Nanopore三代全长转录组

体外转录实用技巧

生成全长转录组 使用 Ambion 转录试剂盒合成的大多数 DNA 模板都可以生成全长转录组，无需任何优化。然而，一些模板可能产生过早终止的产物，如较小的离散带或拖尾/降解产物。对于印迹杂交，通常不需要全长 RNA 探针。然而，对于许多其他分析，至关重要的是转录进行到模板的末端，全部生成同一种大下的转录组（例如 NPA，体外翻译研究和结构分析）。转录反应失败或不良的两个最常见因素是标记核苷酸中的抑制剂和质量较差的 DNA 模板。应执行一系列简单的实验来确定转录反应失败的原因；随附的流程图概述

RNA测序简介

of uncharacterized species, and many other applications（未知物种的转录组组装和其他应用）. 关于Lexogen，产品更多专注于短读长RNA测序工作流程（当然也有可用于长读长测序的全长cDNA扩增试剂盒）。试验程序的一般大纲如下:   从样本中分离出RNA，并除去污染的DNA，例如，用DNase处理。 如果需要，则对RNA进行预处理，即通过polyA选择或rRNA去除来富集mRNA。 RNA片段化（如果使用无片段化建库流程

​三句话读懂一篇 CNS，胎盘其实更像肿瘤组织，可能是遗传缺陷和不良妊娠之源...

，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在 Nature Biotechnology 杂志上发表了论文 Comprehensive profiling of circular RNAs with nanopore sequencing and CIRI-long ， 利用随机引物对环形 RNA 进行的滚环反转录扩增后，使用纳米孔测序技术对环形 RNA 的全长序列进行直接测序。这种高效测定环形 RNA 全长转录本的实验，结合 CIRI-long 计算方法，有效地实现了对长测序读段中的环形 RNA 序列