呋喃-2-膦酸衍生物C2结合变构协同激活AMPK的结构基础

Structural basis of allosteric and synergistic activation of AMPK by furan-2-phosphonic derivative C2 binding.

作者信息Christopher G Langendorf, Kevin R W Ngoei, John W Scott, Naomi X Y Ling, Sam M A Issa, Michael A Gorman, Michael W Parker, Kei Sakamoto, Jonathan S Oakhill, Bruce E Kemp
PMID26952388
发布时间2016-03-08
DOI10.1038/ncomms10912

实验完整度

高

包含晶体结构解析、体外激酶活性测定、突变体验证等多个独立证据层级,并进行了功能验证。

主要模型

COS7细胞表达的AMPK α1β1γ1等复合物 大肠杆菌表达的AMPK α2β1γ1蛋白 AMPK α2/α1 RIM嵌合体蛋白

重点核对

C2浓度0.1-5 μM,AMP浓度100 μM,A769662浓度20 μM ATP浓度20 μM(低)或2 mM(近生理) λ-磷酸酶或CaMKK2预处理AMPK γ1突变体T89E、H151E、H298E α1-T172D磷酸化模拟突变体

摘要

代谢应激传感酶AMPK负责根据能量供需调节代谢。激活AMPK的药物可能有助于治疗包括2型糖尿病在内的代谢性疾病。我们解析了AMPK与其激活剂5-(5-羟基-异噁唑-3-基)-呋喃-2-膦酸(C2)的复合物晶体结构,揭示γ亚基上存在两个不同于核苷酸结合位点的C2结合位点。C2与药物A769662协同激活含α1的AMPK复合物,且不依赖上游激酶。我们的结果表明,双药疗法可能是治疗代谢性疾病的有效AMPK靶向策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
确定C2在AMPK上的结合位点,并探究A769662与C2激活AMPK的关系。
核心机制
C2结合于γ亚基的γ-pSite-1和γ-pSite-4,与A769662协同激活AMPK α1复合物,不依赖上游激酶;α1和α2亚型RIM2与γ亚基相互作用强度差异导致α1特异性。
主要证据
C2:AMPK复合物晶体结构(2.99 Å)显示γ亚基两个C2结合位点;体外激酶活性实验显示C2与A769662协同激活λ-磷酸酶处理的α1-AMPK约1040倍,而对α2-AMPK协同作用弱;γ1突变体H151E完全废除C2激活。
研究意义
揭示C2在γ亚基上的新结合位点,为未来合理药物设计提供全新维度;提示双药疗法可能是治疗代谢性疾病的有效AMPK靶向策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

C2激活AMPK亚型选择性及ATP影响

验证C2对不同γ亚型复合物的激活效果及ATP浓度对C2激活的影响。

在COS7细胞中表达AMPK复合物,测定C2(0.1 μM)或AMP(100 μM)激活活性;测定不同ATP浓度(20 μM和2 mM)下C2剂量反应曲线。

2

C2与A769662协同激活AMPK

探究C2能否与A769662协同激活去磷酸化AMPK α1和α2。

λ-磷酸酶或CaMKK2预处理AMPK α1和α2,单独或联合加入AMP(100 μM)、C2(0.1 μM)和A769662(20 μM),测定激酶活性。

3

C2:AMPK复合物晶体结构解析

确定C2在AMPK上的结合位点。

全长α2β1γ1与C2、AMP等共结晶,X射线衍射收集数据,解析结构至2.99 Å。

4

C2结合位点突变验证

验证晶体结构揭示的C2结合位点。

在COS7细胞中表达γ1突变体(T89E、H151E、H298E)与α1(T172D)β1γ1,测定C2或AMP激活的激酶活性。

5

α2/α1 RIM嵌合体晶体结构解析

探究α1 RIM2与γ亚基的相互作用强度。

将α2/α1 RIM嵌合体与C2共结晶,解析结构至2.99 Å。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证蛋白表达与修饰
构建突变体

产品清单

实验环节名称品牌货号
pan AMPK α抗体Cell Signaling Technology2793
FLAG抗体Cell Signaling Technology2368
HA抗体Cell Signaling Technology2367
磷酸化α-pThr172抗体Cell Signaling Technology2535
磷酸化β-pSer108抗体Cell Signaling Technology4181
λ-磷酸酶Cell Signaling TechnologyP0753
β1抗体Abcamab58175
A769662Abcamab120335
谷胱甘肽琼脂糖4BGE Life Sciences--
FLAG肽GL Biochem (Shanghai)--
FuGENE HD转染试剂Promega--
抗FLAG M2亲和琼脂糖凝胶----
SAMS合成肽----
[γ-32P]-ATP----
P81离子交换色谱纸Whatman, GE Healthcare--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
C2激活AMPK亚型选择性
C2浓度0.1 μM,AMP浓度100 μM,ATP浓度20 μM或2 mM
阅读提示:Methods中AMPK activity assay及Figure 1图注
C2与A769662协同激活
λ-磷酸酶或CaMKK2预处理条件(1小时,22°C),AMP 100 μM、C2 0.1 μM、A769662 20 μM
阅读提示:Methods中Protein expression and purification for AMPK enzyme assays及Figure 2图注
晶体结构解析
蛋白浓度4 mg/ml,C2二倍或六倍摩尔过量,分辨率2.99 Å
阅读提示:Methods中Crystallization
突变体验证
C2浓度5 μM,AMP浓度100 μM,γ1突变体T89E、H151E、H298E
阅读提示:Methods中Protein expression and purification for AMPK enzyme assays及Figure 4图注