体内外验证HEG1表达受血流调控
验证HEG1是否受稳定血流和紊乱血流差异调控
通过scRNA-seq、基因芯片、qPCR和HCR检测小鼠颈动脉中Heg1表达;在HAECs中施加ULS和OSS,检测mRNA和蛋白表达。
HEG1 Protects Against Atherosclerosis by Regulating Stable Flow-Induced KLF2/4 Expression in Endothelial Cells
包含体外细胞实验(siRNA、剪切应力、功能分析)、机制研究(通路抑制剂、Co-IP)、两种小鼠动脉粥样硬化模型(PCL和慢性饮食模型)及人冠状动脉样本分析。
人主动脉内皮细胞(HAECs) 内皮特异性HEG1敲除小鼠(HEG1iECKO) 部分颈动脉结扎(PCL)小鼠模型 慢性西方饮食诱导动脉粥样硬化小鼠模型
HEG1 siRNA敲低效率及对KLF2/4表达的影响 MEKK3-MEK5-ERK5通路在ULS响应中的作用(磷酸化ERK5水平) KRIT1蛋白在ULS后的细胞内水平及释放到培养基中的变化 HEG1iECKO小鼠中HEG1敲除效率(通过HCR和qPCR验证) PCL模型中AAV-PCSK9注射和西方饮食的持续时间及剂量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证HEG1是否受稳定血流和紊乱血流差异调控
通过scRNA-seq、基因芯片、qPCR和HCR检测小鼠颈动脉中Heg1表达;在HAECs中施加ULS和OSS,检测mRNA和蛋白表达。
确定HEG1是否介导稳定血流诱导的内皮保护功能
使用siRNA敲低HAECs中的HEG1,检测单核细胞黏附、通透性和迁移变化,以及VCAM1和eNOS表达。
研究HEG1是否通过KRIT1和MEKK3-MEK5-ERK5通路调控KLF2/4表达
检测HEG1敲低对ERK5磷酸化和KLF2/4表达的影响;使用MEKK3、MEK5、ERK5抑制剂处理;Co-IP验证HEG1与KRIT1结合。
建立HEG1iECKO小鼠模型以研究HEG1在成人动脉粥样硬化中的作用
通过CRISPR/Cas9生成loxP-flanked HEG1小鼠,与Cdh5-CreERT2小鼠杂交,他莫昔芬诱导敲除,并通过HCR和qPCR验证敲除效率。
确定内皮HEG1缺失是否加剧动脉粥样硬化
在PCL模型和慢性模型中,比较HEG1iECKO和WT小鼠的斑块面积、坏死核心、纤维帽厚度、炎症细胞浸润、脂质沉积等。
评估人冠状动脉中HEG1表达是否与动脉粥样硬化严重程度相关
收集人左前降支冠状动脉,免疫荧光染色检测HEG1和CD31,并根据AHA分级评估斑块严重程度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MCDB 131培养基 | Corning | 15-100-CV |
| 胎牛血清 | R&D Systems | S11550 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | 25030-081 | |
| 内皮细胞生长补充物 | -- | -- | |
| L-抗坏血酸 | Sigma | A5960 | |
| 氢化可的松 | Sigma-Aldrich | H088 | |
| 表皮生长因子 | STEMCELL Technologies | 78006 | |
| 胰岛素样生长因子1 | R&D Systems | 291-G1 | |
| 成纤维细胞生长因子 | ProSpec | cyt-218-b | |
| 血管内皮生长因子 | BioLegend | 583706 | |
| 明胶 | Sigma | G1890 | |
| DMEM培养基 | Corning | 15-013-CV | |
| 剪切应力实验 | ibidi泵系统 | ibidi | 10902 |
| μ-Slide I0.4 Luer ibiTreat通道 | ibidi | 80176 | |
| qPCR | QIAzol裂解试剂 | Qiagen | 79306 |
| Direct-zol RNA小提试剂盒 | Zymo Research | R2052 | |
| miRNeasy小提试剂盒 | Qiagen | 217084 | |
| High Capacity cDNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368813 | |
| PerfeCTa SYBR Green FastMix | QuantaBio | 95073-05K | |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | 4376600 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Boston BioProducts | BP-115 |
| cOmplete Mini蛋白酶抑制剂混合物 | Roche Diagnostics GmbH | 11836153001 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物1 | Sigma | P2850 | |
| Amicon Ultra-15离心过滤器 | Millipore | UFC905024 | |
| Amicon Ultra-15离心过滤器 | Millipore | UFC910024 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | 1620174 | |
| 抗β-肌动蛋白小鼠单克隆抗体 | Sigma-Aldrich | A5316 | |
| 抗Calnexin兔多克隆抗体 | Abcam | ab75801 | |
| 抗eNOS小鼠单克隆抗体 | BD Biosciences | 610297 | |
| 抗ERK5兔多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3372 | |
| 抗HEG1 SKM9-2小鼠单克隆抗体 | -- | -- | |
| 抗KLF2兔多克隆抗体 | Sigma-Aldrich | 09-820 | |
| 抗KLF4兔单克隆抗体 | Abcam | ab215036 | |
| 抗KRIT1兔单克隆抗体 | Abcam | ab196025 | |
| 抗MEKK3小鼠单克隆抗体 | R&D Systems | MAB6095 | |
| 抗VCAM1兔单克隆抗体 | Abcam | 134047 | |
| 山羊抗小鼠IgG HRP | Cayman Chemical | 10004302 | |
| 山羊抗兔IgG HRP | Cayman Chemical | 10004301 | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Millipore | WBKLS0500 | |
| iBright FL1000成像系统 | -- | -- | |
| 免疫细胞化学 | 抗HEG1 10G10小鼠单克隆抗体 | -- | -- |
| 抗VE-钙黏蛋白兔多克隆抗体 | Abcam | ab33168 | |
| 山羊抗小鼠AlexaFluor 568多克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | A11004 | |
| 驴抗兔AlexaFluor 488多克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | A21206 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma Aldrich | A7906 | |
| 含DAPI的Fluoroshield封片剂 | Sigma Aldrich | F6057 | |
| Hoechst染色 | Thermo Fisher Scientific | H3670 | |
| siRNA敲低 | Oligofectamine转染试剂 | Invitrogen | 12252-011 |
| 阴性对照DsiRNA | IDT | 51-01-14-04 | |
| 内皮功能研究 | THP-1单核细胞 | ATCC | TIB-202 |
| BCECF-AM荧光染料 | Thermo Fisher Scientific | B1150 | |
| FITC标记的亲和素 | -- | -- | |
| BZ-X系列一体化荧光显微镜 | Keyence | -- | |
| 质粒过表达和病毒转导 | pCMV6-HEG1-MycDDK质粒 | Origene | RC212168 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000-015 | |
| Ad-GFP腺病毒 | Welgen | V1020 | |
| Ad-KLF4腺病毒 | Welgen | S3000 | |
| 聚凝胺感染试剂 | Santa Cruz Biotechnology | sc-134220 | |
| 免疫共沉淀 | Pierce IP裂解缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 87787 |
| Pierce抗c-Myc磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 88842 | |
| Pierce抗HA磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 88836 | |
| Laemmli还原SDS上样缓冲液 | Boston BioProducts | BP-111R | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 小鼠通透性研究 | DiI标记的低密度脂蛋白 | Kalen Biomedical | -- |
| 小鼠动脉粥样硬化研究 | AAV-PCSK9 | -- | -- |
| 西方饮食 | Harlan | TD.88137 | |
| 油红O | Sigma-Aldrich | MAK194 | |
| Movat五色染色 | StatLab | KTRMPPT | |
| Nanozoomer-SQ数字切片扫描仪 | Hamatsu | C13140-01 | |
| 抗CD68小鼠单克隆抗体 | Bio-Rad | MCA1957 | |
| 山羊抗大鼠AlexaFluor 568多克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | A11077 | |
| Beckman CX7生化分析仪 | Beckman | -- | |
| HESKA血液分析仪 | HESKA | -- | |
| 人冠状动脉研究 | 抗HEG1 SKM9-2小鼠单克隆抗体 | -- | -- |
| 抗CD31兔多克隆抗体 | Abcam | ab28364 | |
| Alexa Fluor-647荧光染料 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 统计 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| HEG1表达验证 | scRNA-seq数据集来源;PCL术后时间点;HAECs剪切应力参数(ULS 15 dyn/cm2, OSS ±5/−4 dyn/cm2) 阅读提示:Methods: scRNA-seq and Gene Array; Cell culture; In vitro shear stress experiments |
| siRNA敲低实验 | siRNA序列;敲低效率;处理时间 阅读提示:Methods: siRNA knockdown; Figure legends 3 |
| 功能实验 | 单核细胞黏附实验的THP-1细胞数量;通透性实验的FITC-avidin浓度;迁移实验的划痕时间和血清浓度 阅读提示:Methods: Endothelial function studies; Figure legends 3 |
| 机制实验 | Ponatinib、BIX02189、XMD8-92的浓度;Co-IP的抗体和磁珠类型 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation; Figure legends 4,5 |
| 小鼠模型 | 他莫昔芬注射剂量和方案;AAV-PCSK9剂量;Western diet持续时间;PCL手术步骤 阅读提示:Methods: HEG1iECKO mice; PCL surgery; Mouse atherosclerosis studies; Figure legends 6,7 |
| 人冠状动脉分析 | 供体信息;组织处理;斑块分级标准 阅读提示:Methods: Human coronary artery studies; Figure legends 8 |