建立KRAS抑制剂诱导的微小残留病模型
模拟KRAS抑制剂治疗后肿瘤消退但残留细胞导致复发的临床场景,用于筛选联合免疫治疗。
将6694c2 PDAC细胞原位接种至C57BL/6小鼠胰腺,待肿瘤建立后每日两次腹腔注射MRTX1133持续17天,监测肿瘤消退和复发。
CD4 T cells convert transient responses to KRAS inhibition to durable remissions in pancreatic cancer.
包含体外细胞实验、多种基因敲除小鼠肿瘤模型、单细胞转录组和TCR克隆分析、人PDAC样本离体培养,具备功能与机制验证。
6694c2小鼠PDAC细胞系原位移植C57BL/6小鼠模型 KPC_3587和YAP扩增KPC类器官原位移植模型 KCP.1小鼠肺癌细胞皮下移植模型 人PDAC患者来源PBMC和手术切除肿瘤样本离体培养
MRTX1133剂量30 mg/kg腹腔注射每日两次,治疗17天 21h10剂量15 μg/只腹腔注射每日一次,治疗17天 CD4或CD8耗竭抗体150 μg/只每3天一次 IFNγ中和抗体150 μg/只用于清除实验 人CD4 T细胞体外刺激使用10 nM 21h10或对照蛋白21AT36
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟KRAS抑制剂治疗后肿瘤消退但残留细胞导致复发的临床场景,用于筛选联合免疫治疗。
将6694c2 PDAC细胞原位接种至C57BL/6小鼠胰腺,待肿瘤建立后每日两次腹腔注射MRTX1133持续17天,监测肿瘤消退和复发。
比较不同免疫治疗与KRAS抑制剂联合能否防止肿瘤复发并延长生存。
在MRTX1133治疗窗口内联合给予检查点阻断抗体(αPD-1、αPD-1/αLAG3、αCTLA-4)、TLR7激动剂、cIAP1/2拮抗剂LCL161、IL-2/15模拟物Neo2/15或IL-21模拟物21h10,监测生存。
确定21h10联合MRTX1133是否诱导持久缓解,并明确CD4、CD8、NK细胞和IFNγ在其中的作用。
在6694c2原位模型中联合使用MRTX1133和21h10,部分小鼠在无瘤后使用耗竭抗体清除CD4、CD8、NK1.1和IFNγ,监测生存;另在YAP扩增MRTX1133耐药模型和KCP.1肺癌模型中测试联合疗效。
揭示21h10联合MRTX1133对肿瘤免疫微环境的改变及T细胞克隆扩增特征。
对原位6694c2肿瘤小鼠给予MRTX1133、21h10或联合治疗6天,分选CD45+肿瘤浸润细胞进行scRNA-seq和TCR测序,并用流式验证T细胞亚群和Treg频率。
确定21h10联合治疗诱导持久缓解所依赖的免疫细胞亚群和效应分子。
在治疗期间使用CD4或CD8耗竭抗体,或使用Batf3−/−(cDC1缺陷)、Δ1+2+3(cDC2缺陷)、Tbx21−/−、Ifng−/−、Ifngr1−/−及巨噬细胞特异性Ifngr1缺失小鼠,评估生存和肿瘤控制。
检验CD8 T细胞或CD4 T细胞是否通过直接识别肿瘤细胞MHC分子杀伤肿瘤。
使用β2m−/−(MHC I类缺陷)或Ciita−/−(MHC II类缺陷)6694c2细胞原位接种,给予联合治疗并监测生存。
明确IFNγ下游效应细胞及巨噬细胞吞噬功能在肿瘤清除中的作用。
检测Ifngr1−/−小鼠肿瘤中巨噬细胞表型,使用巨噬细胞特异性Ifngr1缺失小鼠评估生存;体外将活化CD4 T细胞、BMDM和荧光标记6694c2细胞共培养,流式检测吞噬。
评估21h10能否激活人PDAC患者来源的CD4 T细胞和肿瘤浸润T细胞。
从初治PDAC患者外周血分离CD4 T细胞,抗CD3/CD28刺激并加入21h10或对照蛋白21AT36,检测IFNγ分泌;将手术切除PDAC组织酶解后短期培养,加入21h10或21AT36,scRNA-seq分析IFNG表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | MRTX1133 | Mirati Therapeutics and Bristol Myers Squibb | 2621928-55-8 |
| 阿达格拉西布 | Mirati Therapeutics and Bristol Myers Squibb | 2326521-71-3 | |
| RMC-6236 | MedchemExpress | HY-148439 | |
| Captisol | Cydex Pharmaceuticals A Ligand Company | RC-0C7-100 | |
| 柠檬酸盐缓冲液 | Teknova | Q2443 | |
| 吉西他滨 | NovaPlus | 00409-0182-01 | |
| 白蛋白结合型紫杉醇 | Celgene | 68817-134-50 | |
| TLR7激动剂(咪喹莫特) | MedChemExpress | HY-B0180 | |
| LCL161 | MedChemExpress | HY-15518 | |
| 氟尿嘧啶 | Fresenius Kabi | 63323-117-59 | |
| 奥沙利铂 | Sandoz | 00781-3315-70 | |
| 亚叶酸钙注射液 | Fresenius Kabi | 63323-710-50 | |
| 盐酸伊立替康注射液 | Hikma | 0143-9702-01 | |
| 粒细胞集落刺激因子(非格司亭) | Neupogen | 55513-924-91 | |
| 细胞培养 | RPMI培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| MEM非必需氨基酸 | -- | -- | |
| GlutaMAX | Gibco | 35050061 | |
| β-巯基乙醇 | Sigma-Aldrich | M3148 | |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| 组织消化 | 胶原酶P | Roche | 11249002001 |
| 中性蛋白酶 | Gibco | 17105041 | |
| DNA酶I | Roche | 10104159001 | |
| 流式分析 | 抗CD45抗体[30-F11] | Biolegend | -- |
| 抗CD4抗体[RM4-5] | Biolegend | -- | |
| 抗CD8抗体[53-6.7] | Biolegend | -- | |
| 抗F4/80抗体[BM8] | Biolegend | -- | |
| 抗IFNγ抗体[XMG1.2] | Biolegend | -- | |
| Western blot | 抗磷酸化STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9167S |
| 抗STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 11994S | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9145S | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 12640S | |
| 抗磷酸化STAT5抗体 | Cell Signaling Technology | 9359S | |
| 抗STAT5抗体 | Cell Signaling Technology | 94205S | |
| T细胞刺激 | PMA离子霉素混合物 | eBioscience | 00-4970-93 |
| 布雷菲德菌素A | eBioscience | 00-4506-51 | |
| 细胞分离 | EasySep小鼠CD4+ T细胞分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19825 |
| STEMCELL EasySep CD90.2正选试剂盒 | STEMCELL | 18951 | |
| EasySep人CD4+ T细胞分离试剂盒 | StemCell | 17952 | |
| 细胞因子检测 | 人IFNγ ELISA MAX Deluxe试剂盒 | BioLegend | 430104 |
| 小鼠细胞因子/趋化因子68重检测阵列 | Eve technologies | -- | |
| 人细胞因子/趋化因子96重检测阵列 | Eve technologies | -- | |
| 单细胞测序 | Chromium Next GEM单细胞5' GEM试剂盒v2 | 10x Genomics | PN-1000244 |
| Chromium Next GEM单细胞5' GEM试剂盒v2微珠 | 10x Genomics | PN-1000264 | |
| 文库构建试剂盒 | 10x Genomics | PN-1000190 | |
| 5'特征条形码试剂盒 | 10x Genomics | PN-1000256 | |
| 单细胞K芯片 | 10x Genomics | PN-2000182 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| KRAS抑制剂诱导的微小残留病模型建立 | 细胞接种数量、接种部位、MRTX1133剂量与给药频率、治疗起始时间、治疗持续时间 阅读提示:Figure 1A图注;STAR Methods中Orthotopic tumors和Agents used for in vivo dosing小节 |
| 21h10联合治疗体内疗效评估 | 21h10剂量、给药途径、给药频率、治疗窗口;生存终点定义;TNF阻断的使用 阅读提示:Figure 1C-D、4A-B图注;STAR Methods中Agents used for in vivo dosing小节 |
| 免疫细胞耗竭实验 | 耗竭抗体种类、剂量、给药频率和起始时间;耗竭验证方法 阅读提示:Figure 4A-B图注;STAR Methods中Agents used for in vivo dosing和Tumor infiltrate analysis for flow cytometry小节 |
| 单细胞转录组和TCR克隆分析 | 治疗时长、每组小鼠数量、CD45+细胞富集方法、scRNA-seq平台和数据分析流程 阅读提示:Figure 2A图注;STAR Methods中Single-cell RNA-sequencing preparation和pre-processing小节 |
| 人PDAC样本离体培养 | 患者来源和初治状态、组织消化方法、21h10浓度和处理时间、IL-2使用条件 阅读提示:Figure 6A和6D图注;STAR Methods中Human PDAC peripheral blood samples and ex vivo cultures小节 |
| 体外吞噬实验 | BMDM分化方案、CD4 T细胞活化条件、21h10浓度、共培养时间和吞噬检测方法 阅读提示:Figure 5I-J图注;STAR Methods中In vitro phagocytosis小节 |