境等研究领域,基因组学的应用也十分广泛。基因组学的主要工具和方法包括生物信息学,遗传分析,基因表达测量和基因功能鉴定。

     

    一、单细胞测序:

    单细胞测序通过对单个细胞进行基因组或转录组测序,解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向,为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。

     

    二、实验路线:

    (1)材料选取;

    (2)DNA样品单细胞或0.5pg-1ng基因组DNA≥0.6ug;

    (3)文库构建180-280bp;

    (4)PE150测序;

    (5)生物信息学分析。

     

    三、生物信息学分析:

    图片

    四、应用领域:

    疾病早期诊断(检测),疾病(癌症)发生机制。

     

    五、样品要求:

    (1)DNA水平:单个细胞,单染色体,少量细胞等稀有样本或0.5 pg的基因组DNA。

    (2)RNA水平:单个细胞,微量细胞(几个到几千个)和微量Total RNA(10pg-10ng)中含polyA尾的RNA。

    图片

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