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SMURF/5R 微生物 菌群
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北京亿鸣复兴生物技术有限公司
16S多区域测序技术(SMURF/5R)
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★服务描述:菌种鉴定研究手段,有别于宏基因组、常规16S,有时由于微生物含量过少,多数不能满足宏基因组的建库所需DNA的量,SMURF/5R技术是扩增并测序了5段V区(68%的长度)合并分析,这个方法得到的结果接近于三代16S全长的物种分辨率。可应用于任何一组扩增子,从而实现有效的下游分析。越来越多的研究者已不满足于常规16S技术,主要原因是常规16s方法(如V3V4)仅能在属水平进行准确鉴定,所获得结果无法进一步揭示菌群在代谢和功能分类上的具体作用。寻求“种”水平分辨率鉴定已经成为各个研究领域的迫切需求。为此,一个以色列团队开发了16S多区域测序技术(SMURF/5R)。这是一个基于多重PCR技术,涵盖了16S高变区中的5个,可达到“种”水平的鉴定分辨率。SMURF/5R技术已经在CELL、Science及Nature Communication等30多篇国际权威杂志上采用,充分体现出该技术的研究热度。★适用范围:常规组织、外泌体、肿瘤、FFPE、骨骼等等,但凡做转录组项目的样本都可以加测细菌外泌体测序目前已应用于: 肠道微生物、生殖道微生物、肿瘤微生物、胚胎微生物、海洋微生物、口腔微生物、牛奶微生物、土壤微生物、空气微生物、尿液微生物、胃液微生物等等
★技术优势 :覆盖区域长——测序覆盖了16S rDNA基因上的5个区域,约占全长的68%。鉴定“种”多——更长的16S rDNA基因覆盖,鉴定出更多更准的菌“种”。检测灵敏度高——胜任低微生物量样本如肿瘤组织的菌群检测。样本宽容度大——适用降解样本中的菌群检测。
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