验证TLR4-Lyn相互作用
确定Lyn是否与TLR4直接结合并响应红细胞刺激
通过免疫共沉淀检测RBC刺激或SAH后脑组织中TLR4与Lyn的结合,并通过免疫荧光观察共定位。
Macrophage Lyn Kinase Is a Sex-Specific Regulator of Post-Subarachnoid Hemorrhage Neuroinflammation
包含细胞特异性Lyn敲除小鼠模型、体外细胞实验、空间转录组、人类3D脑模型及患者CSF样本,多层级验证了Lyn在TLR4信号中的功能。
C57BL/6小鼠蛛网膜下腔出血模型 Cx3Cr1CreERT2:Lynfl/fl骨髓巨噬细胞条件性敲除小鼠 Tmem-119CreERT2:Lynfl/fl小胶质细胞条件性敲除小鼠 人源3D脑模型 SAH患者脑脊液样本 原代小胶质细胞和骨髓来源巨噬细胞
Lyn基因敲除的细胞类型:小胶质细胞特异性(Tmem-119CreER)或巨噬细胞特异性(Cx3Cr1CreER) SAH模型:视交叉前单次注射60μL动脉血 分析时间点:术后第7天 性别:雄性和雌性小鼠分别分析 样本量:每组4只(部分实验n=10)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Lyn是否与TLR4直接结合并响应红细胞刺激
通过免疫共沉淀检测RBC刺激或SAH后脑组织中TLR4与Lyn的结合,并通过免疫荧光观察共定位。
比较小胶质细胞和BMM在RBC刺激下的信号蛋白表达变化
通过免疫印迹检测TLR4、Lyn、磷酸化Lyn、MyD88、IκB激酶α、核因子-κB的表达。
确定小胶质细胞和BMM中TLR4和Lyn的表达差异及性别差异
流式细胞术分析CD11b+细胞,通过tSNE图显示TLR4和Lyn共表达,并量化不同细胞亚群的表达。
比较雄性和雌性SAH小鼠巨噬细胞产生的炎症因子水平
通过流式细胞术检测细胞内干扰素-γ,并用免疫组化验证,同时进行空间转录组分析。
比较雄性和雌性SAH小鼠巨噬细胞吞噬红细胞的能力
流式细胞术检测Ter-119+细胞比例,代表红细胞吞噬。
比较雄性和雌性SAH小鼠的神经元损伤和认知能力
通过Caspase-3免疫组化染色检测海马齿状回神经元凋亡,并通过Barnes迷宫测试评估认知功能。
确定Lyn缺失对炎症、神经元凋亡和认知的影响
使用小胶质细胞特异性(Tmem-119CreER)和巨噬细胞特异性(Cx3Cr1CreER)Lyn敲除小鼠,重复上述炎症、凋亡和认知测试。
揭示Lyn缺失对巨噬细胞转录组和信号通路的影响
对WT和Lyn cKO SAH小鼠脑组织进行空间转录组分析,比较基因表达差异和通路富集。
验证Lyn表达和炎症反应的性别差异是否在人类中存在
用SAH患者CSF处理人3D脑模型,免疫组化检测Lyn和Tmem-119;流式细胞术分析CSF中巨噬细胞Lyn、TLR4和干扰素-γ表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | C57BL/6小鼠 | Jackson Laboratory | Stock 000664 |
| CD45.1 BL/6小鼠 | Jackson Laboratory | Stock 002014 | |
| Cx3Cr1CreERT2小鼠 | Jackson Laboratory | stock no. 021160 | |
| Tmem-119CreERT2小鼠 | Jackson Laboratory | stock no. 031820 | |
| Lynfl/fl小鼠 | Dr Clifford Lowell at University of California San Francisco | -- | |
| 手术 | 27号针头 | BD Needles | Catalog No. 405081 |
| 免疫沉淀 | 蛋白AG-琼脂糖珠 | Pierce Invitrogen | -- |
| 兔抗TLR4抗体 | CST | Catalog No. 14358 | |
| 免疫印迹 | 4-20%预制梯度凝胶 | Bio-Rad | Catalog No. 4561083 |
| PVDF膜 | Millipore | Catalog No. IPFL00005 | |
| Trans-Blot Turbo转印系统 | Bio-Rad | -- | |
| 印迹级封闭剂 | Bio-Rad | 1 706 404 | |
| 兔抗Lyn抗体 | CST | 2796S | |
| 兔抗磷酸化Lyn抗体 | Bioss | bs-3257R | |
| 小鼠抗TLR4抗体 | Invitrogen | 14-9041-80 | |
| 兔抗GAPDH抗体 | CST | 2118S | |
| 兔抗MyD88抗体 | CST | 4283S | |
| 兔抗NF-κB抗体 | CST | 8242T | |
| 兔抗IKKα抗体 | CST | 61294 | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Invitrogen | 31460 | |
| 山羊抗小鼠IgG二抗 | Invitrogen | 31430 | |
| Bio-Rad Chemi-doc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 流式细胞术 | 碎片去除溶液 | Miltenyi Biotec | 130-109-398 |
| Fc受体阻断剂 | BioLegend | 101320 | |
| APC-CY7-CD11b抗体 | BioLegend | 101226 | |
| PB-CD45抗体 | BioLegend | 103126 | |
| AF700-CD45.1抗体 | BioLegend | 110724 | |
| APC-CX3CR1抗体 | BioLegend | 149008 | |
| PE-Tmem119抗体 | Invitrogen | 12-6119-82 | |
| FITC-Ter-119抗体 | BioLegend | 116206 | |
| PE-CY7-IFNγ抗体 | Tonbo Biosciences | TB-60-7311-U025 | |
| 红细胞裂解液 | BioLegend | -- | |
| 人TruStain FcX Fc受体阻断剂 | BioLegend | 422302 | |
| AF-700-CD14抗体 | BioLegend | 301822 | |
| APC-pLyn抗体 | CST | 78740 | |
| PE-CD163抗体 | BD Biosciences | 556018 | |
| PerCP-Cy5.5-TLR4抗体 | Bioss | bs-1021R | |
| PE-CY7-IFNγ抗体 | BD Biosciences | 557643 | |
| 免疫组化 | Leica CM3050 S冷冻切片机 | Leica | -- |
| 兔单克隆Lyn抗体 | Cell Signaling Technology | 5568 | |
| 小鼠单克隆TLR4抗体 | Cell Signaling Technology | 41134 | |
| DAPI | Vector | 561483 | |
| 小鼠单克隆Tmem-119抗体 | Cell Signaling Technology | 41134 | |
| 兔单克隆IFNγ抗体 | Cell Signaling Technology | 41134 | |
| 抗兔-488二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗小鼠-555二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 凋亡检测 | 抗兔-488 Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 |
| 共聚焦显微镜 | 尼康A1R HD25倒置共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| 空间转录组 | NanoString GeoMx数字空间分析仪 | NanoString | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、性别;SAH手术方法(视交叉前注射60μL动脉血,注射速度15秒,针头角度40度,留针3分钟);他莫昔芬给药方案(4mg,0.02mg/μL,皮下注射,实验前2周) 阅读提示:Methods: Animals; In Vivo SAH Induction in Mouse |
| 细胞培养 | 原代小胶质细胞和BMM的分离和培养条件,RBC刺激浓度和时间(100μL RBC,2小时或15分钟-24小时) 阅读提示:Methods: Immunoblotting; Figure 1 legend |
| 流式细胞术 | 脑细胞分离方法,抗体克隆号及稀释度,门控策略(CD11bhiCD45med为小胶质细胞,CD11bhiCD45hi为BMM),吞噬检测(Ter-119),细胞因子检测(IFNγ) 阅读提示:Methods: Flow Cytometry of Mouse Brain Cells; Figure S2 and S3 |
| 空间转录组 | 组织处理(冷冻切片厚度10μm),ROI选择(4个650x650μm,位于下丘脑),基因集富集分析方法 阅读提示:Methods: Digital Spatial Transcriptomics; Data S1 |
| 认知功能测试 | Barnes迷宫训练和测试方案(训练7天,每天3次,每次3分钟,测试从SAH后第1天开始,持续7天,第4天转换目标位置) 阅读提示:Methods: Spatial Learning Assessment Using the Barnes Maze |