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伊莱博生物科技(上海)有限公司
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分子生物学技术服务
1.甲基化特异性的PCR (MSP)
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。
2.亚硫酸氢盐测序法(BSP)
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序,可以提高测序成功率,这种方法称为BSP-克隆测序法。
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文献和实验2021 年 8 月 25 日,北京医疗保障局公布,将基因甲基化检测纳入甲类医保服务项目及甲类工伤保险项目;同样在 9 月 24日,多款基因甲基化检测产品被纳入海南医保价格目录。 图 1 .北京市和海南省医保局发布新增医疗项目表(部分) 许多研究表明,肿瘤与一系列基因和表观遗传的异常改变有关。细胞生长和分裂过程中涉及到的关键通路发生了基因突变或表观遗传改变,就可能会诱导肿瘤的发生。在肿瘤细胞 DNA
高通量、低成本SNP、突变或甲基化检测方法—HRM 技术应用
的筛查。 • 遗传育种中特定突变的筛查、未知突变的发现。 • HLA 基因组配型、等位基因频率分析、物种鉴定、品种鉴定、甲基化研究。 • 法医学鉴定、亲子鉴定。 • 动植物品质相关多态性位点的研究等。植物抗逆性,突变与性状关联性研究。 HRM 特点 • 高通量:1 次可同时检测10-384 样本,适合大样本、多SNP、多突变位点及多位点甲基化的扫描。 • 高敏度:肿瘤研究中低突变率样品基因突变检测,最低检测到0.1%的突变样品基因突变,即检测到1000 个正常
甲基化荧光检测(methylight)是利用荧光定量性PCR检测亚硫酸氢钠处理后的序列改变。在TaqManR技术中,可以使用3种不同的单核苷酸(正义引物、反义引物和荧光杂交探针),进行不同序列的检测。与已存在的技术相比,甲基化荧光检测最明显的优点就是能同时对几百甚至几千例样品迅速检测。 高敏感、快速是本方法最显著的特点,它可以在非甲基化等位基因超出10 000倍的情况下精确地检测到甲基化的等位基因并定量,而且可以做多样本、多基因位点的快速
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