巨噬细胞与癌症恶病质的相关性分析
探究巨噬细胞浸润与癌症恶病质之间的关联
分析TCGA等数据库免疫细胞比例与恶病质患病率及体重丢失的相关性;分析胰腺癌患者肿瘤组织CD68+细胞比例与恶病质的关系。
The crosstalk between macrophages and cancer cells potentiates pancreatic cancer cachexia.
包含体外细胞共培养、条件培养基处理、C2C12肌管、3D球体、多种小鼠模型(原位同种移植、Ccr2-/-、Clodronate处理)、患者样本IHC及机制验证(ChIP、荧光素酶报告基因、泛素化分析)。
KPC和AsPC-1胰腺癌细胞系 C2C12分化肌管 C57BL/6 WT和Ccr2-/-小鼠原位KPC同种移植模型 胰腺癌患者肿瘤和肌肉组织样本
巨噬细胞耗竭模型:Ccr2-/-小鼠和Clodronate处理小鼠,验证肌肉萎缩表型逆转 TWEAK非自主激活:共培养或条件培养基处理后检测肿瘤细胞TWEAK分泌和表达 CCL5/CCR5/TRAF6/NF-κB通路验证:敲低CCR5、使用p65抑制剂QNZ、ChIP和荧光素酶报告基因 TWEAK功能获得:在non-CAC细胞中过表达TWEAK,验证其恢复肌肉萎缩表型 患者样本验证:IHC检测肿瘤组织CD68和TWEAK表达及配对肌肉组织MuRF1表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究巨噬细胞浸润与癌症恶病质之间的关联
分析TCGA等数据库免疫细胞比例与恶病质患病率及体重丢失的相关性;分析胰腺癌患者肿瘤组织CD68+细胞比例与恶病质的关系。
验证巨噬细胞在胰腺癌诱导的肌肉萎缩中的作用
建立Ccr2-/-和Clodronate处理的巨噬细胞耗竭小鼠模型,接种KPC原位肿瘤,检测抓力、肌肉重量、肌纤维横截面积和肌肉萎缩标志物表达。
探究巨噬细胞是否通过TWEAK促进肌肉萎缩
共培养巨噬细胞与胰腺癌细胞,检测TWEAK表达和分泌;使用重组TWEAK处理C2C12肌管;在患者来源PDX细胞中验证;敲低TWEAK验证功能。
阐明巨噬细胞来源CCL5上调肿瘤细胞TWEAK的分子机制
检测共培养后巨噬细胞CCL5表达和分泌;重组CCL5处理肿瘤细胞;敲低CCR5;使用p65抑制剂QNZ;ChIP和荧光素酶报告基因验证p65结合TWEAK启动子;检测TRAF6 K63泛素化。
探究肿瘤细胞如何招募和重编程巨噬细胞
比较CAC和non-CAC肿瘤细胞的细胞因子表达;重组CCL2处理non-CAC细胞;检测巨噬细胞迁移和M2极化;条件培养基实验验证功能。
验证TWEAK在体内对肌肉萎缩的必要性
建立TWEAK过表达的non-CAC细胞系,接种WT和Ccr2-/-小鼠,检测抓力、肌肉重量和萎缩标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 小鼠TWEAK抗体 | R&D systems | AF1237 |
| TWEAK抗体 | Abcam | Ab37170 | |
| Atrogin-1抗体 | ECM Biosciences | AP2041 | |
| MuRF1抗体 | R&D systems | AF5366 | |
| ZXDC抗体 | Proteintech | 20530-1-AP | |
| TRAF6抗体 | Abcam | Ab40675 | |
| 磷酸化NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| RELB抗体 | Cell Signaling Technology | 10544 | |
| Immunohistochemistry | Pan-CK抗体 | Cell Signaling Technology | 4545 |
| CD68抗体 | Abcam | Ab53444 | |
| Flow cytometry | FITC抗CD45 | Biolegend | 157607 |
| PerCP Cy5.5抗Ly-6G | Biolegend | 127647 | |
| APC-Cy7抗F4/80 | Biolegend | 157315 | |
| APC抗CD86 | Biolegend | 105011 | |
| Brilliant抗CD4 | Biolegend | 100559 | |
| PE-Cy7抗CD3 | Biolegend | 100219 | |
| PE抗CD206(MMR) | Biolegend | 141705 | |
| PE抗CD8a | Bio-Rad | MCA609P647 | |
| PerCP抗CD11b | Thermo Fisher | 46-0112-80 | |
| PE抗CD192(CCR2) | Biolegend | 150609 | |
| Western blot | K63泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 5621 |
| FLAG抗体 | MBL | M185-3L | |
| UBE2O抗体 | Cell Signaling Technology | 83393 | |
| 小鼠CCR5抗体 | R&D systems | MAB6138 | |
| CCR5抗体 | R&D systems | MAB1802-SP | |
| CCL5抗体 | Cell Signaling Technology | 36467 | |
| VCL抗体 | Proteintech | 66305-1-Ig | |
| ACTB抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 细胞培养 | 重组小鼠CCL2蛋白 | R&D systems | 479-JE |
| 重组人CCL2/MCP1蛋白 | R&D systems | 279-MC | |
| 重组小鼠CCL5/RANTES蛋白 | R&D systems | 478-MR | |
| 重组人CCL5/RANTES蛋白 | R&D systems | 278-RN | |
| 重组小鼠TWEAK/TNFSF12蛋白 | R&D systems | 1237-TW | |
| 重组人TWEAK/TNFSF12蛋白 | R&D systems | 1090-TW | |
| 潮霉素B | Enzo Life Sciences | 31282-04-9 | |
| 细胞裂解 | ROCHE Complete™裂解液 | Millipore Sigma | 04719956001 |
| Roche蛋白酶抑制剂cOmplete™, Mini蛋白酶抑制剂混合物 | Millipore Sigma | 04693124001 | |
| Roche PhosSTOP™磷酸酶抑制剂 | Millipore Sigma | 4906837001 | |
| 细胞因子检测 | 细胞因子抗体芯片 | Abcam | Ab193660 |
| ChIP | Pierce™磁力ChIP试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26157 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| RNA提取 | PureLink™ RNA小量提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 12183018A |
| 凝胶回收 | PureLink™快速凝胶回收与PCR纯化组合试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | K220001 |
| ELISA | 人TWEAK ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | EHTNFSF12 |
| 小鼠TWEAK ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | EMTNFSF12 | |
| 小鼠RANTES ELISA试剂盒 | Raybiotech | ELM-RANTES-1 | |
| 人CCL2/MCP1 ELISA试剂盒 | Raybiotech | ELH-MCP1-1 | |
| 小鼠CCL2/MCP1 ELISA试剂盒 | Raybiotech | ELM-MCP1-1 | |
| RANTES小鼠即用型ELISA™试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | BMS6009INST |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 巨噬细胞耗竭小鼠模型 | 小鼠品系(C57BL/6 WT和Ccr2-/-)、肿瘤细胞接种量(3×10^5 KPC细胞)、接种部位(胰腺)、Clodronate给药方案(文中未明确说明剂量和频率)、检测时间点 阅读提示:Methods:Pancreatic cancer allograft mouse models;Figure 2 legend |
| 细胞共培养与条件培养基处理 | 巨噬细胞来源(THP-1或RAW264.7分化?文中未明确说明)、共培养比例、处理时间、条件培养基收集和施加方式 阅读提示:Results相关段落;Figure 3、4、6 legends |
| TWEAK和CCL5重组蛋白处理 | 重组蛋白浓度(CCL5 10 ng/mL,TWEAK文中未明确说明)、处理时间(CCL5 72小时,TWEAK 8小时) 阅读提示:Figure 3B、4D legend;Results相关段落 |
| NF-κB抑制剂QNZ处理 | QNZ浓度(10 μM)、处理时间(48小时) 阅读提示:Figure 4N legend |
| 患者样本IHC | 抗体稀释比例(TWEAK 1:100,CD68 1:200)、恶病质定义(体重丢失>10%为严重恶病质,<10%为较轻恶病质) 阅读提示:Methods:Immunohistochemical staining;Clinical samples |