可诱导PTEN敲低转基因小鼠模型的建立与验证
建立时空特异性调控PTEN表达的RNAi小鼠模型,并验证敲低效率及可逆性。
将针对Pten的shRNA(shPten.1522)通过RMCE靶向Col1a1位点,获得Tet应答元件调控的转基因小鼠;与Vav-tTA等品系杂交,通过Dox调控shRNA表达;用Western blot和流式细胞术验证PTEN敲低及AKT磷酸化变化。
PTEN action in leukaemia dictated by the tissue microenvironment.
包含体外细胞系、可诱导转基因小鼠模型、移植瘤模型、患者样本及多种功能与机制验证(如shRNA竞争实验、PET成像等)。
shPten可诱导转基因小鼠(Vav-tTA;shPten) Rag1−/−和NCR nude小鼠移植瘤模型 小鼠T-ALL细胞系及人T-ALL细胞系(HBP-ALL、TALL1) 人T-ALL和PTCL患者样本
移植细胞数量:1×10^5个细胞经尾静脉注射 Dox处理条件:含625 mg/kg多西环素的饲料,或体外1 μg/ml Dox处理 CCL25刺激浓度与时间:500 ng/ml,15分钟(免疫印迹)或4小时(迁移实验) CCR9抑制剂CCX8037剂量:30 mg/kg,每12小时皮下注射 RNAi敲低效率验证:Western blot和流式细胞术检测PTEN或CCR9表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立时空特异性调控PTEN表达的RNAi小鼠模型,并验证敲低效率及可逆性。
将针对Pten的shRNA(shPten.1522)通过RMCE靶向Col1a1位点,获得Tet应答元件调控的转基因小鼠;与Vav-tTA等品系杂交,通过Dox调控shRNA表达;用Western blot和流式细胞术验证PTEN敲低及AKT磷酸化变化。
确定造血系统PTEN敲低是否导致白血病,并表征其免疫表型和遗传特征。
Vav-tTA;shPten小鼠在Dox撤离后表达shRNA,观察胸腺增生和T-ALL发生;通过流式细胞术分析CD4/CD8双阳性T细胞;通过Western blot检测PTEN和pAKT;通过核型分析、CGH、Notch1测序和TCRβ克隆性分析肿瘤遗传特征。
探究在已形成的白血病中重新激活PTEN是否影响肿瘤维持和播散。
将原发shPten T-ALL细胞(1×10^5)尾静脉注射到亚致死量照射的Rag1−/−或NCR小鼠;待外周血EGFP+细胞>5%后给予Dox饲料关闭shRNA,重新激活PTEN;监测生存期、外周血和器官浸润;通过IHC、流式细胞术、MRI和PET成像评估肿瘤负荷和PI3K信号。
验证CCL25-CCR9趋化因子信号是否介导PTEN缺失白血病细胞的肠道播散和存活。
检测shPten白血病细胞表面CCR9表达;体外用CCL25刺激并检测AKT和S6磷酸化及迁移;通过shRNA敲低CCR9(shCcr9)进行体内竞争实验;使用CCR9小分子抑制剂CCX8037处理移植小鼠,评估肠道浸润。
评估PTEN表达水平与人类T细胞恶性肿瘤播散和预后的关联。
对31例T-ALL患者骨髓样本进行PTEN免疫组化;对84例T细胞淋巴瘤组织芯片进行PTEN免疫组化;结合公开的T-ALL基因表达和临床数据(GSE28703)分析PTEN状态与生存的关系;使用Fisher精确检验分析PTEN表达与播散的关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | PTEN抗体 | Cell Signaling Technology | 9188 |
| 磷酸化AKT(S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 磷酸化AKT(T308)抗体 | Cell Signaling Technology | 2965 | |
| Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| S6抗体 | Cell Signaling Technology | 2317 | |
| 磷酸化S6(S235/236)抗体 | Cell Signaling Technology | 4858 | |
| 剪切型Notch1抗体 | Cell Signaling Technology | 4147 | |
| Erk(p44/42 MAPK)抗体 | Cell Signaling Technology | 4696 | |
| 磷酸化Erk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 流式分析 | Pacific-Blue偶联磷酸化S6抗体 | Cell Signaling Technology | 8520 |
| CD3抗体 | BioLegend | -- | |
| CD4抗体 | BioLegend | -- | |
| CD8抗体 | BioLegend | -- | |
| Thy1.2抗体 | BioLegend | -- | |
| CD45抗体 | BioLegend | -- | |
| CCR9抗体 | BioLegend | -- | |
| CD11b抗体 | BioLegend | -- | |
| Gr-1抗体 | BioLegend | -- | |
| CD44抗体 | BioLegend | -- | |
| CD25抗体 | BioLegend | -- | |
| 免疫组化 | PTEN抗体 | Cell Signaling Technology | 9559 |
| GFP抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| PTEN抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化AKT(S473)抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化S6抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 剪切型Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| Ki67抗体 | Vector Laboratories | VP-K451 | |
| CD3抗体 | DAKO | A0452 | |
| 流式分析 | Alexa647偶联CCR9抗体 | eBiosciences | -- |
| 细胞培养 | 含L-谷氨酰胺的RPMI-1640培养基 | PAA | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 巯基乙醇 | -- | -- | |
| 人白细胞介素2 | -- | -- | |
| 刀豆蛋白A | -- | -- | |
| M-FISH | 21X小鼠mFISH探针试剂盒 | MetaSystems | -- |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche Diagnostics | -- |
| Bradford蛋白测定试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| Odyssey扫描仪 | Licor | -- | |
| 流式分析 | Guava easyCyte流式细胞仪 | Millipore | -- |
| LSRII流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- | |
| 流式分选 | FACSAria II流式细胞分选仪 | Becton Dickinson | -- |
| ELISA | Ccl25 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| 迁移实验 | Boyden小室插入物(8 μm孔径) | Greiner Bio-One | -- |
| 重组Ccl25 | R&D Systems | -- | |
| 动物实验 | 含多西环素饲料(625 mg/kg) | Harlan Teklad | -- |
| CCX8037 | Chemocentryx | -- | |
| PET成像 | 18F-氟脱氧葡萄糖 | -- | -- |
| Focus 120 microPET | Siemens | -- | |
| Inveon MicroPET/CT | Siemens | -- | |
| MRI | 9.4T/20 MRI仪器 | Bruker Biospin | -- |
| RNA-seq | TruSeq RNA样本制备试剂盒v2 | Illumina | -- |
| HiSeq2000测序仪 | Illumina | -- | |
| Agilent RNA 6000 Nano芯片 | Agilent Technologies | -- | |
| Qubit 2.0荧光定量仪 | Life Technologies | -- | |
| Kappa文库qPCR试剂盒 | Kappa Biosystems | -- | |
| CGH | Agilent 244k小鼠全基因组芯片 | Agilent | -- |
| 组织学 | Pannoramic Scan 250 Flash扫描仪 | 3DHistech | -- |
| Pannoramic Viewer 1.15.2软件 | 3DHistech | -- | |
| Zeiss Axio Imager.Z2显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 移植实验 | 移植细胞数量(1×10^5)、受体小鼠类型(Rag1−/−或NCR nude)、亚致死照射剂量(450 rad) 阅读提示:参见Methods“Transplantation experiments”部分 |
| Dox诱导/撤销实验 | Dox给药方式(含625 mg/kg多西环素的饲料)、开始时间(根据实验设计在移植后或不同时间点) 阅读提示:参见Methods“ES cell targeting and generation of transgenic mice”及“Transplantation experiments”部分 |
| CCL25刺激实验 | CCL25浓度(500 ng/ml)、刺激时间(15分钟或4小时)、细胞类型(小鼠shPten T-ALL或人T-ALL细胞系) 阅读提示:参见Methods“Western blotting, flow cytometry and antibodies”及“Transwell migration assay”部分 |
| CCR9抑制剂处理 | CCX8037剂量(30 mg/kg)、给药途径(皮下注射)、频率(每12小时) 阅读提示:参见Methods“CCR9 inhibitor treatment”部分 |
| shRNA竞争实验 | shCcr9序列(shCcr9.904和shCcr9.2357)、转导效率、移植细胞数(约0.75×10^6)、分析时间点(移植后12天) 阅读提示:参见Methods“shCcr9 hairpin design and competition experiments”部分 |
| 患者样本免疫组化 | PTEN抗体稀释度(1:30)、评分标准(0,1,2)、样本来源(31例T-ALL和84例T细胞淋巴瘤) 阅读提示:参见Methods“Analysis of human T-ALL and PTCL patient samples”部分 |