PO-EVLPs的分离与表征
获得PO-EVLPs并明确其粒径、形态、组成和稳定性。
采用差速离心法从马齿苋中分离PO-EVLPs,通过NTA、TEM、TLC、SDS-PAGE、脂质组学、蛋白质组学和小RNA测序进行表征,并在模拟胃液和肠液中评估稳定性。
Portulaca oleracea L.-derived extracellular vesicle-like particles reprogram intestinal ILCs to alleviate inflammatory bowel disease and colitis-associated colorectal cancer
含体外细胞实验、肠道ILC分离培养、DSS及AOM/DSS小鼠模型、生物分布及双荧光素酶验证
DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 慢性结肠炎小鼠模型 AOM/DSS诱导的CAC小鼠模型 CT26细胞
DSS诱导UC模型:3% DSS饮水1周;慢性结肠炎:2% DSS饮水1周+2周恢复,共3个周期 CAC模型:腹腔注射10 mg/kg AOM后,2% DSS饮水1周+2周恢复,共3个周期 PO-EVLPs灌胃剂量:30和60 mg/kg,每日给药 miR159-y agomir腹腔注射剂量:500 pmol(低剂量)或1 nmol(高剂量) 双荧光素酶报告实验:HEK-293T细胞共转染TGFBR2 3′UTR野生型/突变型质粒与miR159-y mimic或阴性对照
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得PO-EVLPs并明确其粒径、形态、组成和稳定性。
采用差速离心法从马齿苋中分离PO-EVLPs,通过NTA、TEM、TLC、SDS-PAGE、脂质组学、蛋白质组学和小RNA测序进行表征,并在模拟胃液和肠液中评估稳定性。
验证PO-EVLPs对溃疡性结肠炎和慢性结肠炎的缓解作用及肠屏障修复能力。
建立DSS诱导的UC模型和慢性结肠炎模型,每日灌胃给予PO-EVLPs,检测疾病活动指数、体重、结肠病理、肠通透性、杯状细胞和Ki67等指标。
验证PO-EVLPs对结肠炎相关结直肠癌进展的抑制作用及安全性。
建立AOM/DSS诱导的CAC模型,每日灌胃PO-EVLPs,检测结肠长度、肿瘤数量、生存率、体重、组织病理及血清肝肾功能指标。
明确口服后PO-EVLPs在体内的组织分布及被肠道免疫细胞摄取的情况。
采用Cy7标记PO-EVLPs灌胃,在不同时间点进行活体成像和离体器官荧光成像;采用CFSE和PKH26标记PO-EVLPs,通过流式细胞术和共聚焦显微镜检测肠道免疫细胞摄取。
明确PO-EVLPs在UC和CAC模型中对ILC亚群组成的影响。
分离结肠固有层细胞,通过流式细胞术检测NK、ILC1、ILC2、ILC3和ILCreg比例;通过mIHC检测ILCreg。
验证ILC3来源的IL-22是否介导PO-EVLPs的肠屏障修复作用。
在PO-EVLPs治疗期间给予IL-22中和抗体,观察对疗效的影响,同型对照抗体作为对照。
验证PO-EVLPs通过下调TGFBR2抑制TGF-β信号通路,进而调控ILC表型可塑性。
对PO-EVLPs处理的肠道ILC进行RNA-seq和KEGG/GSEA分析;Western blot检测TGFBR2、Smad3和p-Smad3;分离结肠ILC,在体外用TGF-β和PO-EVLPs处理72 h,流式检测ILCreg分化和IL-22表达。
验证PO-EVLPs是否通过抑制TGF-β信号通路直接抑制结肠癌细胞增殖和迁移。
用不同浓度PO-EVLPs处理CT26细胞,通过MTT、Annexin V/PI凋亡、Western blot、免疫荧光、克隆形成、划痕愈合和Transwell实验检测细胞活力、凋亡、EMT标志物和迁移侵袭能力。
确定PO-EVLPs中抑制TGFBR2的关键活性成分并验证miR159-y与TGFBR2的靶向关系。
分离PO-EVLPs的脂质、蛋白、RNA和小分子组分,分别处理CT26细胞检测TGFBR2表达;对PO-EVLPs进行miRNA测序;将丰度前五的miRNA转染ILC筛选TGFBR2抑制因子;双荧光素酶报告验证miR159-y与TGFBR2 3′UTR结合;在ILC中转染miR159-y检测ILCreg分化。
验证miR159-y单独给药能否缓解结肠炎,以及抑制miR159-y是否削弱PO-EVLPs的疗效。
在结肠炎小鼠中腹腔注射miR159-y agomir,检测结肠长度、DAI、体重、HE染色、AB/PAS染色、肠屏障蛋白和ILC亚群;在PO-EVLPs治疗小鼠中注射miR159-y antagomir,观察对PO-EVLPs保护作用的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | 葡聚糖硫酸钠 | Yeasen | 60316ES76 |
| 氧化偶氮甲烷 | Sigma-Aldrich | A5486 | |
| 肠道通透性检测 | FITC-葡聚糖(分子量4000) | MCE | HY-128868A |
| Western blot | 山羊抗兔IgG(H+L)辣根过氧化物酶标记二抗 | Thermo Fisher Scientific | 31460 |
| ECL超敏化学发光底物试剂盒 | ABclonal | RM02867 | |
| 溶菌酶抗体 | ABclonal | A10972 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | ABclonal | A20798 | |
| 波形蛋白抗体 | ABclonal | A19607 | |
| N-钙黏蛋白抗体 | ABclonal | A19083 | |
| TGF-β受体II抗体 | ABclonal | A1415 | |
| 黏蛋白2抗体 | ABclonal | A4767 | |
| 磷酸化Smad3抗体 | ABclonal | AP0727 | |
| Smad3抗体 | Proteintech | 66516-1-Ig | |
| 免疫荧光 | CoraLite® Plus 488标记山羊抗兔重组二抗(H+L) | Proteintech | RGAR002 |
| CoraLite® Plus 594标记山羊抗小鼠重组二抗(H+L) | Proteintech | RGAM004 | |
| Western blot | Smad4抗体 | Proteintech | 83169-5-RR |
| 闭锁小带蛋白1抗体 | Proteintech | 82870-7-RR | |
| 闭合蛋白抗体 | Selleck | F22C23 | |
| ILC分离 | Percoll密度梯度介质 | GE Healthcare | -- |
| VIII型胶原酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | -- | |
| ILC分选 | EasySep™小鼠泛ILC富集试剂盒 | Stemcell | 19875 |
| 细胞培养 | 白细胞介素-23 | Gibco | -- |
| 白细胞介素-1β | Gibco | -- | |
| mIHC | 酪胺信号放大染料 | Servicebio | G1257-50T |
| HE染色 | 中性树胶封片剂 | Servicebio | G1003 |
| IHC | Ki67抗体 | Servicebio | GB151499-100 |
| 流式细胞术 | 可固定活性染料eFluor780 | eBioscience | 65-0865-14 |
| 抗CD16/32抗体 | eBioscience | 93 | |
| CD127抗体 | eBioscience | A7R34 | |
| CD45抗体 | eBioscience | 30-F11 | |
| NKp46抗体 | eBioscience | 29A1.4 | |
| CD3e抗体 | eBioscience | 145-2C11 | |
| CD8a抗体 | eBioscience | 53-6.7 | |
| CD19抗体 | eBioscience | 1D3 | |
| CD11b抗体 | eBioscience | M1/70 | |
| CD11c抗体 | eBioscience | N418 | |
| F4/80抗体 | eBioscience | BM8 | |
| TER-119抗体 | eBioscience | TER-119 | |
| Ly-6G抗体 | eBioscience | 1A8 | |
| Ly-6C抗体 | eBioscience | HK1.4 | |
| 芳香烃受体抗体 | eBioscience | 4MEJJ | |
| 细胞刺激混合物(含蛋白转运抑制剂,500×) | eBioscience | 00-4975 | |
| 细胞内固定和透化试剂盒 | eBioscience | 88-8824-00 | |
| 血清生化分析 | 丙氨酸氨基转移酶检测试剂盒 | njjcbio | C009-2-1 |
| 天冬氨酸氨基转移酶检测试剂盒 | njjcbio | C010-2-1 | |
| 血清肌酐检测试剂盒 | njjcbio | C011-2-1 | |
| 血尿素氮检测试剂盒 | njjcbio | C013-2-1 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine™ RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 13778100 |
| Lipofectamine™ 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 | |
| Opti-MEM减血清培养基 | Thermo Fisher Scientific | 31985070 | |
| 双荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 |
| 细胞摄取示踪 | PKH26荧光染料 | Umibio | UR52302 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| UC和慢性结肠炎模型构建及给药 | DSS浓度与周期、PO-EVLPs灌胃剂量(30和60 mg/kg)、给药频次(每日)、每组样本量(n=6) 阅读提示:Methods 2.2 Mouse model;Figure 2A图注 |
| CAC模型构建及给药 | AOM腹腔注射剂量(10 mg/kg)、DSS浓度(2%)与周期、PO-EVLPs灌胃剂量、实验总时长(70天)、生存监测样本量(n=10) 阅读提示:Methods 2.2 Mouse model;Figure 3A图注 |
| PO-EVLPs体内生物分布 | Cy7-PO-EVLPs灌胃剂量(30 mg/kg)、成像时间点(1、6、12、24 h)、DSS预处理方案 阅读提示:Methods 2.6 In vivo distribution of PO-EVLPs;Figure 4 |
| 结肠ILC分离与培养 | 胶原酶VIII和DNase I浓度(150 μg/mL)、消化时间(90 min)、Percoll密度梯度(40%和80%)、ILC培养基添加因子及浓度 阅读提示:Methods 2.9 ILC isolation;2.10 Intestinal lymphocyte sorting |
| ILC体外TGF-β和PO-EVLPs处理 | TGF-β浓度(文中未明确说明)、PO-EVLPs浓度(文中未明确说明)、处理时间(72 h)、流式检测指标 阅读提示:Figure 6G–I图注;Results 3.6 |
| miR159-y靶向TGFBR2验证 | TGFBR2 3′UTR野生型/突变型质粒构建、miR159-y mimic浓度(文中未明确说明)、共转染细胞(HEK-293T)、检测时间(48 h) 阅读提示:Methods 2.19 Dual-luciferase reporter assay;Figure 8D和E |
| miR159-y agomir体内治疗 | 给药剂量(500 pmol或1 nmol)、给药途径(腹腔注射)、给药频次和疗程(文中未明确说明)、每组样本量(n=6) 阅读提示:Results 3.8;Figure 8G–M图注 |
| PO-EVLPs组分活性筛选 | 组分提取方法、等效质量策略(35 mg PO-EVLPs对应17.5 mg/mL)、处理时间(24 h)、检测指标(TGFBR2蛋白表达) 阅读提示:Methods 2.20 Extraction of PO-EVLP components;Figure 8A |