筛选多靶点抑制剂
鉴定能同时抑制FLT3、BCR-ABL、JAK2和MAPK信号通路的小分子抑制剂
使用表达FLT3ITD、BCR-ABL或Jak2V617F的Ba/F3细胞进行细胞增殖筛选,从MAPK通路抑制剂库中鉴定出pluripotin。
Rational polypharmacological targeting of FLT3, JAK2, ABL, and ERK1 suppresses the adaptive resistance to FLT3 inhibitors in AML
包含体外细胞增殖与凋亡实验、分子对接建模、多种体内小鼠模型(细胞系异种移植、原代AML异种移植、FLT3ITD/Tet2敲除模型)及原代细胞功能验证(集落形成、干细胞富集),且含机制验证。
Ba/F3细胞系(表达FLT3ITD、BCR-ABL、JAK2V617F等) 人AML细胞系MOLM13、MV4-11 FLT3ITD/Tet2敲除小鼠AML模型 NSGS小鼠异种移植模型(细胞系及原代AML细胞)
pluripotin对FLT3、BCR-ABL、JAK2的IC50值(FLT3WT 7 nM, FLT3ITD 8 nM, BCR-ABL 12 nM, Jak2V617F 25 nM) 细胞增殖实验中药物处理时长(72小时)和细胞接种数(10000细胞/孔) 体内实验给药剂量(gilteritinib 30或100 mg/kg每日,pluripotin 15 mg/kg每日)和给药方式(腹腔注射) 原代AML细胞实验中的细胞因子组合(3因子或6因子)及浓度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能同时抑制FLT3、BCR-ABL、JAK2和MAPK信号通路的小分子抑制剂
使用表达FLT3ITD、BCR-ABL或Jak2V617F的Ba/F3细胞进行细胞增殖筛选,从MAPK通路抑制剂库中鉴定出pluripotin。
验证pluripotin对FLT3、ABL、JAK2激酶活性及下游信号(STAT5、ERK1/2)的抑制
用不同浓度pluripotin处理表达FLT3ITD、BCR-ABL、Jak2V617F的Ba/F3细胞,通过western blot检测磷酸化水平,并检测细胞凋亡。
评估pluripotin对RAS-MAPK、BCR-ABL和JAK2信号激活介导的耐药的抑制效果
在Ba/F3细胞或人AML细胞系中共表达FLT3ITD与RASG12V、RASQ61K、BCR-ABL或JAK2V617F,用pluripotin或gilteritinib处理,比较细胞增殖和信号通路抑制情况。
阐明pluripotin与FLT3、ABL、JAK2结合的结构基础
使用SwissDock将pluripotin对接到FLT3、ABL、JAK2的活性及非活性构象的ATP结合位点,分析结合模式。
验证pluripotin对FLT3看门突变F691L的敏感性及对激活环突变、BCR-ABL T315I、Jak2 L983F的耐药性
使用表达FLT3ITD gatekeeper突变F691L、激活环突变、BCR-ABLT315I和Jak2V617F/L983F的Ba/F3细胞进行增殖实验。
评估pluripotin在异种移植模型中对FLT3突变AML细胞系的疗效
将表达荧光素酶和cherry的MOLM13、MV4-11(含或不含RASG12V)细胞注射到NSGS小鼠尾静脉,用pluripotin或gilteritinib治疗,监测生存期和白血病负荷。
评估pluripotin在FLT3ITD/Tet2缺失驱动的原发AML小鼠模型中的疗效
将RosaCreERT2:Flt3ITD/ITD/Tet2fl/fl小鼠的骨髓细胞移植到致死照射的BoyJ小鼠中,用他莫昔芬删除Tet2诱导AML,然后用pluripotin或gilteritinib治疗,监测生存期和疾病进展。
评估pluripotin对患者来源的原代AML细胞的疗效
将原代AML细胞(AML1和AML4)注射到NSGS小鼠,用pluripotin或gilteritinib治疗,监测白血病负荷和生存期。
评估pluripotin对白血病干/祖细胞和正常干/祖细胞的不同作用
从小鼠骨髓分离Lin-细胞,从人骨髓或外周血分离CD34+细胞,用pluripotin或gilteritinib处理,通过流式细胞术检测凋亡、表面标记,并进行集落形成实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞因子处理 | 人白细胞介素-3 | -- | -- |
| 细胞活力检测 | WST-1试剂 | Takara Bio USA, Inc | -- |
| 凋亡检测 | 膜联蛋白V | BD Biosciences | -- |
| 碘化丙啶 | BD Biosciences | -- | |
| 流式分析 | FACSAria流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 蛋白质印迹 | 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | -- |
| SuperSignal West Dura超灵敏化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ChemiDoc Touch成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白检测 | 抗磷酸化FLT3抗体(#4577) | Cell Signaling Technology | 4577 |
| 抗FLT3抗体(#3462) | Cell Signaling Technology | 3462 | |
| 抗磷酸化MEK1/2抗体(#9121) | Cell Signaling Technology | 9121 | |
| 抗磷酸化Erk1/2抗体(#9106) | Cell Signaling Technology | 9106 | |
| 抗磷酸化Stat5抗体(#9359) | Cell Signaling Technology | 9359 | |
| 抗MEK1/2抗体(#9126) | Cell Signaling Technology | 9126 | |
| 抗Erk1/2抗体(#9102) | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| 抗Stat5抗体(#9363) | Cell Signaling Technology | 9363 | |
| 抗小鼠IgG辣根过氧化物酶偶联二抗 | GE Healthcare | -- | |
| 抗兔IgG辣根过氧化物酶偶联二抗 | GE Healthcare | -- | |
| β-肌动蛋白抗体(13E5)(#5125) | Cell Signaling Technology | 5125 | |
| 细胞分离 | 磁珠 | Miltenyi Biotec | -- |
| 原代细胞培养 | 无血清扩增培养基 | -- | -- |
| 集落形成实验 | Methocult半固体培养基 | STEMCELL Technology | -- |
| 动物模型 | NSG-SGM3(NSGS)小鼠 | Jackson Laboratories | -- |
| 分子克隆 | 快速点突变试剂盒 | Agilent | -- |
| 抑制剂处理 | Pluripotin(SC-1) | -- | -- |
| 吉瑞替尼 | -- | -- | |
| 鲁索替尼 | Chemietech Inc | -- | |
| 菲卓替尼 | Chemietech Inc | -- | |
| 莫洛替尼 | Chemietech Inc | -- | |
| 伊马替尼 | LC Chemicals | -- | |
| 尼洛替尼 | LC Chemicals | -- | |
| 奎扎替尼 | -- | -- | |
| 曲美替尼 | -- | -- | |
| 维奈克拉 | -- | -- | |
| 质粒构建 | pHAGE-NRAS质粒 | Addgene | -- |
| pHAGE-NRAS-Q61K质粒 | Addgene | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞增殖实验 | 细胞系(Ba/F3或人AML细胞系)、表达基因、细胞接种密度(10000细胞/孔)、药物处理时间(72小时) 阅读提示:Methods:Cell lines, Cell viability and western blotting assays |
| 蛋白质印迹 | 细胞裂解液成分、裂解方法(超声)、抗体稀释度、曝光条件 阅读提示:Methods:Cell viability and western blotting assays |
| 体内实验(细胞系异种移植) | 小鼠品系(NSGS)、细胞移植数量(1×10^6)、给药方案(gilteritinib 30 mg/kg或pluripotin 15 mg/kg每日腹腔)、治疗开始时间(移植后2天) 阅读提示:Methods:In vivo efficacy of pluripotin |
| 原发AML模型 | 供体小鼠基因型、受体小鼠处理(致死照射)、骨髓细胞移植数量(1×10^6)、他莫昔芬给药方案、药物剂量(gilteritinib 100 mg/kg或pluripotin 15 mg/kg每日)、治疗开始时间 阅读提示:Methods:In vivo efficacy of pluripotin in murine AML model |
| 原代AML异种移植 | 原代细胞数量(3×10^6)、受体小鼠(NSGS)、治疗开始时间(移植后3周)、药物剂量(gilteritinib 30 mg/kg或pluripotin 15 mg/kg每日) 阅读提示:Methods:In vivo xenograft of AML and treatment |
| 干细胞/祖细胞实验 | 细胞来源(小鼠Lin-或人CD34+)、细胞因子组合和浓度、药物浓度(pluripotin 0.1或1 μM, gilteritinib 1 μM)、培养时间(6天)、凋亡检测标记 阅读提示:Methods:Isolation of Lin- and CD34+ cells, ex vivo culture, and apoptotic assay |