验证RG7388通过p53依赖性方式诱导凋亡
确认MDM2抑制剂RG7388激活p53并诱导凋亡是否依赖野生型p53。
在p53野生型(MV-4-11、OCI-AML3、MOLM-13)、p53缺失(HL-60)和p53突变(KG1、THP1)AML细胞系中,用RG7388处理,通过Annexin V/PI流式检测凋亡,免疫印迹检测p53和MDM2;并用shRNA敲低p53验证。
Synthetic Lethality of Combined Bcl-2 Inhibition and p53 Activation in AML: Mechanisms and Superior Antileukemic Efficacy.
包含体外细胞系、患者原代样本及三种小鼠模型,并通过基因敲低/过表达和突变体进行功能与机制验证。
p53野生型AML细胞系MV-4-11、MOLM-13和OCI-AML3 ABT耐药细胞系MOLM-13-R和MV-4-11-R p53野生型AML患者原代样本 NSG小鼠AML异种移植模型(包括PDX模型)
细胞系及原代样本的p53状态(野生型、缺失或突变) ABT耐药细胞系的建立及Mcl-1表达水平 体内实验的给药剂量(ABT和RG均为100 mg/kg,每日口服灌胃)及分组(n=10/组) 联合用药的比例(如ABT:RG为1:1或3:1)及处理时间(48小时或24小时) 关键机制验证中使用的抑制剂浓度(如PD0325901 100 nM,CHIR-99021 1 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认MDM2抑制剂RG7388激活p53并诱导凋亡是否依赖野生型p53。
在p53野生型(MV-4-11、OCI-AML3、MOLM-13)、p53缺失(HL-60)和p53突变(KG1、THP1)AML细胞系中,用RG7388处理,通过Annexin V/PI流式检测凋亡,免疫印迹检测p53和MDM2;并用shRNA敲低p53验证。
获得对Bcl-2抑制剂ABT-199耐药的AML细胞,并探究Mcl-1在耐药中的作用。
将MOLM-13和MV-4-11细胞在递增浓度ABT-199中长期培养,获得耐药细胞(MOLM-13-R、MV-4-11-R);检测耐药细胞的Mcl-1表达;并通过过表达Mcl-1在亲本细胞中验证其耐药作用。
测试p53激活能否克服对Bcl-2抑制的耐药性。
在ABT耐药细胞(MOLM-13-R、MV-4-11-R、OCI-AML3)及Mcl-1过表达细胞中,用RG7388、ABT-199或联合处理,检测凋亡和活细胞数,计算联合指数(CI)。
在动物模型中验证联合治疗能否克服耐药并延长生存。
将荧光素酶标记的耐药细胞(MOLM-13-R、OCI-AML3)或患者原代细胞注射入NSG小鼠,待植入后随机分组,分别给予溶剂、ABT-199、RG7388或联合治疗,监测生物发光、组织病理和生存期。
阐明p53激活克服Mcl-1介导耐药的分子机制。
用RG7388处理OCI-AML3细胞,检测Mcl-1 mRNA和蛋白水平、磷酸化状态、泛素化;通过基因敲低/过表达ERK、GSK3及Mcl-1突变体(T163A、S159A)验证磷酸化位点的作用;使用MEK抑制剂(PD0325901、曲美替尼、比美替尼)、GSK3抑制剂(CHIR-99021、BIO-乙酰肟)和蛋白酶体抑制剂(硼替佐米、伊沙佐米)进行通路验证。
检验Bcl-2抑制能否将p53激活的细胞应答从G1期阻滞转向凋亡。
在OCI-AML3等细胞中,用RG7388、ABT-199或联合处理,通过流式同时检测凋亡(Annexin V+)和活细胞细胞周期(EdU/PI),并检测caspase-3、caspase-9和PARP-1切割。
在患者来源样本中验证联合治疗的协同作用。
对p53野生型原代AML样本进行RG7388、ABT-199或联合处理,检测凋亡;并将一例耐药患者样本植入NSG小鼠,进行体内联合治疗实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | RG7388(伊达努林) | Roche/Genentech | -- |
| ABT-199(维奈克拉) | AbbVie | -- | |
| A-1210477 | AbbVie | -- | |
| 流式分析 | Annexin V-FITC偶联物 | BD Biosciences | 556419 |
| Annexin V-APC偶联物 | BD Biosciences | 550474 | |
| Annexin V-Alexa Fluor 488偶联物 | Thermo Fisher | A13201 | |
| 动物实验 | D-荧光素萤火虫钾盐 | Gold Biotechnology | 115144-35-9 |
| 免疫印迹 | 蛋白酶/磷酸酶抑制剂混合物(100X) | Cell signaling | 5872 |
| 药物处理 | PD0325901 | Selleckchem | S1036 |
| 曲美替尼 | Selleckchem | S2673 | |
| 比美替尼 | Selleckchem | S7007 | |
| CHIR-99021 | Selleckchem | S1263 | |
| 硼替佐米 | Selleckchem | S1013 | |
| 伊沙佐米 | Selleckchem | S2180 | |
| BIO-乙酰肟 | Selleckchem | S7915 | |
| MK-2206 2HCl | Selleckchem | S1078 | |
| 流式分析 | CountBright绝对计数微球 | Thermo Fisher Scientific | C36950 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 流式分析 | FxCycle PI/RNase染色液 | Thermo Fisher | F10797 |
| 细胞增殖检测 | Click-iT EdU Alexa Fluor 647成像试剂盒 | Thermo Fisher | C10340 |
| 质粒构建 | Q5定点突变试剂盒 | New England BioLabs | E0554S |
| Q5热启动高保真2X预混液 | New England BioLabs | M0494S | |
| 转染 | jetPRIME通用转染试剂 | Polyplus | 114-15 |
| siRNA转染 | Accell siRNA递送培养基 | Dharmacon | B-005000-500 |
| 质粒提取 | QIAprep离心小量质粒提取试剂盒 | QIAGEN | 27104 |
| 凝胶回收 | Wizard SV凝胶和PCR纯化系统 | Promega | A9281 |
| 免疫印迹 | 小鼠单克隆抗p53抗体(克隆DO-1) | Santa Cruz Biotechnology | sc-126 |
| 小鼠单克隆抗MDM2抗体(克隆D-12) | Santa Cruz Biotechnology | sc-5304 | |
| 小鼠单克隆抗Bcl-2抗体(克隆C-2) | Santa Cruz Biotechnology | sc-7382 | |
| 兔多克隆抗Mcl-1抗体(克隆S-19) | Santa Cruz Biotechnology | sc-819 | |
| 兔多克隆抗Puma抗体(克隆H-136) | Santa Cruz Biotechnology | sc-28226 | |
| 小鼠单克隆抗ERK抗体(克隆D-2) | Santa Cruz Biotechnology | sc-1647 | |
| 小鼠单克隆抗N-Ras抗体(克隆F-155) | Santa Cruz Biotechnology | sc-31 | |
| 小鼠单克隆抗GSK3抗体(克隆0011-A) | Santa Cruz Biotechnology | sc-7291 | |
| 兔多克隆抗PARP-1抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| 兔多克隆抗Bim抗体 | Cell Signaling Technology | 2819 | |
| 兔单克隆抗Bak抗体(克隆D4E4) | Cell Signaling Technology | 12105 | |
| 兔单克隆抗切割caspase-3抗体(D175)(克隆5A1E) | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 小鼠单克隆抗caspase-9抗体(克隆C9) | Cell Signaling Technology | 9508 | |
| 兔单克隆抗pMcl-1 (T163)抗体(克隆D5M9D) | Cell Signaling Technology | 14765 | |
| 兔单克隆抗B-Raf抗体(克隆55C6) | Cell Signaling Technology | 9433 | |
| 兔多克隆抗pB-Raf (S445)抗体 | Cell Signaling Technology | 2696 | |
| 兔多克隆抗JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| 小鼠单克隆抗pJNK (T183Y185)抗体(克隆G9) | Cell Signaling Technology | 9255 | |
| 兔多克隆抗泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 3933 | |
| 兔单克隆抗pERK (T202/Y204)抗体(克隆D13.14.4E) | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 兔多克隆抗pMEK (S217/S221)抗体 | Cell Signaling Technology | 9121 | |
| 小鼠单克隆抗MEK抗体(克隆L38C12) | Cell Signaling Technology | 4694 | |
| 小鼠单克隆抗AKT抗体(克隆40D4) | Cell Signaling Technology | 2920 | |
| 兔多克隆抗pAKT (S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 兔单克隆抗pGSK3 (S21/S9)抗体(克隆D17D2) | Cell Signaling Technology | 8566 | |
| 小鼠单克隆抗Bax抗体(克隆2D2) | Sigma-Aldrich | B8554 | |
| 小鼠单克隆抗β-肌动蛋白抗体(克隆AC-74) | Sigma-Aldrich | A2228 | |
| 小鼠单克隆抗Noxa抗体(克隆114C307) | Abcam | ab13654 | |
| 兔多克隆抗pMcl-1 (S159)抗体 | Abcam | ab111574 | |
| 小鼠单克隆抗p21WAF1抗体(克隆EA10) | EMD Millipore | OP64 | |
| IRDye® 680RD驴抗兔IgG (H + L) | Li-COR Biosciences | 925-68073 | |
| IRDye® 800CW驴抗小鼠IgG (H + L) | Li-COR Biosciences | 925-32212 | |
| 免疫组织化学 | 小鼠单克隆抗人CD45抗体(克隆PD7/26 + 2B11) | DAKO | M0701 |
| 流式分析 | 小鼠单克隆抗人CD45-PE抗体(克隆HI30) | BD Biosciences | 555483 |
| 大鼠单克隆抗小鼠CD45-APC抗体(克隆30-F11) | BD Biosciences | 559864 | |
| Annexin V-FITC偶联物 | BD Biosciences | 556419 | |
| Annexin V-APC偶联物 | BD Biosciences | 550474 | |
| Annexin V-Alexa Fluor 488偶联物 | Thermo Fisher | A13201 | |
| 免疫沉淀 | Protein A/G plus琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Invitrogen | -- |
| 流式分析 | 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | 聚凝胺 | Chemicon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系与p53状态验证 | 使用的AML细胞系及其p53状态(MV-4-11、MOLM-13、OCI-AML3为p53野生型;HL-60为p53缺失;KG1、THP1为p53突变) 阅读提示:Methods“Cell Lines”部分及Figure 1D |
| ABT耐药细胞系的建立 | 起始ABT浓度(各细胞系IC50)、传代频率(每2天)、耐药阈值(IC50增加30倍以上) 阅读提示:Methods“Generation of ABT-Resistant Cells” |
| 体外药物联合处理 | ABT与RG的联合比例(1:1或3:1)、处理时间(48小时或24小时)、检测方法(Annexin V/PI流式) 阅读提示:Figure legends 2C、2D、3C、3D及Methods“Apoptosis, Live Cell Number, and IC50 Values” |
| 体内联合治疗实验 | 小鼠品系(NSG)、细胞接种量(文中未明确说明)、给药剂量(ABT 100 mg/kg,RG 100 mg/kg)、给药途径(口服灌胃)、分组大小(n=10/组,生存分析n=7) 阅读提示:Methods“Mice”及Figures 2E、3G、7C |
| 机制验证中的抑制剂处理 | PD0325901浓度(100 nM)、CHIR-99021浓度(1 μM)、BIO-乙酰肟浓度(1 μM)、处理时间(12或24小时) 阅读提示:Figure legends 5D、5H及Methods“Immunoblotting and Antibodies” |
| 原代AML样本处理 | 样本来源(外周血或骨髓)、排除标准(自发凋亡率>30%)、处理时间(48小时)、DMSO终浓度(<0.1%) 阅读提示:Methods“Patient Samples” |