动物模型建立
诱导癌症恶病质并比较基因型差异。
对8周龄雄性和雌性WT和Bnip3 KO小鼠皮下注射LLC细胞或PBS,肿瘤发展4周。
Global mitophagy inhibition via BNIP3 ablation is not sufficient to alleviate skeletal muscle impairments in male and female tumor-bearing mice
包含动物模型(LLC荷瘤小鼠)、体内功能检测、组织学、线粒体功能检测和分子生物学验证。
8周龄雄性C57BL/6小鼠(WT和Bnip3 KO) 8周龄雌性C57BL/6小鼠(WT和Bnip3 KO) LLC荷瘤小鼠模型
BNIP3敲除效率:通过mRNA水平验证,KO小鼠中Bnip3 mRNA低于检测限 肿瘤接种:皮下双侧注射1×10^6 LLC细胞或等量PBS,肿瘤发展4周 肌肉功能:背屈肌体内等长扭矩和疲劳性评估 蛋白质合成:通过D2O标记测量腓肠肌分数合成率 线粒体功能:通过呼吸控制比(RCR)评估跖肌和白色腓肠肌
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
诱导癌症恶病质并比较基因型差异。
对8周龄雄性和雌性WT和Bnip3 KO小鼠皮下注射LLC细胞或PBS,肿瘤发展4周。
评估癌症恶病质和基因型对肌肉功能的影响。
通过体内电生理评估前胫骨肌的扭矩和疲劳性。
评估肌肉蛋白质合成速率的变化。
通过D2O标记测量腓肠肌分数合成率(FSR)。
评估线粒体呼吸功能和动力学。
分析跖肌和白色腓肠肌的呼吸控制比(RCR),并使用pMitoTimer荧光评估线粒体应激和退化。
评估肌肉萎缩相关基因表达和纤维类型组成。
通过RT-qPCR测量基因表达,通过免疫印迹测量蛋白质水平,通过免疫组化评估TA横截面积和纤维类型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | LLC细胞(CRL-1642) | ATCC | CRL-1642 |
| DMEM培养基(11965092) | Life Technologies | 11965092 | |
| 胎牛血清(26140079) | Life Technologies | 26140079 | |
| 青霉素/链霉素(15140122) | Life Technologies | 15140122 | |
| 胰蛋白酶(15050057) | ThermoFisher Scientific | 15050057 | |
| 质粒扩增 | PureLink HiPure质粒过滤Maxiprep试剂盒(K211017) | Life Technologies | K211017 |
| 肌肉收缩力测试 | Aurora Scientific伺服电机(型号300B-LR) | Aurora Scientific | Model |
| Grass Technologies铂电极(型号E2-12) | Grass Technologies | Model | |
| Grass Technologies刺激器(型号S48和SIU5) | Grass Technologies | Model | |
| 荧光显微镜 | 尼康Eclipse Ti-S倒置荧光显微镜 | Nikon | -- |
| 线粒体呼吸测量 | Hansatech氧电极 | Hansatech | -- |
| Hamilton 701RN注射器 | Hamilton | 701RN | |
| 蛋白质合成测量 | 重水(151882-1L) | Millipore Sigma | 151882-1L |
| 安捷伦GC-MS(7890 A和5977 A) | Agilent | 7890 | |
| Bead Mill 24匀浆机 | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RNA提取试剂盒(K145002) | Invitrogen | K145002 | |
| Bio-Tek Power Wave XC酶标仪 | BioTek Instruments Inc. | -- | |
| cDNA合成 | VILO Superscript试剂(11755050) | Invitrogen | 11755050 |
| RT-qPCR | TaqMan预混液(4444964) | Applied Biosystems | 4444964 |
| QuantStudio3 PCR仪 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| SYBR Green预混液(4367660) | Applied Biosystems | 4367660 | |
| 免疫印迹 | RC/DC蛋白浓度测定试剂盒(5000122) | Bio-Rad | 5000122 |
| PVDF膜(88520或88518) | Thermofisher | 88520 | |
| LC3抗体(4108) | Cell Signaling Technology | 4108 | |
| p-p38 MAPK抗体(9211) | Cell Signaling Technology | 9211 | |
| p38 MAPK抗体(9212) | Cell Signaling Technology | 9212 | |
| OPA1抗体(sc-367890) | Santa Cruz | sc-367890 | |
| DRP1抗体(14647) | Cell Signaling Technology | 14647 | |
| BNIP3抗体(3769) | Cell Signaling Technology | 3769 | |
| VDAC抗体(4866S) | Cell Signaling Technology | 4866S | |
| 免疫荧光 | Dystrophin抗体(ab15277) | Abcam | ab15277 |
| MyHC IIA抗体(SC-71) | Developmental Studies Hybridoma Bank | SC-71 | |
| MyHC IIB抗体(BF-F3) | Developmental Studies Hybridoma Bank | BF-F3 | |
| Alexa Fluor 647驴抗兔IgG | -- | -- | |
| Alexa Fluor 488山羊抗小鼠IgG1 | -- | -- | |
| Alexa Fluor 555山羊抗小鼠IgM | -- | -- | |
| 组织学 | 蔡司AxioImager M2显微镜 | Carl Zeiss Microscopy | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | 小鼠品系、年龄、性别、基因型(WT vs Bnip3 KO)、肿瘤细胞系(LLC)、注射途径(皮下双侧)、细胞数量(1×10^6)、对照组(PBS)、肿瘤发展时间(4周) 阅读提示:Methods: Animal Interventions |
| 肌肉功能测试 | 使用设备(Aurora servomotor)、电极型号、刺激频率范围、疲劳测试参数(120次刺激、40Hz) 阅读提示:Methods: In vivo Muscle Contractility Test |
| 蛋白质合成测量 | D2O注射剂量(20 μL/g)、注射时间(24小时前)、饮用水D2O浓度(4%)、取样肌肉(腓肠肌)、分析方法(GC-MS) 阅读提示:Methods: Fractional Synthetic Rate (FSR): Protein Synthesis |
| 线粒体功能 | 肌肉类型(植物肌和白色腓肠肌)、缓冲液、底物浓度(乙酸盐、苹果酸盐、ADP)、寡霉素浓度(10 μg/mL) 阅读提示:Methods: Mitochondrial Respiratory Control Ratio (RCR) |