基因组学之单细胞测序

基因组研究包括两方面的内容：以全基因组测序为目标的结构基因组学（structural genomics）和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学（functional genomics)，又被称为后基因组（postgenome）研究，是系统生物学的重要方法。

在医学领域，基因组学能为一些疾病提供新的诊断、治疗方法，有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。在食品、农业、环境等研究领域，基因组学的应用也十分广泛。基因组学的主要工具和方法包括生物信息学，遗传分析，基因表达测量和基因功能鉴定。

 

一、单细胞测序：

单细胞测序通过对单个细胞进行基因组或转录组测序，解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的难题，为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向，为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。

 

二、实验路线：

（1）材料选取；

（2）DNA样品单细胞或0.5pg-1ng基因组DNA≥0.6ug；

（3）文库构建180-280bp；

（4）PE150测序；

（5）生物信息学分析。

 

三、生物信息学分析：

四、应用领域：

疾病早期诊断（检测），疾病（癌症）发生机制。

 

五、样品要求：

（1）DNA水平：单个细胞，单染色体，少量细胞等稀有样本或0.5 pg的基因组DNA。

（2）RNA水平：单个细胞，微量细胞（几个到几千个）和微量Total RNA（10pg-10ng）中含polyA尾的RNA。