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- BD Rhapsody单细胞转录组测序
- 上海市闵行区
- 2026年04月21日
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上海旭燃生物科技有限公司
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BD Rhapsody单细胞转录组测序
技术原理
技术原理 微孔板上有超过26万个微孔，利用重力沉降的原理依次加入细胞和beads，由于微孔数和beads数远远高于细胞数，从而微孔板上成千上万了微孔内部存在一个细胞和一个磁珠，微孔内细胞裂解，磁珠捕获mRNA（beads上存在标记细胞（CL）和RNA分子（UMI）的标签，以及带有poly（dT）的寡核苷酸链，poly（dT）捕获mRNA的polyA尾巴），后续基于磁性收集磁珠（带有RNA分子），进行逆转录，将细胞和RNA分析标签加到每一个RNA分子上，以达到细胞标签标记细胞，UMI进行RNA定量的目的。
实验流程
产品优势
- 通量高：100-60,000细胞/通道/样本， 每张芯片最多可分析8个样本 ；
- 支持混养：可接受多样本混合上样，降低成本；
- 细胞捕获率高：可高达80% ；
- 温和捕获方式， 捕获更全细胞类型：利用重力沉降获得单细胞，无需施加外界压力，对于脆弱细胞更友好；
- 双胞率低：0.2%/1000细胞。
数据分析
分析流程
分析结果展示
研究方向
文献案例
论文标题：Allosteric inhibition reveals SHP2-mediated tumor immunosuppression in colon cancer by single-cell transcriptomics
中文标题：通过单细胞转录组学变构抑制揭示结肠癌中SHP2介导的肿瘤免疫抑制
发表期刊：Acta pharmaceutica Sinica. B
发表时间：2022年1月 影响因子：14.5
技术方法：scRNA-seq 研究单位：南京大学生命科学学院
主要研究内容：研究者利用小鼠肿瘤组织进行了单细胞RNA 测序，以探索 SHP2 在小鼠 MC38 异种移植物肿瘤微环境(TME)的所有细胞类型中的作用。研究表明，肿瘤内细胞被发现具有功能异质性，并且对 SHP099（一 种 SHP2 变构抑制剂）有显著反应，SHP099显着抑制了肿瘤细胞的恶性进化。
总的来说，研究数据揭示了 SHP2 介导的先天免疫抑制机制，表明 SHP2 是结肠癌免疫治疗的一个有希望的靶点。 单细胞测序有助于理解细胞异质性，揭示生物发育的细胞命运决定和差异化路径。
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