手机验证
询价列表
暂时没有已询价产品
微信扫一扫分享
分享到新浪微博
分享到丁香园论坛
μCaler® MRD Sol
企业认证
标准品变异一致性分析
样本来源于泛肿瘤 800 gDNA 标准品 (Genewell, GW-OGTM800) 健康人类基因组 DNA (Promega, G1471) 分别按 10:0 和 1:9 混合,人工模拟不同突变频率。泛肿瘤 800 gDNA 标准品不同突变位点的理论突变频率如下:
图 3. μCaler® Panel 和 Traditional Panel 捕获数据中变异频率与标准品频率的一致性。30 ng 模拟样本利用 μCaler® Hybrid System 和传统杂交捕获体系, 分别以 μCaler® Panel 和 Traditional Panel 完成杂交捕获,DownSampling 每样本数据至去重前 80,000x 测序深度分析突变的检出一致性 (预文库含 UMI 分子标签),分析过滤标准为单链一致性序列 (family size ≥ 3) (SSCS ≥ 3)。测序模式为 Illumina Novaseq 6000,PE150。
定制 SNP 组合模拟低频突变的极限检出
样本来源于 2 名健康捐献者的 gDNA 分别以 99:1、999:1 以及 9999:1 的比例混合,人工模拟不同突变频率。
图 4. μCaler® Panel 和 Traditional Panel 对低频突变的检出表现。50 ng 模拟样本利用 μCaler® Hybrid System 和传统杂交捕获体系, 分别以 μCaler® Panel (~ 3 Kb target region,覆盖 30 个等位基因位点) 和 Traditional Panel (~ 42 Kb target region,覆盖 160 个等位基因位点,包含上述 30 个位点) 完成杂交捕获,3 次 Downsampling 每一对样本至同一深度 (预文库含 UMI 分子标签),以双链一致性序列 (DCS211) 以及 SSCS ≥ 3 分析突变位点的检出情况。支持突变的平均有效 reads ≥1 判为阳性。测序模式为 Illumina Novaseq 6000,PE150。
图 5. μCaler® Panel 和 Traditional Panel 对低频突变的检出及理论检出的比较分析。注:Theoretical number of mutation 为 DCS211 深度 2,750x,不同突变频率做 10,000 次随机取样,突变检出的分布规律。仅限研究使用,不用于临床诊断。
风险提示:丁香通仅作为第三方平台,为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全,合理判断,谨慎选购商品,商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品,请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
资料下载:
μCaler® MRD Solution (for Illumina®).pdf 附件下载 (下载 0 次)
请 [登录] 后再下载!
需要更多技术资料 索取更多技术资料
μCaler® MRD Solution (for Illumina®).pdf 附 (下载 0 次)
马上登录 或注册,即可保存询价历史