产品简介:
BioDynami开发了Bisulfite Sequencing建库试剂盒(illumina平台),以亚硫酸氢盐处理的DNA (50 ng - 500 ng)作为输入构建NGS文库。DNA甲基化是一种表观遗传学机制,通过阻断转录因子与启动子和增强子的结合,在基因调控和基因组印记中发挥关键作用。亚硫酸氢NA测序是生物医学研究中基于亚硫酸氢NA处理下的C - T转换的一种流行技术。
近年来,NGS已成为在全基因组水平上以单碱基分辨率鉴定DNA甲基化状态的有力工具。然而,亚硫酸盐处理对NGS文库的破坏是众所周知的。
Bisulfite-Seq试剂盒比较
在常规的亚硫酸氢盐测序文库制备(亚硫酸氢盐转换前的文库准备)的情况下,需要DNA剪切设备和昂贵的甲基化适配器。此外,随后的亚硫酸氢盐转换会对构建的文库造成巨大的DNA损伤。
BioDynami开发了一种独特的库准备技术来解决这些问题。该技术使用亚硫酸氢盐处理的DNA作为输入,以避免亚硫酸氢盐转换造成的显著文库损失。此外,我们的试剂盒不需要DNA剪切步骤和昂贵的甲基化接头。试剂盒中的DNA聚合酶具有高保真扩增能力和尿嘧啶耐受性,是亚硫酸氢盐测序文库扩增的理想选择。
Bisulfite Sequencing建库试剂盒工作流程
Three index types are available for the kit:
Non-index (Cat.# 30091): Libraries do not have index.
Index (Cat.# 30092): Each primer contains a unique barcode sequence of 6 bases to identify the individual library. Library multiplexing capacity is up to 48 samples.
Unique dual index (Cat.# 30093): The multiplexing of bisulfite sequencing library is up to 96 samples with unique dual indexes. We used a Four-Base Difference Index System to generate indexes that have at least 4 bases different from each other in the 8-base index. The index primers remove NGS errors including index cross-contamination, index hopping, reads mis-assignment etc.
Kit advantages
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- Easy and Quick protocol
- Easy: Hands-on time only 10 minutes
- Quick: Total protocol time around 1.5 hours
- Simple workflow: Less steps
- Save magnetic beads more than 50%
- Guaranteed high Bisulfite sequencing library conversion efficiency
- Bisulfite treated DNA as input: From 50 ng to 500 ng
试剂盒有三种index类型:
Non-index(Cat.# 30091):没有索引。
Index (Cat.# 30092):每个引物包含6个碱基的唯一条形码序列,用于识别单个库。库复用能力可达48个样本。
Unique dual index(Cat.# 30093):重亚硫酸氢盐测序文库复用多达96个样本,具有独特的双指标。我们使用了一个四基差索引系统来生成在8基索引中至少有4个不同的索引。索引引物消除了NGS的错误,包括索引交叉污染、索引跳跃、读取错误赋值等。
试剂盒优势:
★ 简单快速协议
★ 简单的工作流程:步骤更少
★ 节省50%以上的磁珠
★ 保证高亚硫酸氢盐测序文库转换效率
★ 亚硫酸氢盐处理的DNA作为输入:从50 ng到500 ng
★ 简单:操作时间只有10分钟
★ 快速:总实验时间约1.5小时