转录组与蛋白组联合分析九象限图

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  • 2025年09月12日
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      北京百泰派克生物科技有限公司

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      转录组与蛋白组联合分析九象限图

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    转录组与蛋白组分别从RNA和蛋白质水平对样本进行研究,转录组主要是基因的表达情况,蛋白组主要是转录组的翻译情况,将两者进行整合分析即转录组与蛋白组联合分析,可以对两者的数据进行差异分析,从众多候选基因中快速寻找与研究性状相关的关键基因。

    由于翻译调控机制的存在,实际上蛋白组与转录组的数据相关性较低,九象限图此时就可以发挥关键作用。九象限图是在原有的四象限图的基础上发展升级而来的,可以更直观、更精细的展示基因与蛋白的相关变化情况。九象限图的横坐标是转录组差异倍数log2值,纵坐标是蛋白组差异倍数log2值,图中的每个小圆点代表一个基因或蛋白质,分别通过两条与横坐标和纵坐标平行的虚线将图划分为九个区域,每个区域代表不同的涵义。与横坐标平行的虚线表示转录组的差异倍数阈值,与纵坐标平行的虚线表示蛋白组的差异倍数阈值,阈值线外代表差异显著的基因或蛋白质,反之,阈值线内则表示差异不显著的基因或蛋白。

    百泰派克生物科技基于Illumina高通量测序平台的转录组测序服务,能够在单核苷酸水平上检测任何物种的整体转录水平,与可提供多种蛋白质组学的定量和定性服务的Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合nanoLC-MS/MS纳升色谱,结合可定制化的生物信息学分析方法进行整合,百泰派克为您提供从实验设计、样品检测、数据分析一站式转录组学和蛋白质组学整合分析服务,可满足多种检测需求。

    其他服务项目

    转录组与蛋白组联合分析九象限图

     

    优质检测平台

    (1)基于生物化学、分子生物学、色谱的检测分析平台

    该平台配备了Agilent 2100 生物分析仪、ProteinSimple凝胶成像系统、高效液相色谱系统,为蛋白质组学、代谢组学分析保驾护航,包括样品制备、分离纯化分子量测量、杂质表征表达研究等:

    (2)基于质谱技术的蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白测序平台

    该平台配备了超高效液相色谱质谱联用,Orbitrap Fusion Lumos Tribri,Thermo Scientific Exploris以及氢气交换质谱仪配合机械臂为蛋白贡组学、代谢组学和蛋白测序提供了全面的分析手段,包括蛋白质和代谢物的分离、质谱分析、结构分析以及动态信息研究;

    (3)生物药物表征平台

    该平台配备了DSC-FTRR差示扫描量热仪与傅立叶变换拉曼光谱仪,氢气交换质谱仪配备机械臂,为生物药物表征提供了全面的分析手段,包括生物药物的分离、纯化、结构分析和动态信息研究:

    (4)基于10x Genomics的单细胞分析平台

    该平台能够完成基于10x Genomics单细胞分析平台的检测流程包括单细胞分选、cDNA合成、文库制备、文库质量检测、PCR扩增以及高通量测序;

    (5)基于Fluidigm的单细胞质谱流式检测平台

    采用基于Fluidigm Helios流式细胞仪(Mass Cytometry Systemfor Single Cell Analysis)用于单细胞质谱分析,该平台能够完成包括单细胞捕获、cDNA合成、实时定量PCR分析、目标区域扩增以及质谱流式细胞分析;

    (6)基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台

    基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台,能够完成包括多肽分离、纯化、合成、质谱分析、免疫学检测以及分子相互作用研究;

    (7)生信云平台

    基于生物信息分析方法的生信云平台,能够完成一整套的生物信息学解决方案,包括组学数据的质量分析、差异表达分析、差异表达物GO、KEGG、COG注释分析、聚类分析、相互作用网络等多层次网络和通路的分析。

     

    百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商

    北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

    1.公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;

    2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;

    3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;

    4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;

    5.服务3000+企业,10000+客户的选择;

    6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

     

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