转录组学

转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。相对于传统的芯片杂交平台，转录组测序无需预先针对已知序列设计探针，即可对任意物种的整体转录活动进行检测，提供更准确的数字化信号，更高的检测通量以及更广泛的检测范围，是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。基于高通量测序平台的转录组测序技术能够全面获得物种特定组织或器官的转录本信息，从而进行基因表达水平研究、新转录本发现研究、转录本结构变异研究等。

技术优势

高通量、更精确的数字信号

在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测

分析转录本的结构和表达水平的同时，还能发现未知转录本和稀有转录本

准确的识别可变剪切和融合基因

技术路线

转录组学测序的上机流程

转录组学测序的分析流程

技术参数

▶ 样本要求

动物样品：RNA总量≥10 μL，浓度≥150 ng/μL，RIN≥7，28S/18S≥1.0

植物、真菌样品：RNA总量≥10 μL，浓度≥150 ng/μL，RIN≥7，28S/18S≥1.0

原核生物：RNA总量≥10 μL，浓度≥150 ng/μL，RIN≥7，28S/18S≥1.0

如上述未提及的样本，可咨询销售工程师

▶ 检测平台

测序平台：Hiseq 2500/ Nova Seq6000，Illumina

测序方法：PE150

测序深度：6G/10G/12G

▶ 常规项目周期

实验检测：37个自然日

数据分析：12个自然日

应用方向

• 植物生长机制的发现及干预
• 炎症发生机制的发现及干预
• 表达差异的研究
• 基因点突变及多态性检测