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嘉兴硕玺生物有限公司
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DIA 定量蛋白质组学
1. DIA 技术
蛋白质组学届巨擘 Ruedi Aebersold 教授开创了基于质谱的生物样本数字化的 Data independent acquisition (DIA,又称 SWATH)技术,帮助蛋白质组学迈向下一时代。通过他创立的 Biognosys 提供的整体解决方案,您可以轻松地实行大规模样本的组学定量流程。取决于您的研究方向,可以选择发现式研究方案,剖析不同条件及处理下样品的成千上万种蛋白;亦或是靶向研究方案,对选定的蛋白质进行高通量定量。
DIA 技术融合了传统蛋白质组学“鸟枪法”(shotgun)和质谱绝对定量“金标准”选择反应监测/多反应监测(SRM/MRM)技术的优势和特点。另外,DIA 技术将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。DIA 技术具有全景式扫描、数据可回溯 等优势。
DIA 质谱技术实验流程见下图。


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文献和实验备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
,4046 个蛋白质被定量。与对照组相比,CUMS 组在 1.5 倍变化 (> 1.50 或 差异蛋白验证:免疫荧光证实,与对照组相比,海马 CA1 和 DG 亚区的神经元损失显著。对 RIP3、MLKL 和 p-MLKL 及与铁稳态失调和脂质过氧化相关指标,包括 Ftl1、MDA、GSH 和 GPX4 等进行 WB 验证,结果表明铁死亡和坏死与慢性应激诱导的抑郁有关。 6.2、IF 3-5 分文章:蛋白质组学+代谢组学 蛋白质组学和代谢组学检测 分析差异蛋白,对差异蛋白进行
University, Research Dr., C118 LSRC, Durham, NC 27710. Phone: (919) 613-8606. Fax: (919) 668-0977. E-mail: hayst001@mc.duke.edu . REFERENCES 蛋白质组相关设备及试剂: 液相HPLC系统 | 毛细管LC系统 | 气相色谱系统 | 自动固相萃取系统 | 联用色谱系统 | 更多... (a) Triple quadrupole. Triple
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