C2激活AMPK亚型选择性及ATP影响
验证C2对不同γ亚型复合物的激活效果及ATP浓度对C2激活的影响。
在COS7细胞中表达AMPK复合物,测定C2(0.1 μM)或AMP(100 μM)激活活性;测定不同ATP浓度(20 μM和2 mM)下C2剂量反应曲线。
Structural basis of allosteric and synergistic activation of AMPK by furan-2-phosphonic derivative C2 binding.
包含晶体结构解析、体外激酶活性测定、突变体验证等多个独立证据层级,并进行了功能验证。
COS7细胞表达的AMPK α1β1γ1等复合物 大肠杆菌表达的AMPK α2β1γ1蛋白 AMPK α2/α1 RIM嵌合体蛋白
C2浓度0.1-5 μM,AMP浓度100 μM,A769662浓度20 μM ATP浓度20 μM(低)或2 mM(近生理) λ-磷酸酶或CaMKK2预处理AMPK γ1突变体T89E、H151E、H298E α1-T172D磷酸化模拟突变体
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证C2对不同γ亚型复合物的激活效果及ATP浓度对C2激活的影响。
在COS7细胞中表达AMPK复合物,测定C2(0.1 μM)或AMP(100 μM)激活活性;测定不同ATP浓度(20 μM和2 mM)下C2剂量反应曲线。
探究C2能否与A769662协同激活去磷酸化AMPK α1和α2。
λ-磷酸酶或CaMKK2预处理AMPK α1和α2,单独或联合加入AMP(100 μM)、C2(0.1 μM)和A769662(20 μM),测定激酶活性。
确定C2在AMPK上的结合位点。
全长α2β1γ1与C2、AMP等共结晶,X射线衍射收集数据,解析结构至2.99 Å。
验证晶体结构揭示的C2结合位点。
在COS7细胞中表达γ1突变体(T89E、H151E、H298E)与α1(T172D)β1γ1,测定C2或AMP激活的激酶活性。
探究α1 RIM2与γ亚基的相互作用强度。
将α2/α1 RIM嵌合体与C2共结晶,解析结构至2.99 Å。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | pan AMPK α抗体 | Cell Signaling Technology | 2793 |
| FLAG抗体 | Cell Signaling Technology | 2368 | |
| HA抗体 | Cell Signaling Technology | 2367 | |
| 磷酸化α-pThr172抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| 磷酸化β-pSer108抗体 | Cell Signaling Technology | 4181 | |
| 去磷酸化处理 | λ-磷酸酶 | Cell Signaling Technology | P0753 |
| Western blot | β1抗体 | Abcam | ab58175 |
| AMPK激活 | A769662 | Abcam | ab120335 |
| 蛋白纯化 | 谷胱甘肽琼脂糖4B | GE Life Sciences | -- |
| 蛋白洗脱 | FLAG肽 | GL Biochem (Shanghai) | -- |
| 转染 | FuGENE HD转染试剂 | Promega | -- |
| 蛋白纯化 | 抗FLAG M2亲和琼脂糖凝胶 | -- | -- |
| 激酶活性测定 | SAMS合成肽 | -- | -- |
| [γ-32P]-ATP | -- | -- | |
| P81离子交换色谱纸 | Whatman, GE Healthcare | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| C2激活AMPK亚型选择性 | C2浓度0.1 μM,AMP浓度100 μM,ATP浓度20 μM或2 mM 阅读提示:Methods中AMPK activity assay及Figure 1图注 |
| C2与A769662协同激活 | λ-磷酸酶或CaMKK2预处理条件(1小时,22°C),AMP 100 μM、C2 0.1 μM、A769662 20 μM 阅读提示:Methods中Protein expression and purification for AMPK enzyme assays及Figure 2图注 |
| 晶体结构解析 | 蛋白浓度4 mg/ml,C2二倍或六倍摩尔过量,分辨率2.99 Å 阅读提示:Methods中Crystallization |
| 突变体验证 | C2浓度5 μM,AMP浓度100 μM,γ1突变体T89E、H151E、H298E 阅读提示:Methods中Protein expression and purification for AMPK enzyme assays及Figure 4图注 |