PTEN对PTK6激活和下游信号的调控
验证PTEN是否负调控PTK6激活及其致癌信号。
在PC3细胞中稳定表达空载体、PTEN或PTEN G129R,检测PTK6 PY342、PY447及下游FAK/BCAR1磷酸化;在DU145细胞中用shRNA敲低PTEN,检测PTK6激活和下游信号。
PTEN is a protein phosphatase that targets active PTK6 and inhibits PTK6 oncogenic signaling in prostate cancer.
涵盖细胞系、体外重组蛋白、小鼠模型和人组织微阵列多个证据层级,并进行功能与机制验证。
PC3前列腺癌细胞系 DU145前列腺癌细胞系 PB-Cre4 Ptenflox/flox小鼠模型 人前列腺癌组织微阵列(CPCTR TMA1)
PC3细胞中稳定表达空载体、PTEN或PTEN G129R对PTK6 PY342和PY447的影响 DU145细胞中shRNA敲低PTEN对PTK6 PY342及下游FAK/BCAR1磷酸化的影响 体外磷酸酶实验中PTEN剂量对PTK6 Y342去磷酸化的作用 PB-Cre4 Ptenflox/flox与Ptk6−/−杂交小鼠8月龄时前列腺肿瘤发生率 人前列腺癌TMA中PTEN表达与PTK6 PY342的相关性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PTEN是否负调控PTK6激活及其致癌信号。
在PC3细胞中稳定表达空载体、PTEN或PTEN G129R,检测PTK6 PY342、PY447及下游FAK/BCAR1磷酸化;在DU145细胞中用shRNA敲低PTEN,检测PTK6激活和下游信号。
确定PTEN与PTK6相互作用的区域。
用GST-PTK6结构域融合蛋白进行pull-down实验,检测与内源性PTEN的结合;在PC3细胞中进行免疫共沉淀。
确定PTEN的蛋白磷酸酶活性是否足以去磷酸化PTK6 Y342。
在PC3细胞中表达多种PTEN突变体,检测PTK6 Y342和Y447磷酸化;体外磷酸酶实验比较PTEN、PTP1B、SHP1和CD45对PTK6的去磷酸化能力。
验证Ptk6缺失是否影响Pten缺失诱导的前列腺肿瘤发生。
将PB-Cre4 Ptenflox/flox小鼠与Ptk6−/−小鼠杂交,8月龄时进行组织病理学评分和增殖标志物检测。
评估PTEN缺失与PTK6激活在临床样本中的关系。
对CPCTR TMA1进行PTK6 PY342和PTEN双重免疫荧光染色并评分;分析TCGA和Grasso数据集中的基因表达相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫印迹 | 人PTK6抗体(Brk C-18) | Santa Cruz Biotechnology | sc-1188 |
| 免疫组织化学 | 小鼠PTK6抗体(Brk C-17) | Santa Cruz Biotechnology | sc-916 |
| 免疫印迹 | 单克隆PTK6抗体(Brk G-6) | Santa Cruz Biotechnology | sc-166171 |
| 免疫印迹/免疫荧光 | FAK抗体(C-20) | Santa Cruz Biotechnology | sc-558 |
| 免疫印迹 | E-钙黏蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7870 |
| 磷酸酪氨酸抗体(PY20) | Santa Cruz Biotechnology | sc-508 | |
| 免疫荧光 | 细胞角蛋白14抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53253 |
| 免疫印迹 | SP1抗体(PEP2) | Santa Cruz Biotechnology | sc-59 |
| EGFR抗体 | Millipore | 06-847 | |
| 磷酸酪氨酸抗体(4G10) | Millipore | 05-321 | |
| 免疫印迹/免疫荧光 | PY342-PTK6抗体 | Millipore | 09-144 |
| PY447-PTK6抗体 | Abcam | ab138368 | |
| 免疫荧光 | Ki67抗体 | Abcam | ab16667 |
| 细胞角蛋白8抗体 | Abcam | ab59400 | |
| 免疫印迹/免疫荧光 | AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 |
| 免疫印迹 | 磷酸化AKT(Thr-308)抗体 | Cell Signaling Technology | 9275 |
| 磷酸化AKT(Ser-473)抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 免疫组织化学 | 磷酸化AKT(Ser-473)抗体 | Cell Signaling Technology | 9277 |
| 免疫印迹/免疫荧光 | 磷酸化BCAR1(Tyr-165)抗体 | Cell Signaling Technology | 4015 |
| 磷酸化FAK(Tyr-576/577)抗体 | Cell Signaling Technology | 3281 | |
| 磷酸化FAK(Tyr-925)抗体 | Cell Signaling Technology | 3284 | |
| 免疫印迹 | HA标签抗体(6E2) | Cell Signaling Technology | 2367 |
| PTEN抗体(138G6) | Cell Signaling Technology | 9559 | |
| Myc标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2276 | |
| 免疫印迹/免疫荧光 | BCAR1抗体 | BD Biosciences | 610271 |
| 免疫沉淀对照 | 正常兔IgG | Vector Laboratories | I-1000 |
| 免疫印迹 | β-肌动蛋白抗体(AC-15) | Sigma-Aldrich | A5441 |
| 纽蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | V9264 | |
| 免疫组织化学 | PTEN抗体(6H2.1) | Cascade Bioscience | ABM-2052 |
| 免疫印迹 | GST标签抗体(4C10) | Covance | MMS-112R |
| 驴抗兔二抗(NA934) | GE Healthcare | NA934 | |
| 羊抗鼠二抗(NA931) | GE Healthcare | NA931 | |
| SuperSignal West Dura底物 | Thermo Fisher Scientific | 34075 | |
| 细胞培养/转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| 定点突变 | Q5定点突变试剂盒 | New England Bio Labs | -- |
| 细胞组分分离 | ProteoExtract亚细胞蛋白质组提取试剂盒 | Calbiochem | -- |
| 免疫荧光 | 山羊抗鼠Alexa Fluor 488 | Invitrogen | -- |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 488 | Invitrogen | -- | |
| 链霉亲和素偶联Alexa Fluor 488 | Invitrogen | -- | |
| 链霉亲和素偶联Alexa Fluor 594 | Invitrogen | -- | |
| 4′,6-二脒基-2-苯基吲哚(DAPI) | -- | -- | |
| 蛋白纯化 | 谷胱甘肽-Sepharose 4B珠 | -- | -- |
| BL21 Star (DE3)pLysS感受态细胞 | Life Technologies | -- | |
| 蛋白表达诱导 | 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG) | -- | -- |
| 体外磷酸酶实验 | PTP1B磷酸酶 | Enzo Life Sciences | -- |
| SHP1磷酸酶 | Enzo Life Sciences | -- | |
| CD45胞内结构域 | Enzo Life Sciences | -- | |
| 体外激酶实验 | 通用酪氨酸激酶检测试剂盒 | Takara Clontech | -- |
| 免疫沉淀 | A/G琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 小鼠实验 | 5-溴-2-脱氧尿苷(BrdU) | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系与培养 | PC3和DU145细胞来源及培养条件;稳定转染选择浓度2 μg/ml puromycin 阅读提示:Methods中Expression constructs段落及ATCC指南 |
| PTEN突变体转染 | PTEN突变体类型(C124S、G129R、Y138L、G129E、A4及其组合)及转染效率 阅读提示:Methods中Expression constructs和Site-directed mutagenesis;图4a |
| 体外磷酸酶实验 | PTEN剂量、PTK6用量、缓冲液组成、反应温度30°C和时间1小时 阅读提示:Methods中In vitro phosphatase and kinase assays |
| 小鼠肿瘤模型 | 小鼠基因型、8月龄取材、BrdU注射剂量50 μg/g体重及处死前1小时注射 阅读提示:Methods中Murine prostate cancer models;表1 |
| 人组织微阵列分析 | CPCTR TMA1样本数299例、评分核心数134个来自105例患者、双盲评分 阅读提示:Methods中Human tissue microarray analysis;图6 |