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基因组研究包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics),又被称为后基因组(postgenome)研究,是系统生物学的重要方法。
在医学领域,基因组学能为一些疾病提供新的诊断、治疗方法,有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。在食品、农业、环境等研究领域,基因组学的应用也十分广泛。基因组学的主要工具和方法包括生物信息学,遗传分析,基因表达测量和基因功能鉴定。
一、单细胞测序:
单细胞测序通过对单个细胞进行基因组或转录组测序,解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向,为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。
二、实验路线:
(1)材料选取;
(2)DNA样品单细胞或0.5pg-1ng基因组DNA≥0.6ug;
(3)文库构建180-280bp;
(4)PE150测序;
(5)生物信息学分析。
三、生物信息学分析:

四、应用领域:
疾病早期诊断(检测),疾病(癌症)发生机制。
五、样品要求:
(1)DNA水平:单个细胞,单染色体,少量细胞等稀有样本或0.5 pg的基因组DNA。
(2)RNA水平:单个细胞,微量细胞(几个到几千个)和微量Total RNA(10pg-10ng)中含polyA尾的RNA。

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文献和实验的能力越强,越不容易感染疾病,但超过一定限度,也容易引发自身免疫性疾病。且机体的免疫组库也不是一成不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和治疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病(疾病感染,治疗,自身免疫疾病等)和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。简单来说,单细胞免疫组库解决如下问题: 识别免疫组库序列组成和多样性 探究基因表达情况,发现新的生物标志物 分析样本内/样本间
单细胞测序悬液老是制备失败?别担心,单细胞核测序来拯救你的样本了
虽然单细胞测序到现在已经应用到各个研究领域,但是实际的实验过程中依然会遇到很多问题,比如: 1.很多样本根本没有办法制备单细胞悬液,比如已经在-80℃冻存的样本; 2.有些样本制备成单细胞悬液以后现有的单细胞测序平台无法捕获,比如心肌细胞、骨骼肌细胞、成熟的脂肪细胞等,由于直径过大,超出了10x genomics和BD Rhapsody平台最大能捕获的细胞直径; 3.再者有些细胞类型可能在单细胞悬液制备的过程中丢失,比如脑部的新生神经元、肾脏的肾小球足细胞和肾小球系膜细胞等都会在单细胞
重新定义疾病-细胞-基因间的关系,精确到单个细胞级别的测序从过去的天文数字变为可能。
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