XPO1抑制对SCLC免疫微环境的影响
评估XPO1抑制是否改变SCLC肿瘤免疫微环境,尤其是巨噬细胞亚群。
RP116同种移植瘤经selinexor或溶剂对照治疗,进行单细胞RNA-seq、IHC检测CD68和TREM2。
XPO1-mediated TRIM21 nuclear export reprograms TREM2+ macrophage polarization by targeting IRF3 to augment anti-PD-1 efficacy in small cell lung cancer.
包含体外共培养、小鼠同种移植/异种移植模型、患者样本IHC及多组学机制验证,涵盖功能与机制验证。
NCI-H1688(SCLC-A)和NCI-H1048(SCLC-P)细胞系 THP-1来源巨噬细胞及PBMC来源巨噬细胞 RP116小鼠SCLC同种移植模型(C57BL/6) NCI-H1688/NCI-H1048原位异种移植模型(BALB/c nude及人源化NCG-MHC I/II dKO小鼠) 98例SCLC患者组织样本及10例免疫治疗患者活检样本
细胞系XPO1表达水平及敲低/过表达效率验证(Western blot) THP-1来源巨噬细胞与SCLC细胞Transwell共培养24 h,检测CD86、CD206、TREM2表达 RP116同种移植瘤selinexor给药:5 mg/kg每周一次口服灌胃 抗PD-1抗体给药:200 μg/次,每3天腹腔注射 RNA-seq/ATAC-seq/ChIP-qPCR验证IRF3对TNFSF15启动子的转录调控
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估XPO1抑制是否改变SCLC肿瘤免疫微环境,尤其是巨噬细胞亚群。
RP116同种移植瘤经selinexor或溶剂对照治疗,进行单细胞RNA-seq、IHC检测CD68和TREM2。
验证肿瘤细胞XPO1是否直接驱动巨噬细胞向TREM2+表型极化。
构建XPO1敲低(NCI-H1688)和过表达(NCI-H1048)SCLC细胞,与THP-1来源或PBMC来源巨噬细胞Transwell共培养,检测CD86、CD206、TREM2。
确定XPO1下游关键细胞因子及IRF3对TNFSF15的转录调控。
RNA-seq、ATAC-seq、motif分析、双荧光素酶报告基因、ChIP-qPCR检测IRF3与TNFSF15启动子结合。
阐明XPO1如何通过TRIM21调控IRF3蛋白稳定性。
质谱鉴定XPO1互作蛋白,GST pull-down和Co-IP验证XPO1-TRIM21互作,免疫荧光和核质分离检测TRIM21定位,CHX chase和MG132处理检测IRF3降解,泛素化实验检测TRIM21对IRF3的K48连接泛素化。
验证XPO1缺失是否通过巨噬细胞依赖的IFN-γ-STAT1信号上调SCLC细胞MHC I。
单培养与巨噬细胞共培养比较MHC I表达,使用JAK1/2抑制剂ruxolitinib、IKK抑制剂BMS-345541和IFN-γ中和抗体处理,检测STAT1和NF-κB磷酸化。
评估XPO1抑制或敲低联合抗PD-1治疗的体内抗肿瘤效果及免疫重塑。
人源化原位模型(NCI-H1688细胞接种NCG-MHC I/II dKO小鼠重建人免疫细胞)和同种移植模型(RP116-luc细胞接种C57BL/6小鼠)分别给予selinexor或XPO1敲低联合抗PD-1抗体,监测肿瘤负荷、生存期及IHC检测免疫标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | -- |
| 氢化可的松 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 表皮生长因子 | Invitrogen | -- | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒 | Life Technologies | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 稳转细胞系构建 | 嘌呤霉素 | Solarbio | P8230 |
| 杀稻瘟菌素 | Solarbio | B9300 | |
| lentiCRISPR v2载体 | Addgene | -- | |
| 动物实验 | 塞利尼索 | MedChemExpress | HY-17536 |
| 抗PD-1抗体 | Bio X Cell | BE0188 | |
| 抗PD-1抗体 | Bio X Cell | BE0146 | |
| 单细胞RNA-seq | SeekOne DD单细胞3'文库构建试剂盒 | SeekGene | K00202 |
| VAHTS DNA纯化磁珠 | Vazyme | N411-01 | |
| Qubit荧光定量仪 | Thermo Fisher Scientific | Q33226 | |
| 生物片段分析仪 | Bioptic | Qsep400 | |
| 免疫组化 | PANO 7色免疫组化试剂盒 | Panovue | -- |
| Mantra定量病理成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 核质分离试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 78835 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| SYBR Green PCR预混液 | Takara | RR820 | |
| ELISA | 人TNFSF15 ELISA试剂盒 | Abcam | ab317779 |
| 人IL-10 ELISA试剂盒 | Invitrogen | 88-7106-88 | |
| 人TGF-β1 ELISA试剂盒 | Invitrogen | BMS249-4 | |
| 流式细胞术 | 可固定活性染料 | BioLegend | 423105 |
| 固定和透化溶液 | BD Biosciences | 554714 | |
| CytoFLEX LX流式细胞仪 | BECKMAN | -- | |
| 共培养 | 佛波酯 | -- | -- |
| PBMC来源巨噬细胞分化 | Ficoll-Paque密度梯度离心液 | -- | -- |
| CD14磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-050-201 | |
| 重组人M-CSF | Proteintech | 300-25 | |
| 共培养 | 抗人TNFSF15中和抗体 | BPS Bioscience | 101729 |
| 重组人TNFSF15蛋白 | MedChemExpress | HY-P701048 | |
| 芦可替尼 | MedChemExpress | HY-50856 | |
| BMS-345541 | MedChemExpress | HY-10519 | |
| T细胞共培养 | EasySep人CD8+ T细胞分离试剂盒 | StemCell Technologies | 19258 |
| 抗CD3抗体 | BioLegend | 317325 | |
| 抗CD28抗体 | BioLegend | 302933 | |
| 布雷非德菌素A | Invitrogen | 00-4506-51 | |
| 巨噬细胞分选 | 人Fc受体阻断剂 | BioLegend | 422302 |
| 抗人TREM2抗体 | R&D Systems | FAB17291A | |
| PE磁珠 | Invitrogen | 10003D | |
| 免疫荧光 | Alexa 488抗小鼠IgG | Invitrogen | -- |
| Alexa 594抗兔IgG | Invitrogen | -- | |
| 激光共聚焦显微镜 | KEYENCE | BZ-X800 | |
| ATAC-seq | 转座DNA缓冲液 | Illumina | 20034197 |
| TDE1转座DNA酶 | Illumina | 20034197 | |
| QIAquick PCR纯化试剂盒 | Qiagen | 28106 | |
| NEBNext Ultra II PCR预混液 | NEB | M0541S | |
| KAPA文库定量试剂盒 | Roche | KK4854 | |
| AMPure XP磁珠 | Beckman Coulter | A63881 | |
| 免疫共沉淀 | 细胞裂解试剂 | Sigma | C2978 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma | P8340 | |
| Dynabeads Protein A免疫沉淀试剂盒 | Invitrogen | 10006D | |
| 染色质免疫沉淀 | SimpleChIP试剂盒 | Thermo Scientific | 26157 |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| XPO1调控巨噬细胞极化的共培养实验 | SCLC细胞系选择(NCI-H1688敲低、NCI-H1048过表达)、巨噬细胞来源(THP-1或PBMC)、共培养时间24 h、Transwell孔径0.4 μm、PMA浓度150 nM、M-CSF浓度20 ng/mL 阅读提示:Methods 'Coculture assays'小节及Fig. 2b图注 |
| TNFSF15中和与重组蛋白回补实验 | TNFSF15中和抗体浓度100 ng/ml、重组人TNFSF15浓度1 μg/ml、处理时间 阅读提示:Methods 'Coculture assays'小节及Supplementary Fig. 5c–e、6a–c图注 |
| IRF3降解与泛素化机制实验 | CHX浓度与处理时间、MG132浓度、TRIM21敲低效率、Ub-K48R/K63R突变体使用 阅读提示:Methods 'Cell culture and transfection'及Fig. 4a–c、5g–j图注 |
| 体内联合治疗实验 | selinexor剂量5 mg/kg每周一次口服灌胃、抗PD-1抗体200 μg/次每3天腹腔注射、小鼠品系与数量(n=6/组)、随机化依据BLI信号 阅读提示:Methods 'SCLC allograft and xenograft mouse models'及Fig. 7a、Supplementary Fig. 12i图注 |
| 患者样本IHC与多重IHC分析 | 98例SCLC患者纳入标准(2008–2017年手术、无 prior 抗肿瘤治疗、年龄18–75岁)、10例免疫治疗患者(2021–2022年)、H-score cutoff值、ROI选择标准 阅读提示:Methods 'Patients and tissue samples'及'IHC and multiplex IHC'小节、Supplementary Table 1和3 |