脂肪细胞TBK1表达与ATKO小鼠构建
确认HFD是否诱导脂肪细胞TBK1表达并建立脂肪细胞特异性敲除模型。
检测HFD与ND喂养小鼠成熟脂肪细胞Tbk1表达;将Tbk1fl/fl小鼠与adiponectin-Cre小鼠杂交获得ATKO小鼠,检测eWAT、iWAT和肝脏Tbk1表达。
TBK1 at the Crossroads of Inflammation and Energy Homeostasis in Adipose Tissue.
含脂肪细胞特异性TBK1/AMPK/ULK1敲除小鼠体内实验、原代脂肪细胞及MEFs体外实验,并有磷酸化位点、激酶实验和NIK敲除机制验证
高脂饮食喂养的脂肪细胞特异性TBK1敲除(ATKO)小鼠 3T3-L1脂肪细胞 原代脂肪细胞(Flox与ATKO) HEK293T细胞及MEFs
ATKO小鼠eWAT和iWAT中Tbk1 mRNA降低>50%,肝脏无变化 HFD喂养16周Flox与ATKO小鼠的OCR与能量消耗 TNFα(10nM)处理脂肪细胞后AMPK Thr172磷酸化变化 AMPKα1 Ser459和Ser476为TBK1磷酸化位点,SS/AA与SS/DD突变体对Thr172磷酸化的影响 AICAR(500μM或500mg/kg)经ULK1诱导TBK1 Ser172磷酸化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认HFD是否诱导脂肪细胞TBK1表达并建立脂肪细胞特异性敲除模型。
检测HFD与ND喂养小鼠成熟脂肪细胞Tbk1表达;将Tbk1fl/fl小鼠与adiponectin-Cre小鼠杂交获得ATKO小鼠,检测eWAT、iWAT和肝脏Tbk1表达。
验证脂肪细胞TBK1缺失对体重、脂肪含量和能量消耗的影响。
对HFD喂养16周Flox与ATKO小鼠进行DEXA扫描、称量体重和组织重量、CLAMs间接测热测定OCR和EE。
探究TBK1缺失增加能量消耗是否由AMPK活性升高和线粒体生物合成增强介导。
检测脂肪细胞大小、ex vivo OCR、线粒体生物合成基因表达、MitoTracker染色、NAD/NADH比值及AMPK Thr172磷酸化;用TNFα处理3T3-L1和原代脂肪细胞检测AMPK磷酸化。
确定TBK1是否直接磷酸化AMPKα并抑制其活性。
在HEK293T细胞共表达TBK1 WT或K38A与AMPKα1,免疫共沉淀和λ磷酸酶处理;LC-MS/MS鉴定磷酸化位点;构建SS/AA和SS/DD突变体检测Thr172磷酸化。
验证AMPK激活是否通过ULK1磷酸化TBK1 Ser172。
用AICAR处理WT与AMPKα1/α2 KO MEFs、3T3-L1及ULK1 KO MEFs;使用compound C、Amlexanox、Oxozeaenol、SBI-0206965预处理;体内注射AICAR于AMPK AKO和ULK1 AKO小鼠;体外激酶实验检测ULK1磷酸化TBK1。
检测脂肪细胞TBK1缺失对HFD诱导的葡萄糖稳态和胰岛素敏感性的影响。
进行GTT、ITT、体内2-[C14]-脱氧葡萄糖摄取和胰岛素刺激Akt磷酸化检测。
探究TBK1缺失加重胰岛素抵抗是否与脂肪组织炎症和NFκB激活增强相关。
检测巨噬细胞标志基因、H&E和F4/80染色、SVF流式分析、Ccl2和Tnfa表达;检测p52、p105磷酸化及NIK敲除对NFκB激活和Ccl2表达的影响。
验证TBK1是否介导AMPK激活对NFκB的抑制作用。
在3T3-L1、原代脂肪细胞及TBK1 KO MEFs中先用AICAR预处理再以TNFα刺激,检测p105、IKKα/β磷酸化和Ccl2表达;在TBK1 KO MEFs中回补TBK1。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞处理 | 重组小鼠TNFα | Thermo Scientific | PMC3014 |
| 氨来呫诺 | Abcam | ab142825 | |
| 细胞与动物处理 | AICAR | Cell Signaling Technology | 9944 |
| 细胞处理 | Compound C | Calbiochem | 171260 |
| SBI-0206965 | Sigma-Aldrich | SML1540 | |
| 5Z-7-Oxozeaenol | Sigma-Aldrich | O9890 | |
| 蛋白降解检测 | MG132 | Sigma-Aldrich | M8699 |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L4391 |
| 蛋白提取 | 蛋白酶抑制剂片 | Sigma-Aldrich | 11873580001 |
| 体内葡萄糖摄取 | 2-[C14]-脱氧葡萄糖 | PerkinElmer | NEC720A250UC |
| 体外激酶实验 | ULK1活性激酶 | Signal Chem | U01-11G-10 |
| Western blot | TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3013 |
| 磷酸化TBK1 Ser172抗体 | Cell Signaling Technology | 5483 | |
| AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2532 | |
| 磷酸化AMPKα Thr172抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| p100/p52抗体 | Cell Signaling Technology | 4882 | |
| 磷酸化IKKα/β抗体 | Cell Signaling Technology | 2078 | |
| p105抗体 | Cell Signaling Technology | 4717 | |
| 磷酸化p105 Ser933抗体 | Cell Signaling Technology | 4806 | |
| ULK1抗体 | Cell Signaling Technology | 8054 | |
| NIK抗体 | Cell Signaling Technology | 4994 | |
| ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 3662 | |
| 磷酸化ACC Ser79抗体 | Cell Signaling Technology | 3661 | |
| MAPK(Erk1/2)抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2146 | |
| 免疫沉淀与Western blot | Myc抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-40 |
| Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 血清胰岛素检测 | 超敏小鼠胰岛素ELISA试剂盒 | Crystal Chem | 90080 |
| 血清甘油三酯检测 | 甘油三酯液体试剂 | Pointe Scientific | T7532 |
| 血清非酯化脂肪酸检测 | NEFA-HR(2)检测 | Wako | 434-91795 434-91995 |
| cAMP测定 | 环磷酸腺苷XP检测试剂盒 | Cell Signaling Technology | 4339 |
| 离体脂解测定 | 游离甘油测定试剂盒 | Sigma-Aldrich | F6428 |
| 离体耗氧率测定 | 细胞外耗氧检测 | Abcam | ab197243 |
| NAD/NADH比值测定 | NAD/NADH检测试剂盒 | Abcam | ab65348 |
| AMP测定 | AMP-Glo检测 | Promega | V6930 |
| ADP测定 | ADP-Glo检测 | Promega | V5011 |
| ATP测定 | ENLITEN ATP检测 | Promega | PAFF2000 |
| 高脂饮食喂养 | 高脂饮食(45%千卡来自脂肪) | Research Diet, Inc. | D12451 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与饮食 | 小鼠品系为C57BL/6J雄性,6–8周龄开始HFD(45% kcal脂肪,D12451)喂养12–16周;Flox与KO为同窝同笼 阅读提示:STAR Methods中Animals小节 |
| 代谢表型检测 | CLAMs间接测热法和DEXA扫描;OCR和EE样本量N=5–6;检测时间点 阅读提示:Figure 1 legend及STAR Methods中Animals小节 |
| 细胞处理与AMPK磷酸化 | TNFα浓度10nM、处理时间(30min至8hr);低糖DMEM饥饿条件;AICAR浓度250–500μM及预处理7hrs 阅读提示:Figure 2、Figure 4、Figure 7 legends |
| 体内AICAR注射 | AICAR 500mg/kg腹腔注射45min;AMPKα1/α2 AKO和ULK1 AKO小鼠12–14周龄 阅读提示:Figure 4 legend及STAR Methods |
| 葡萄糖与胰岛素耐量试验 | HFD小鼠GTT葡萄糖1.2g/kg BW、ITT胰岛素1.2U/kg BW;HFD喂养12周;采血时间点15–120min 阅读提示:Figure 5 legend及STAR Methods中Glucose tolerance test和Insulin tolerance test小节 |
| 体内葡萄糖摄取 | 禁食16hrs;注射1.2g/kg葡萄糖、1U/kg胰岛素和180μCi/kg 2-[C14]-脱氧葡萄糖;60min取材 阅读提示:Figure 5 legend及STAR Methods中In vivo 2-[C14]-deoxyglucose uptake小节 |
| NFκB与NIK机制实验 | TNFα 10nM处理45min或5nM处理16hrs;NIK CRISPR/Cas9 gRNA序列;MG132处理条件 阅读提示:Figure 6 legend及STAR Methods中Generation of NIK knockout MEFs小节 |