实时成像建立隐孢子虫入侵过程
解析孢子子入侵宿主的动态形态学事件及宿主膜与肌动蛋白变化
用DIC和荧光显微镜记录C. parvum孢子子对HCT8细胞的入侵,使用GFP-PLCδ-PH标记宿主质膜、GFP-lifeact标记F-actin、TdTomato标记虫体胞质
Cryptosporidium rhoptry effector protein ROP1 injected during invasion targets the host cytoskeletal modulator LMO7.
包含活细胞成像、CRISPR/Cas9基因敲除、Y2H、免疫共沉淀、体外细胞感染及小鼠体内感染等多层独立证据与功能验证
C. parvum(Cryptosporidium parvum)孢子子及转基因虫株 HCT8人肠上皮细胞系及GFP-lifeact/GFP-PLCδ-PH报告细胞 Caco2极化肠上皮单层 ifnγ−/−小鼠和LMO7 KO小鼠体内感染模型
C. parvum oocysts经sodium taurodeoxycholate触发10分钟后加入宿主细胞 HCT8细胞在8孔microslide中培养至70%汇合度,37°C下DIC每500 ms成像 ROP1-HA虫株与LMO7 KO小鼠或C57BL/6 WT小鼠的体内感染分组 小鼠感染剂量(ROP1-HA vs ROP1 KO为6,000 oocysts;LMO7 KO vs WT为5,000 oocysts) 粪便nanoluciferase活性测定(AUC)每两天量化寄生虫负荷
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
解析孢子子入侵宿主的动态形态学事件及宿主膜与肌动蛋白变化
用DIC和荧光显微镜记录C. parvum孢子子对HCT8细胞的入侵,使用GFP-PLCδ-PH标记宿主质膜、GFP-lifeact标记F-actin、TdTomato标记虫体胞质
鉴定隐孢子虫棒状体bulb蛋白并验证其定位
结合培养物时间进程RT-PCR和体内外阶段RNAseq筛选候选基因,用CRISPR/Cas9在7个候选基因内源位点加C端3×HA标签,免疫荧光和免疫电镜验证定位
确定各棒状体蛋白入侵后靶向的宿主细胞区域
感染后2小时固定HCT8细胞,免疫荧光检测HA标签与VVL、actin等标志物的共定位
鉴定ROP1的宿主结合伙伴并验证互作
以ROP1 N端为诱饵筛选人结肠上皮细胞cDNA文库的Y2H,并用GFP-N-ROP1和LMO7抗体进行双向免疫共沉淀,结合共定位验证
确定ROP1和LMO7在感染中的功能后果
构建ROP1 KO虫株,体外生长试验比较;用LMO7 KO小鼠和C57BL/6 WT小鼠感染C. parvum,通过粪便nanoluciferase活性量化寄生虫负荷
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光/免疫电镜 | 抗HA抗体 | Cell Signaling | 3724S |
| 免疫电镜 | 抗HA抗体(克隆3F10) | Roche | 3F10 |
| 免疫荧光 | 抗ZO-1抗体 | Thermo Fisher | 33–9100 |
| 抗villin抗体 | Abcam | Ab130751 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Abcam | Ab7291 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Santa Cruz | SC8432 clone C-2 | |
| Western blot | 抗GFP抗体 | Invitrogen | A11122 |
| 免疫共沉淀/免疫荧光 | 抗LMO7抗体 | Santa Cruz | SC376807 |
| 免疫荧光 | 抗LMO7抗体 | Sigma | HPA020923 |
| 抗cp23抗体 | LS Bio | LS-C137378–100 | |
| 抗CpPRP1抗体 | Furio Spano laboratory | -- | |
| 抗LDH抗体 | Guan Zhu laboratory | -- | |
| 分子克隆 | 大肠杆菌GC5 | Genesee Scientific | 42–653 |
| EPEC感染实验 | 肠致病性大肠杆菌49–81 HSJ菌株 | Dieter Schifferli laboratory | -- |
| 粪便DNA提取 | 粪便/土壤微生物DNA快速提取试剂盒 | Zymo Research | D6010 |
| 免疫共沉淀 | GFP-trap磁珠 | chromotek | 90122001MA |
| Protein G Dynabeads | Invitrogen | 10004D | |
| 细胞转染 | 脂质体转染试剂 | Thermo Fisher | L3000015 |
| 免疫共沉淀 | BS3偶联缓冲液 | Thermo Fisher | 21580 |
| RNA提取 | RNeasy Plus迷你试剂盒 | Quiagen | 74134 |
| cDNA合成 | SuperScript IV第一链合成系统 | Thermo Fisher | 18091050 |
| 活细胞成像 | 8孔微型载玻片 | Ibidi | 80826 |
| 免疫荧光 | VVL-FITC凝集素 | Vector | FL1231 |
| 鬼笔环肽 | Thermo Fisher | A22287 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 活细胞视频成像入侵 | oocysts触发方式(sodium taurodeoxycholate 10分钟)、宿主细胞汇合度(70%)、成像温度37°C、DIC采集间隔500 ms 阅读提示:Methods “Video microscopy invasion”小节及Figure 1图注 |
| 棒状体蛋白CRISPR/Cas9标记 | 7个候选基因、C端3×HA标签、paromomycin筛选、虫株传代于ifnγ−/−小鼠 阅读提示:Methods “Generation of transgenic parasites”小节及Figure S1 |
| ROP1-LMO7免疫共沉淀 | 转染GFP或GFP-N-ROP1的HCT8细胞、GFP-trap或LMO7抗体-蛋白G磁珠、抗体稀释比例 阅读提示:Methods “Immunoprecipitation”小节及Figure 6b、6c图注 |
| ROP1 KO与LMO7 KO体内感染 | 感染剂量(ROP1-HA vs ROP1 KO为6,000 oocysts;LMO7 KO vs WT为5,000 oocysts)、每组小鼠数、抗IFNγ抗体剂量与时间点 阅读提示:Methods “Animal infections”小节及Figure 7d、7e图注 |
| 粪便荧光素酶负荷测定 | 粪便收集与nanoluciferase测定、AUC计算、独立生物学重复次数 阅读提示:Methods “Animal infections”和“P96 well plate growth assay”小节及Figure 7图注 |