STAT3激活与纤毛的关系
验证初级纤毛是否调节STAT3激活及其机制
在iPkd1ΔTub小鼠中敲除Kif3a以消除纤毛,检测肾组织pSTAT3Y705水平;在MDCK细胞中敲低Kif3a或Ift88,检测STAT3磷酸化。
Tubular STAT3 Limits Renal Inflammation in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
包含体内条件性基因敲除小鼠模型(Pkd1、Stat3、Kif3a、Ccl2)及体外细胞实验,验证了功能与机制。
iPkd1ΔTub小鼠模型 iPkd1ΔTub; iStat3ΔTub小鼠模型 MDCK细胞系(Kif3a-i、Ift88-i) mIMCD-3细胞系(Stat3敲低)
多西环素处理时间:P28至P42,2 mg/ml 实验用雄性小鼠 mIMCD-3细胞LPS刺激浓度:1 µg/ml 肾小管Stat3敲除效率:Western blot验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证初级纤毛是否调节STAT3激活及其机制
在iPkd1ΔTub小鼠中敲除Kif3a以消除纤毛,检测肾组织pSTAT3Y705水平;在MDCK细胞中敲低Kif3a或Ift88,检测STAT3磷酸化。
检验CCL2是否介导纤毛依赖性STAT3激活
在iPkd1ΔTub小鼠中敲除Ccl2,检测STAT3磷酸化及下游靶基因表达。
确定STAT3是否介导Pkd1缺失引起的早期肾脏增大
在iPkd1ΔTub小鼠中敲除Stat3,在13周龄(7周后处理)评估肾脏大小、囊肿前期生长。
评估Stat3缺失对明显囊性病变和肾功能下降的影响
将iPkd1ΔTub和iPkd1ΔTub; iStat3ΔTub小鼠饲养至18周龄(12周后处理),分析生存、肾脏大小、囊肿面积、肾功能指标。
探索Stat3缺失对肾脏炎症的影响及机制
对iPkd1ΔTub; iStat3ΔTub肾脏进行组织学评分、免疫标记和炎症因子表达分析;在mIMCD-3细胞中敲低STAT3并用LPS刺激,检测趋化因子表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因敲除诱导 | 多西环素盐酸盐 | Abcam | ab141091 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F7524 | |
| 青霉素-链霉素 | Life Technologies | 15140122 | |
| F-12营养混合物 | Gibco | 21765037 | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Invivogen | tlrl-3pelps |
| RNA提取 | NucleoSpin RNA提取试剂盒 | Macherey Nagel | -- |
| 逆转录 | High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qPCR | iTaq通用SYBR Green预混液 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白质提取 | NePer核浆分离试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | A23225 | |
| Western blot | 4%–20%梯度胶 | Bio-Rad | -- |
| 凋亡检测 | 原位细胞死亡检测试剂盒5 | Roche | 11684795910 |
| 免疫组化 | 柠檬酸盐缓冲液 | Zytomed | ZUCD28 |
| 亲和素/生物素封闭液 | Vector Laboratories | SP-2001 | |
| 辣根过氧化物酶标记链霉亲和素 | Southern Biotech | 7100-05 | |
| Western blot抗体 | pSTAT3Y705抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 |
| STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9132 | |
| GAPDH抗体 | Millipore | MAB374 | |
| α-微管蛋白抗体 | Sigma | T5168 | |
| Lamin A/C抗体 | Abcam | ab108922 | |
| RELA抗体 | Cell Signaling Technology | 4764 | |
| 免疫组化抗体 | STAT3α抗体 | Cell Signaling Technology | 8768 |
| F4/80抗体 | Bio-Rad | MCA497R | |
| CD3抗体 | Abcam | ab16669 | |
| LY6B抗体 | Abcam | ab53457 | |
| CXCL10抗体 | Abcam | ab9807 | |
| KI67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| 组织学分析 | Konelab 20i分析仪 | Thermo Scientific | -- |
| 显微镜 | E800显微镜 | Nikon | -- |
| Nanozoomer 2.0扫描仪 | Hamamatsu | -- | |
| 图像分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| 统计 | GraphPad Prism 6 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 基因敲除小鼠模型 | 多西环素浓度和给药时间;基因敲除的启动和持续时间;小鼠遗传背景;性别 阅读提示:Methods部分“Mice”小节 |
| 细胞培养与处理 | 细胞密度;多西环素处理浓度和时间;LPS浓度和刺激时间;血清剥夺时间 阅读提示:Methods部分“Cell Culture”小节 |
| 分子检测 | qPCR引物序列;抗体稀释比例;蛋白上样量;凝胶浓度 阅读提示:Methods部分“Quantitative Real-Time PCR”、“Western Blot”和“Antibodies”小节 |
| 组织学分析 | 肾组织固定、包埋、切片厚度;染色方法;图像定量参数 阅读提示:Methods部分“Morphologic Analysis”小节 |