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small RNA转录组测序

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  • 上海市闵行区
  • 2026年04月25日
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      上海旭燃生物科技有限公司

    • 服务名称

      small RNA转录组测序及数据分析

    服务优势

    产品细节图片1

    产品描述

    小RNA(Small RNA)是一类长度在18-30nt的内源性RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA等,是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。Small RNA测序(Small RNA-seq)是利用第二代高通量测序技术,对特定状态下细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序,实现Small RNA序列的鉴定、靶基因分析和功能注释等多项分析。
    产品细节图片2

    产品优势
    1、通量高、敏感性高的技术,对于多基因分析及低频突变检测具有独特的优势
    2、全基因组分析,无需预先设计特异性探针能够检测未知基因

    3、低成本,高准确性,大幅降低了测序时间
    4、数字化信号直接测定每个转录本片段序列,单核苷酸分辨率的精确度
    5、高深度的测序数据,检测新的miRNA

    实验流程

    产品细节图片3

    数据分析

    产品细节图片4

    研究方向/思路

    产品细节图片5

    送样要求
    样本类型 建议送样量 存储介质 保存、运输条件
    组织 >50mg 1.RNA later
    2.存入冻存管;
    3.大块组织样本不建议放入trizol保存
    4.1.5ml无菌离心管
    -80℃保存,干冰运输
    细胞 >2 x 10^6 1.收集的细胞沉淀,加入1ml trizol震荡混匀-80度保存;
    2.收集的细胞沉淀,液氮速冻5-10min,-80℃冰箱保存;
    -80℃保存,干冰运输
    全血 >1ml A.采用EDTA抗凝管采血,禁用肝素抗凝管,新鲜血液效果更佳。
    B.或者分离出PBMC加 trizol 混匀。
    C.或者全血离心去掉血浆加 trizol 混匀。
    D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube静脉真空采血管(全血RNA管)
    PS:请尽量不使用RNA later保存全血。
    -80℃保存,干冰/4度(新鲜)运输
    FFPE A.切片组织面积大于1cm2,切片表面无划痕,无干裂,均匀贴片的石蜡切片;
    B.切片组织细胞>30000个;有核细胞比例>80%;肿瘤细胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,组织面积偏小或细胞核占比未达80%以上,需提供5-12片;

    C.石蜡块:厚度4mm以上,组织约绿豆大小以上;
    D.蜡卷:厚度25um左右,2-5卷
    / 4℃或常温保存和运输
    RNA >1ug DEPC水;Water Nuclease-Free -80℃保存,干冰运输

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    图标文献和实验
    相关实验
    • 揭露空间转录组测序的神秘面纱

      结合细胞在组织中分布的位置信息和转录组基因表达信息,了解细胞在空间背景下的异质性。

    • 如何来设定转录组测序中的生物学重复

      研究意义;而同样情况下RASGRP1的检测数据可能不能说明问题。 由此可知,设计的实验如果没有生物学重复,或者生物学重复的数量不够,就不能得到有统计意义的实验结果;获得的差异表达的基因很可能仅仅是少数个体差异的表现,并不能反映疾病或者某种特定生理状态的群体本质特征。 3.生物学重复设置几个合适? 您是不是有同样的问题:转录组测序是否必须进行生物学重复啊,是否要3个重复,是否可以用3个样品的RNA等量混合代替生物学重复,如果不重复能否发文章…..?一方面是有限的经费,一方面是编辑的质疑;实在很难

    • RNA测序简介

      NGS已成为生命科学领域中基因组学和转录组学研究的金标准。虽然它与桑格测序等方法有某些核心相似之处,但NGS所能实现的绝对的高通量水平使它与其他方法截然不同,并彻底改变了科学家的工作方式。 RNA测序(RNA-seq)尤其处于NGS功能应用的前言沿。RNA-seq最简单的形式允许我们在取样时确定样本中的RNAs的丰度。转录组是一个高度动态的细胞特征,并打开了一个巨大发掘潜力的世界。对药物、各种疾病状态、转录后修饰和选择性剪接转录本的反应变化只是 RNA-Seq 使其能够发现的一些例子

    图标技术资料

    资料下载:

    miRNA测序分析报告.docx 附 (下载 0 次)

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