新一代单细胞全长转录组测序 Smart-seg3xpress

单细胞转录组测序能够精准反映细胞间的异质性，在肿瘤免疫、发育生物学、神经科学等领域发挥重要作用，具有广阔的应用前景。科研人员往往会根据特定课题的需求，平衡检测通量、测序深度、转录本覆盖率、基因检出灵敏度等多方面因素，综合使用高通量和全长这两种单细胞测序技术，为研究工作提供更充分的证据，达到1+1＞2的效果，进而提高文章影响力。因此，百奥智汇针对性地引进了新一代单细胞全长转录组Smart-seq3xpress技术平台，为更加深入的科学研究提供强大助力。

技术优势

数据结果展示

样本要求

物种来源：人、小鼠（其他物种请于实验前与百奥智汇工作人员沟通）

样本类型：分选好的细胞、未分选的细胞悬液、组织、血液等

样本要求：

• 细胞计数仪下活细胞占总细胞比例应大于 80%，有核率大于 70%，结团率小于 10%；
• 流式细胞分选时，目的细胞分群明显，且数量足够分选至 96 孔板中；
• 流式分选细胞之前，需要预先调整收集板位置，从而确保细胞能够分选至每个孔径中心；
• 分选后的 96 孔板密封后需要短暂离心，立即水平置于冰上或低温冰箱（以免影响转录组信息），尽快水平放入-80℃冰箱保存，待液体凝固后置于干冰上运输。

应用场景与案例

参考文献：

·Hagemann-Jensen M, ziegenhain C, sandberg R. Scalable single-cell RNA sequencing from full transcripts with smart-seq3xpress. Nat Biotechnol. 2022.

·Zhang L, li z, skrzypczynska KM, et al. Single-Cell Analyses Inform Mechanisms of Myeloid-Targeted Therapies in Colon Cancer. Cell. 2020.

·Zhang Q. He y, Luo N, et al. Landscape and Dynamics of Single lmmune Cells in Hepatocelular Carcinoma. Cell. 2019.

·Zhang L, Yu X, Zheng l, et al. Lineage tracking reveals dynamic relationships of T cells in colorectal cancer. Nature. 2018

·Data source: 10x datg - 68k PBMc dataset (V1) and 1k PBMc dataset (V3) from 10x Genomics. SS2 data - from Zhang et al, Cell 2019 and Zhang et al, Cell 2020. ss3x data -frozen CD3+ T cells (百奥智汇, 2022)